MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 30200

< Previous12...2627282930313233343536...6061Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017560	ATAA	2	8	551305	551312	75 %	25 %	0 %	0 %	386082300
15002	NC_017560	CAT	2	6	551314	551319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082300
15003	NC_017560	TAA	2	6	551345	551350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082300
15004	NC_017560	CCG	2	6	551406	551411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386082300
15005	NC_017560	AAG	2	6	551413	551418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082300
15006	NC_017560	TAT	2	6	551486	551491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082300
15007	NC_017560	TAG	2	6	551517	551522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082300
15008	NC_017560	TTC	2	6	551531	551536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082300
15009	NC_017560	CTT	2	6	551560	551565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082300
15010	NC_017560	TA	3	6	551580	551585	50 %	50 %	0 %	0 %	386082300
15011	NC_017560	TAA	2	6	551598	551603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082300
15012	NC_017560	GCT	2	6	551607	551612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386082300
15013	NC_017560	TAAA	2	8	551642	551649	75 %	25 %	0 %	0 %	386082300
15014	NC_017560	AAT	2	6	551667	551672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082300
15015	NC_017560	CTA	2	6	551709	551714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082300
15016	NC_017560	TTTTAA	2	12	551750	551761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082300
15017	NC_017560	ATT	2	6	551765	551770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082300
15018	NC_017560	T	6	6	551800	551805	0 %	100 %	0 %	0 %	386082300
15019	NC_017560	A	8	8	551822	551829	100 %	0 %	0 %	0 %	386082300
15020	NC_017560	TA	3	6	551885	551890	50 %	50 %	0 %	0 %	386082300
15021	NC_017560	TAT	2	6	551902	551907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082300
15022	NC_017560	GAG	2	6	551926	551931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386082300
15023	NC_017560	GTA	2	6	551935	551940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082300
15024	NC_017560	TAAT	2	8	551956	551963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_017560	TATAT	2	10	551991	552000	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_017560	TA	3	6	552021	552026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15027	NC_017560	TGA	2	6	552048	552053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082301
15028	NC_017560	A	6	6	552056	552061	100 %	0 %	0 %	0 %	386082301
15029	NC_017560	GA	3	6	552082	552087	50 %	0 %	50 %	0 %	386082301
15030	NC_017560	TTG	2	6	552123	552128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386082301
15031	NC_017560	A	6	6	552134	552139	100 %	0 %	0 %	0 %	386082301
15032	NC_017560	CT	3	6	552152	552157	0 %	50 %	0 %	50 %	386082301
15033	NC_017560	TAC	2	6	552160	552165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082301
15034	NC_017560	GAA	2	6	552173	552178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082301
15035	NC_017560	AAT	2	6	552179	552184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082301
15036	NC_017560	AT	3	6	552190	552195	50 %	50 %	0 %	0 %	386082301
15037	NC_017560	A	6	6	552212	552217	100 %	0 %	0 %	0 %	386082301
15038	NC_017560	GAA	2	6	552362	552367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082301
15039	NC_017560	ATT	2	6	552389	552394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082301
15040	NC_017560	GAA	2	6	552401	552406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082301
15041	NC_017560	ATA	2	6	552420	552425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082301
15042	NC_017560	AATG	2	8	552472	552479	50 %	25 %	25 %	0 %	386082301
15043	NC_017560	ATT	2	6	552500	552505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082301
15044	NC_017560	AT	3	6	552558	552563	50 %	50 %	0 %	0 %	386082301
15045	NC_017560	AAACA	2	10	552591	552600	80 %	0 %	0 %	20 %	386082301
15046	NC_017560	TTA	2	6	552605	552610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082301
15047	NC_017560	GAA	2	6	552611	552616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082301
15048	NC_017560	ACT	2	6	552638	552643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082301
15049	NC_017560	TTA	2	6	552645	552650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082301
15050	NC_017560	GCAT	2	8	552688	552695	25 %	25 %	25 %	25 %	386082301
15051	NC_017560	CAA	2	6	552698	552703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386082301
15052	NC_017560	A	6	6	552723	552728	100 %	0 %	0 %	0 %	386082301
15053	NC_017560	ATT	3	9	552738	552746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082301
15054	NC_017560	TGA	2	6	552781	552786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082301
15055	NC_017560	A	7	7	552815	552821	100 %	0 %	0 %	0 %	386082301
15056	NC_017560	AAG	2	6	552843	552848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082301
15057	NC_017560	CTGAAT	2	12	552861	552872	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	386082301
15058	NC_017560	ATA	2	6	552969	552974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082301
15059	NC_017560	A	6	6	552999	553004	100 %	0 %	0 %	0 %	386082301
15060	NC_017560	TAT	2	6	553048	553053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082301
15061	NC_017560	TAT	2	6	553101	553106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082301
15062	NC_017560	CCA	2	6	553118	553123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386082301
15063	NC_017560	GAA	2	6	553170	553175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082301
15064	NC_017560	TGG	2	6	553195	553200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386082301
15065	NC_017560	TGC	2	6	553308	553313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386082301
15066	NC_017560	TGA	2	6	553315	553320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082301
15067	NC_017560	CTTG	2	8	553366	553373	0 %	50 %	25 %	25 %	386082301
15068	NC_017560	TGT	2	6	553444	553449	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386082301
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15070	NC_017560	GAA	2	6	553535	553540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082301
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15072	NC_017560	ATAG	2	8	553757	553764	50 %	25 %	25 %	0 %	386082301
15073	NC_017560	TAA	2	6	553765	553770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082301
15074	NC_017560	GAA	2	6	553775	553780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082301
15075	NC_017560	A	6	6	553793	553798	100 %	0 %	0 %	0 %	386082301
15076	NC_017560	AGA	2	6	553822	553827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082301
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15080	NC_017560	GCT	2	6	553967	553972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386082301
15081	NC_017560	GTT	2	6	553977	553982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386082301
15082	NC_017560	CAA	2	6	553995	554000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386082301
15083	NC_017560	CTG	2	6	554085	554090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386082301
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15087	NC_017560	ACC	2	6	554290	554295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386082301
15088	NC_017560	AATA	2	8	554374	554381	75 %	25 %	0 %	0 %	386082301
15089	NC_017560	TTA	2	6	554410	554415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_017560	GCAAAA	2	12	554422	554433	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15091	NC_017560	GTT	2	6	554459	554464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_017560	ATG	2	6	554518	554523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_017560	AT	3	6	554525	554530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_017560	ATA	2	6	554592	554597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_017560	TATC	2	8	554623	554630	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15096	NC_017560	TTA	2	6	554637	554642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_017560	T	6	6	554677	554682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_017560	A	6	6	554710	554715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_017560	T	6	6	554730	554735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_017560	TTAA	3	12	554785	554796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_017560	A	6	6	554822	554827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_017560	ATT	2	6	554838	554843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_017560	AAT	2	6	554851	554856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_017560	CATTAA	2	12	554861	554872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15105	NC_017560	TTA	2	6	554875	554880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15106	NC_017560	AT	3	6	554888	554893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15107	NC_017560	T	7	7	554899	554905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_017560	TTAA	2	8	554909	554916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_017560	TAT	2	6	554919	554924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_017560	ATTAAT	2	12	554926	554937	50 %	50 %	0 %	0 %	386082302
15111	NC_017560	A	6	6	554939	554944	100 %	0 %	0 %	0 %	386082302
15112	NC_017560	ATT	2	6	554992	554997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082302
15113	NC_017560	ATT	2	6	555023	555028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082302
15114	NC_017560	TAA	2	6	555031	555036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082302
15115	NC_017560	AGG	2	6	555073	555078	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386082302
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15117	NC_017560	TGG	2	6	555199	555204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386082302
15118	NC_017560	AAGT	2	8	555210	555217	50 %	25 %	25 %	0 %	386082302
15119	NC_017560	TAA	2	6	555292	555297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082302
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15121	NC_017560	TAA	2	6	555379	555384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082302
15122	NC_017560	ATA	2	6	555411	555416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082302
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15499	NC_017560	TAA	2	6	569702	569707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15500	NC_017560	TGA	2	6	569711	569716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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