MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 30200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017560	CAA	2	6	480475	480480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13002	NC_017560	AT	3	6	480489	480494	50 %	50 %	0 %	0 %	386082239
13003	NC_017560	ATTT	2	8	480514	480521	25 %	75 %	0 %	0 %	386082239
13004	NC_017560	T	6	6	480519	480524	0 %	100 %	0 %	0 %	386082239
13005	NC_017560	AAAT	2	8	480547	480554	75 %	25 %	0 %	0 %	386082239
13006	NC_017560	ACT	2	6	480624	480629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082239
13007	NC_017560	GAAAAA	2	12	480647	480658	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	386082239
13008	NC_017560	TCT	2	6	480693	480698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082239
13009	NC_017560	CT	3	6	480714	480719	0 %	50 %	0 %	50 %	386082239
13010	NC_017560	ATT	2	6	480768	480773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082239
13011	NC_017560	ATATA	2	10	480785	480794	60 %	40 %	0 %	0 %	386082239
13012	NC_017560	TA	3	6	480809	480814	50 %	50 %	0 %	0 %	386082239
13013	NC_017560	TAA	2	6	480838	480843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082239
13014	NC_017560	GAA	2	6	480867	480872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082239
13015	NC_017560	ATA	2	6	480873	480878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082239
13016	NC_017560	TATAA	2	10	480902	480911	60 %	40 %	0 %	0 %	386082239
13017	NC_017560	ATA	2	6	480927	480932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082239
13018	NC_017560	TAA	2	6	480937	480942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082239
13019	NC_017560	ACC	2	6	480968	480973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386082239
13020	NC_017560	A	8	8	480979	480986	100 %	0 %	0 %	0 %	386082239
13021	NC_017560	A	6	6	480992	480997	100 %	0 %	0 %	0 %	386082239
13022	NC_017560	ATT	2	6	481046	481051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13023	NC_017560	AATT	2	8	481067	481074	50 %	50 %	0 %	0 %	386082240
13024	NC_017560	TTTG	2	8	481082	481089	0 %	75 %	25 %	0 %	386082240
13025	NC_017560	TTA	2	6	481143	481148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082240
13026	NC_017560	TAG	2	6	481155	481160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082240
13027	NC_017560	GTA	2	6	481218	481223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082240
13028	NC_017560	CTA	2	6	481248	481253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082240
13029	NC_017560	GCA	2	6	481319	481324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386082240
13030	NC_017560	TGC	2	6	481327	481332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386082240
13031	NC_017560	TAA	2	6	481354	481359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082240
13032	NC_017560	AT	3	6	481379	481384	50 %	50 %	0 %	0 %	386082240
13033	NC_017560	TTAA	2	8	481400	481407	50 %	50 %	0 %	0 %	386082240
13034	NC_017560	AT	3	6	481414	481419	50 %	50 %	0 %	0 %	386082240
13035	NC_017560	AAG	2	6	481433	481438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386082240
13036	NC_017560	TAT	2	6	481453	481458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082240
13037	NC_017560	TGA	2	6	481498	481503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082240
13038	NC_017560	ATT	2	6	481523	481528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082240
13039	NC_017560	TAG	2	6	481548	481553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082240
13040	NC_017560	A	7	7	481562	481568	100 %	0 %	0 %	0 %	386082240
13041	NC_017560	ATT	2	6	481661	481666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082240
13042	NC_017560	TTA	2	6	481686	481691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082240
13043	NC_017560	TCA	2	6	481718	481723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082240
13044	NC_017560	TCC	2	6	481729	481734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386082240
13045	NC_017560	AGATAA	2	12	481738	481749	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	386082240
13046	NC_017560	A	6	6	481759	481764	100 %	0 %	0 %	0 %	386082240
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13050	NC_017560	TTTGT	2	10	481833	481842	0 %	80 %	20 %	0 %	386082240
13051	NC_017560	TAA	2	6	481864	481869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082240
13052	NC_017560	ACT	2	6	481895	481900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082240
13053	NC_017560	TGA	2	6	481963	481968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386082241
13054	NC_017560	T	6	6	482045	482050	0 %	100 %	0 %	0 %	386082241
13055	NC_017560	TTC	2	6	482076	482081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082241
13056	NC_017560	ATC	2	6	482088	482093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386082241
13057	NC_017560	AAT	2	6	482103	482108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082241
13058	NC_017560	ATCTT	2	10	482111	482120	20 %	60 %	0 %	20 %	386082241
13059	NC_017560	AT	3	6	482189	482194	50 %	50 %	0 %	0 %	386082241
13060	NC_017560	GTTT	2	8	482199	482206	0 %	75 %	25 %	0 %	386082241
13061	NC_017560	ATT	2	6	482239	482244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082241
13062	NC_017560	TAA	2	6	482270	482275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082241
13063	NC_017560	T	8	8	482284	482291	0 %	100 %	0 %	0 %	386082241
13064	NC_017560	AAT	2	6	482292	482297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082241
13065	NC_017560	TTAA	2	8	482318	482325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_017560	TTA	2	6	482373	482378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_017560	GTA	2	6	482388	482393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13069	NC_017560	TAA	2	6	482434	482439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_017560	T	6	6	482446	482451	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_017560	TCTATT	2	12	482472	482483	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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13073	NC_017560	TTA	2	6	482549	482554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_017560	ATT	2	6	482572	482577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_017560	GATA	2	8	482592	482599	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13078	NC_017560	GTTT	2	8	482641	482648	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13079	NC_017560	ATTT	2	8	482652	482659	25 %	75 %	0 %	0 %	386082242
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13089	NC_017560	TAT	2	6	483088	483093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386082242
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13107	NC_017560	CAAT	2	8	483694	483701	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13108	NC_017560	TAA	2	6	483706	483711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13109	NC_017560	AAT	2	6	483727	483732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13110	NC_017560	TAA	2	6	483738	483743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13111	NC_017560	AAT	2	6	483745	483750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_017560	ATTTAG	2	12	483759	483770	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_017560	A	7	7	483799	483805	100 %	0 %	0 %	0 %	386082243
13114	NC_017560	T	6	6	483816	483821	0 %	100 %	0 %	0 %	386082243
13115	NC_017560	TA	3	6	483827	483832	50 %	50 %	0 %	0 %	386082243
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