MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia prowazekii Rp22 chromosome

Total Repeats: 30200

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_017560	A	6	6	224962	224967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_017560	ATG	2	6	225008	225013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6003	NC_017560	AGT	2	6	225019	225024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6004	NC_017560	TTA	2	6	225041	225046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6005	NC_017560	TA	3	6	225064	225069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6006	NC_017560	TGT	2	6	225084	225089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6007	NC_017560	TGG	2	6	225090	225095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6008	NC_017560	AG	3	6	225198	225203	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_017560	TTTC	2	8	225305	225312	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6010	NC_017560	TTAT	2	8	225321	225328	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6011	NC_017560	TTA	2	6	225374	225379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6012	NC_017560	TAC	2	6	225387	225392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6013	NC_017560	TGG	2	6	225393	225398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_017560	TAT	2	6	225446	225451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6015	NC_017560	TGG	2	6	225453	225458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6016	NC_017560	A	6	6	225519	225524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_017560	TAA	2	6	225525	225530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_017560	AAT	2	6	225555	225560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_017560	TAAA	2	8	225578	225585	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_017560	CAT	2	6	225595	225600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6021	NC_017560	AT	3	6	225627	225632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6022	NC_017560	AAAT	2	8	225633	225640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6023	NC_017560	TAG	2	6	225648	225653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6024	NC_017560	ATT	2	6	225724	225729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6025	NC_017560	GGC	2	6	225755	225760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6026	NC_017560	ATT	2	6	225769	225774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_017560	A	6	6	225835	225840	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6028	NC_017560	ATG	2	6	225864	225869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6029	NC_017560	AAT	2	6	225875	225880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6030	NC_017560	GAT	2	6	225892	225897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6031	NC_017560	TGG	2	6	225904	225909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_017560	T	6	6	225917	225922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6033	NC_017560	GAT	2	6	225929	225934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_017560	TAA	2	6	225943	225948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6035	NC_017560	AGCGT	2	10	225974	225983	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6036	NC_017560	GTA	2	6	225996	226001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_017560	T	6	6	226022	226027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_017560	TGAAA	2	10	226066	226075	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_017560	TGA	2	6	226096	226101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_017560	TTA	2	6	226122	226127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6041	NC_017560	TTA	2	6	226171	226176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_017560	ATGAT	2	10	226215	226224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_017560	TTAT	2	8	226261	226268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_017560	AAT	2	6	226324	226329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_017560	ATA	2	6	226338	226343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_017560	A	6	6	226350	226355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_017560	CAT	2	6	226390	226395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6049	NC_017560	ATT	2	6	226433	226438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6050	NC_017560	AATCTT	2	12	226442	226453	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6051	NC_017560	ATTT	2	8	226504	226511	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6052	NC_017560	TGA	2	6	226534	226539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_017560	TGA	2	6	226549	226554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_017560	TAT	2	6	226593	226598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_017560	TTA	2	6	226611	226616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_017560	ATGTG	2	10	226618	226627	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6057	NC_017560	AAT	2	6	226682	226687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_017560	TAA	2	6	226691	226696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_017560	TTA	2	6	226715	226720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6060	NC_017560	TGA	2	6	226766	226771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_017560	TAT	2	6	226784	226789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_017560	AT	3	6	226825	226830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6063	NC_017560	GTA	2	6	226833	226838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_017560	TAAT	2	8	226858	226865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_017560	ATA	2	6	226889	226894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_017560	A	7	7	226916	226922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_017560	TAT	2	6	226933	226938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_017560	TAAT	2	8	226951	226958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_017560	ATG	2	6	226963	226968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6072	NC_017560	ATA	2	6	227014	227019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6078	NC_017560	TTA	2	6	227201	227206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6082	NC_017560	TAA	2	6	227252	227257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386082018
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6103	NC_017560	TCT	2	6	227861	227866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386082019
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6114	NC_017560	T	6	6	228257	228262	0 %	100 %	0 %	0 %	386082019
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6119	NC_017560	A	7	7	228358	228364	100 %	0 %	0 %	0 %	386082019
6120	NC_017560	A	7	7	228400	228406	100 %	0 %	0 %	0 %	386082019
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