MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 98333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_017559	CGG	2	6	648186	648191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408823
17503	NC_017559	GC	3	6	648202	648207	0 %	0 %	50 %	50 %	523408823
17504	NC_017559	CCG	2	6	648302	648307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408823
17505	NC_017559	TCA	2	6	648326	648331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408823
17506	NC_017559	GGCG	2	8	648372	648379	0 %	0 %	75 %	25 %	523408823
17507	NC_017559	GCC	2	6	648446	648451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408823
17508	NC_017559	AGC	2	6	648452	648457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408823
17509	NC_017559	CGATCC	2	12	648459	648470	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	523408823
17510	NC_017559	GCT	2	6	648504	648509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408823
17511	NC_017559	GCC	2	6	648523	648528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408823
17512	NC_017559	AGG	2	6	648533	648538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	523408823
17513	NC_017559	CGCT	2	8	648544	648551	0 %	25 %	25 %	50 %	523408823
17514	NC_017559	GC	3	6	648562	648567	0 %	0 %	50 %	50 %	523408823
17515	NC_017559	GGT	2	6	648579	648584	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408823
17516	NC_017559	GCG	2	6	648590	648595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408823
17517	NC_017559	GCG	2	6	648619	648624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408823
17518	NC_017559	CG	3	6	648623	648628	0 %	0 %	50 %	50 %	523408823
17519	NC_017559	GTC	2	6	648642	648647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408823
17520	NC_017559	GCGG	2	8	648648	648655	0 %	0 %	75 %	25 %	523408823
17521	NC_017559	GCG	2	6	648680	648685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408823
17522	NC_017559	TTC	2	6	648715	648720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408823
17523	NC_017559	CTT	2	6	648768	648773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408823
17524	NC_017559	GGC	2	6	648777	648782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408823
17525	NC_017559	CGG	2	6	648786	648791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408823
17526	NC_017559	CGA	2	6	648804	648809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408823
17527	NC_017559	GCT	2	6	648843	648848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408823
17528	NC_017559	GC	4	8	648849	648856	0 %	0 %	50 %	50 %	523408823
17529	NC_017559	GTG	2	6	648916	648921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408823
17530	NC_017559	CCA	2	6	648930	648935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408823
17531	NC_017559	CG	3	6	648942	648947	0 %	0 %	50 %	50 %	523408823
17532	NC_017559	CGC	2	6	648954	648959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408823
17533	NC_017559	GC	3	6	649029	649034	0 %	0 %	50 %	50 %	523408823
17534	NC_017559	GGCG	2	8	649053	649060	0 %	0 %	75 %	25 %	523408823
17535	NC_017559	TGC	2	6	649061	649066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408823
17536	NC_017559	CG	3	6	649080	649085	0 %	0 %	50 %	50 %	523408823
17537	NC_017559	GCA	2	6	649128	649133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408823
17538	NC_017559	CTG	2	6	649180	649185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408823
17539	NC_017559	GC	3	6	649188	649193	0 %	0 %	50 %	50 %	523408823
17540	NC_017559	TCGA	2	8	649216	649223	25 %	25 %	25 %	25 %	523408823
17541	NC_017559	ACC	2	6	649229	649234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408823
17542	NC_017559	CGC	2	6	649265	649270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408823
17543	NC_017559	CG	3	6	649279	649284	0 %	0 %	50 %	50 %	523408823
17544	NC_017559	GGC	2	6	649297	649302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408823
17545	NC_017559	GCC	2	6	649326	649331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408823
17546	NC_017559	GGTG	2	8	649407	649414	0 %	25 %	75 %	0 %	523408823
17547	NC_017559	GTGCCG	2	12	649441	649452	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	523408823
17548	NC_017559	TGA	2	6	649460	649465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408823
17549	NC_017559	CGT	3	9	649473	649481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408823
17550	NC_017559	GCCGGT	3	18	649482	649499	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	523408823
17551	NC_017559	GCCCGC	2	12	649503	649514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408823
17552	NC_017559	GCCG	2	8	649521	649528	0 %	0 %	50 %	50 %	523408823
17553	NC_017559	GCG	2	6	649592	649597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408823
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17555	NC_017559	GCA	2	6	649689	649694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408823
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17557	NC_017559	CGG	2	6	649730	649735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408823
17558	NC_017559	CGG	2	6	649740	649745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408823
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17564	NC_017559	CGA	2	6	649912	649917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408824
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17569	NC_017559	GCGT	2	8	650024	650031	0 %	25 %	50 %	25 %	523408824
17570	NC_017559	ACGC	2	8	650049	650056	25 %	0 %	25 %	50 %	523408824
17571	NC_017559	TTC	2	6	650081	650086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408824
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17573	NC_017559	GACG	2	8	650134	650141	25 %	0 %	50 %	25 %	523408824
17574	NC_017559	CGG	2	6	650175	650180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408824
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17579	NC_017559	CTTG	2	8	650404	650411	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17580	NC_017559	CGC	2	6	650452	650457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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17582	NC_017559	GCC	2	6	650482	650487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17583	NC_017559	GCG	2	6	650503	650508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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17587	NC_017559	GC	3	6	650657	650662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17588	NC_017559	TCTCG	2	10	650712	650721	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17589	NC_017559	GCGCG	2	10	650729	650738	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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17591	NC_017559	CGG	2	6	650755	650760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17592	NC_017559	GCT	2	6	650761	650766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17597	NC_017559	GTG	2	6	651048	651053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408825
17598	NC_017559	CG	3	6	651054	651059	0 %	0 %	50 %	50 %	523408825
17599	NC_017559	CTG	2	6	651060	651065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408825
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17602	NC_017559	GC	3	6	651197	651202	0 %	0 %	50 %	50 %	523408825
17603	NC_017559	CAGG	2	8	651204	651211	25 %	0 %	50 %	25 %	523408825
17604	NC_017559	GCA	3	9	651218	651226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408825
17605	NC_017559	GACG	2	8	651251	651258	25 %	0 %	50 %	25 %	523408825
17606	NC_017559	CCCG	2	8	651268	651275	0 %	0 %	25 %	75 %	523408825
17607	NC_017559	GGC	2	6	651284	651289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408825
17608	NC_017559	CG	3	6	651425	651430	0 %	0 %	50 %	50 %	523408825
17609	NC_017559	CG	3	6	651470	651475	0 %	0 %	50 %	50 %	523408825
17610	NC_017559	CTG	2	6	651480	651485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408825
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17616	NC_017559	TTC	2	6	651750	651755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408825
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17622	NC_017559	GCT	2	6	651965	651970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408825
17623	NC_017559	CGG	2	6	651983	651988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408825
17624	NC_017559	GC	4	8	652013	652020	0 %	0 %	50 %	50 %	523408825
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17655	NC_017559	TGG	2	6	653377	653382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408825
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17663	NC_017559	GTC	2	6	653582	653587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408825
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17666	NC_017559	CCGG	2	8	653830	653837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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17725	NC_017559	GGTTG	2	10	656453	656462	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
17726	NC_017559	GCG	2	6	656466	656471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17727	NC_017559	CGT	2	6	656509	656514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17728	NC_017559	CA	3	6	656516	656521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17729	NC_017559	CCG	2	6	656522	656527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17730	NC_017559	GTT	2	6	656529	656534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17731	NC_017559	GCG	2	6	656553	656558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17732	NC_017559	G	7	7	656580	656586	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17733	NC_017559	GCAA	2	8	656609	656616	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17734	NC_017559	GTC	2	6	656639	656644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408828
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17737	NC_017559	GCT	2	6	656833	656838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408828
17738	NC_017559	GGT	2	6	656863	656868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408828
17739	NC_017559	CAG	2	6	656892	656897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408828
17740	NC_017559	GTAA	2	8	656930	656937	50 %	25 %	25 %	0 %	523408828
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17987	NC_017559	CG	3	6	665564	665569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17988	NC_017559	ACC	2	6	665583	665588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17989	NC_017559	GC	3	6	665622	665627	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17990	NC_017559	TGCG	2	8	665703	665710	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17991	NC_017559	CG	3	6	665744	665749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17992	NC_017559	CATCG	2	10	665750	665759	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
17993	NC_017559	ATCG	2	8	665810	665817	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17994	NC_017559	CG	3	6	665816	665821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17995	NC_017559	TCG	2	6	665831	665836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17996	NC_017559	T	7	7	665874	665880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17997	NC_017559	CGAG	2	8	665886	665893	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17998	NC_017559	CGTTGA	2	12	665918	665929	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
17999	NC_017559	CG	3	6	665940	665945	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18000	NC_017559	CG	4	8	665953	665960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

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