MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 98333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017559	TCG	2	6	557423	557428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408746
15003	NC_017559	GCC	3	9	557522	557530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408747
15004	NC_017559	GTTGG	2	10	557540	557549	0 %	40 %	60 %	0 %	523408747
15005	NC_017559	GGC	2	6	557649	557654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408747
15006	NC_017559	GC	3	6	557693	557698	0 %	0 %	50 %	50 %	523408747
15007	NC_017559	CGG	2	6	557736	557741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408747
15008	NC_017559	CG	4	8	557745	557752	0 %	0 %	50 %	50 %	523408747
15009	NC_017559	GC	3	6	557758	557763	0 %	0 %	50 %	50 %	523408747
15010	NC_017559	GCG	2	6	557776	557781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408747
15011	NC_017559	GCC	3	9	557792	557800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408747
15012	NC_017559	GC	3	6	557821	557826	0 %	0 %	50 %	50 %	523408747
15013	NC_017559	GCGG	2	8	557839	557846	0 %	0 %	75 %	25 %	523408747
15014	NC_017559	CGC	2	6	557847	557852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408747
15015	NC_017559	GCC	3	9	557927	557935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408747
15016	NC_017559	ACGC	2	8	557936	557943	25 %	0 %	25 %	50 %	523408747
15017	NC_017559	GC	3	6	557948	557953	0 %	0 %	50 %	50 %	523408747
15018	NC_017559	CAG	2	6	557982	557987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408748
15019	NC_017559	CGT	2	6	558077	558082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408748
15020	NC_017559	CGCCGG	2	12	558185	558196	0 %	0 %	50 %	50 %	523408748
15021	NC_017559	GC	3	6	558236	558241	0 %	0 %	50 %	50 %	523408748
15022	NC_017559	TCG	2	6	558427	558432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408748
15023	NC_017559	TGT	2	6	558482	558487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	523408748
15024	NC_017559	ATC	2	6	558511	558516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408748
15025	NC_017559	AGC	2	6	558517	558522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408748
15026	NC_017559	CGG	2	6	558577	558582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408749
15027	NC_017559	GCA	2	6	558586	558591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408749
15028	NC_017559	CCA	2	6	558646	558651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408749
15029	NC_017559	GCC	2	6	558660	558665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408749
15030	NC_017559	TGA	2	6	558688	558693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408749
15031	NC_017559	CGC	2	6	558754	558759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408749
15032	NC_017559	TCG	2	6	558789	558794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408749
15033	NC_017559	GCCG	2	8	558836	558843	0 %	0 %	50 %	50 %	523408749
15034	NC_017559	GC	3	6	558852	558857	0 %	0 %	50 %	50 %	523408749
15035	NC_017559	TGC	2	6	558915	558920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408749
15036	NC_017559	GC	3	6	558998	559003	0 %	0 %	50 %	50 %	523408749
15037	NC_017559	AGC	2	6	559050	559055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408749
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15040	NC_017559	GCGG	2	8	559114	559121	0 %	0 %	75 %	25 %	523408749
15041	NC_017559	GCGG	2	8	559133	559140	0 %	0 %	75 %	25 %	523408749
15042	NC_017559	TCC	2	6	559143	559148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	523408749
15043	NC_017559	GCCGTT	2	12	559151	559162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408749
15044	NC_017559	GCCG	2	8	559166	559173	0 %	0 %	50 %	50 %	523408749
15045	NC_017559	CGA	2	6	559219	559224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408749
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15047	NC_017559	GC	3	6	559282	559287	0 %	0 %	50 %	50 %	523408749
15048	NC_017559	ACAGCG	2	12	559291	559302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408749
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15050	NC_017559	CGCC	2	8	559357	559364	0 %	0 %	25 %	75 %	523408749
15051	NC_017559	GC	3	6	559485	559490	0 %	0 %	50 %	50 %	523408749
15052	NC_017559	GCT	2	6	559504	559509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408749
15053	NC_017559	GC	3	6	559512	559517	0 %	0 %	50 %	50 %	523408749
15054	NC_017559	GCG	2	6	559642	559647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408749
15055	NC_017559	CGT	2	6	559684	559689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408749
15056	NC_017559	GGCCA	2	10	559703	559712	20 %	0 %	40 %	40 %	523408749
15057	NC_017559	GGC	2	6	559766	559771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408749
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15063	NC_017559	CGC	2	6	559903	559908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408749
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15068	NC_017559	CGGC	2	8	560110	560117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15069	NC_017559	GTC	2	6	560222	560227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15070	NC_017559	CGG	2	6	560245	560250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15071	NC_017559	CAGG	2	8	560287	560294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15072	NC_017559	CAG	2	6	560339	560344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15073	NC_017559	GCCAGG	2	12	560386	560397	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15074	NC_017559	C	6	6	560398	560403	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15075	NC_017559	GGC	2	6	560459	560464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408750
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15089	NC_017559	CGA	2	6	561037	561042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408750
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15091	NC_017559	GGC	2	6	561098	561103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408750
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15099	NC_017559	GC	3	6	561207	561212	0 %	0 %	50 %	50 %	523408751
15100	NC_017559	GC	3	6	561219	561224	0 %	0 %	50 %	50 %	523408751
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15108	NC_017559	CG	3	6	561406	561411	0 %	0 %	50 %	50 %	523408751
15109	NC_017559	CCG	2	6	561446	561451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408751
15110	NC_017559	GCG	2	6	561519	561524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408751
15111	NC_017559	GGCC	2	8	561543	561550	0 %	0 %	50 %	50 %	523408751
15112	NC_017559	GAT	2	6	561652	561657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408751
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15114	NC_017559	GCGG	2	8	561723	561730	0 %	0 %	75 %	25 %	523408751
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15118	NC_017559	ATG	2	6	561914	561919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408751
15119	NC_017559	GC	3	6	561934	561939	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15120	NC_017559	GAA	2	6	561948	561953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15121	NC_017559	CGG	2	6	561974	561979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15122	NC_017559	GCC	2	6	561984	561989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15123	NC_017559	CCTG	2	8	562093	562100	0 %	25 %	25 %	50 %	523408752
15124	NC_017559	ACCATC	2	12	562142	562153	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	523408752
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15141	NC_017559	CAA	2	6	562758	562763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15142	NC_017559	CCG	2	6	562821	562826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408754
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15243	NC_017559	CGGCAG	2	12	566235	566246	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	523408757
15244	NC_017559	GC	3	6	566248	566253	0 %	0 %	50 %	50 %	523408757
15245	NC_017559	CTG	2	6	566277	566282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408757
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15247	NC_017559	CGG	2	6	566444	566449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408757
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15251	NC_017559	CG	3	6	566642	566647	0 %	0 %	50 %	50 %	523408758
15252	NC_017559	GCT	2	6	566730	566735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408758
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15279	NC_017559	CGG	2	6	567744	567749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15355	NC_017559	CTCAT	2	10	572526	572535	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15356	NC_017559	CGT	2	6	572607	572612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15359	NC_017559	GGC	2	6	573000	573005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15362	NC_017559	GAT	2	6	573110	573115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15363	NC_017559	GC	3	6	573212	573217	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15364	NC_017559	A	6	6	573236	573241	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15365	NC_017559	TGC	2	6	573266	573271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15366	NC_017559	GGT	2	6	573310	573315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15367	NC_017559	CTG	2	6	573407	573412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15368	NC_017559	CGGCC	2	10	573429	573438	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15369	NC_017559	G	7	7	573491	573497	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15370	NC_017559	GCG	2	6	573542	573547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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15372	NC_017559	GGT	2	6	573586	573591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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15493	NC_017559	GCCG	2	8	578100	578107	0 %	0 %	50 %	50 %	523408763
15494	NC_017559	TCG	2	6	578110	578115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408763
15495	NC_017559	GCA	2	6	578129	578134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408763
15496	NC_017559	CGC	2	6	578146	578151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408763
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15498	NC_017559	GCT	2	6	578243	578248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408763
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15500	NC_017559	GCGCT	2	10	578279	578288	0 %	20 %	40 %	40 %	523408763

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