MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Ralstonia solanacearum CMR15 chromosome

Total Repeats: 98333

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017559	CGG	2	6	498147	498152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408686
13502	NC_017559	CGC	3	9	498165	498173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408686
13503	NC_017559	TGC	2	6	498213	498218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408686
13504	NC_017559	GC	3	6	498217	498222	0 %	0 %	50 %	50 %	523408686
13505	NC_017559	GAC	2	6	498223	498228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408686
13506	NC_017559	CTG	2	6	498278	498283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408686
13507	NC_017559	TCG	2	6	498360	498365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408686
13508	NC_017559	GTG	3	9	498383	498391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408686
13509	NC_017559	GGT	2	6	498403	498408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408686
13510	NC_017559	TCT	3	9	498411	498419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408686
13511	NC_017559	TGC	2	6	498483	498488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408686
13512	NC_017559	GTG	2	6	498500	498505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408686
13513	NC_017559	GCC	2	6	498538	498543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408686
13514	NC_017559	CGG	2	6	498549	498554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408686
13515	NC_017559	TTC	2	6	498596	498601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	523408686
13516	NC_017559	GCT	2	6	498711	498716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408687
13517	NC_017559	CT	3	6	498814	498819	0 %	50 %	0 %	50 %	523408687
13518	NC_017559	ACT	2	6	498851	498856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408687
13519	NC_017559	CAG	2	6	498931	498936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408687
13520	NC_017559	CTG	2	6	498940	498945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408687
13521	NC_017559	AAG	2	6	499003	499008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408687
13522	NC_017559	GCC	2	6	499023	499028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408687
13523	NC_017559	CG	6	12	499044	499055	0 %	0 %	50 %	50 %	523408687
13524	NC_017559	CGA	2	6	499098	499103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408687
13525	NC_017559	AAC	2	6	499123	499128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408687
13526	NC_017559	CGG	2	6	499218	499223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408687
13527	NC_017559	TCG	2	6	499241	499246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408687
13528	NC_017559	CTGGA	2	10	499321	499330	20 %	20 %	40 %	20 %	523408687
13529	NC_017559	TGC	2	6	499376	499381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408687
13530	NC_017559	CGTTTT	2	12	499503	499514	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13531	NC_017559	TGC	2	6	499517	499522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_017559	GCC	2	6	499561	499566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13533	NC_017559	ATG	2	6	499596	499601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13534	NC_017559	CAC	2	6	499616	499621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13535	NC_017559	CAA	2	6	499700	499705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408688
13536	NC_017559	TGA	2	6	499723	499728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408688
13537	NC_017559	CAT	2	6	499787	499792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408688
13538	NC_017559	CGA	2	6	499805	499810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408688
13539	NC_017559	CCCGCA	2	12	499817	499828	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	523408688
13540	NC_017559	GCCG	2	8	499835	499842	0 %	0 %	50 %	50 %	523408688
13541	NC_017559	GC	3	6	499853	499858	0 %	0 %	50 %	50 %	523408688
13542	NC_017559	CGCC	2	8	499862	499869	0 %	0 %	25 %	75 %	523408688
13543	NC_017559	CACG	2	8	499901	499908	25 %	0 %	25 %	50 %	523408688
13544	NC_017559	GC	4	8	499962	499969	0 %	0 %	50 %	50 %	523408688
13545	NC_017559	GAA	2	6	500012	500017	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408688
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13547	NC_017559	GAA	2	6	500108	500113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408688
13548	NC_017559	TGC	2	6	500114	500119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408688
13549	NC_017559	TGA	2	6	500125	500130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408688
13550	NC_017559	CCG	2	6	500211	500216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13551	NC_017559	TCG	2	6	500354	500359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408689
13552	NC_017559	ACA	2	6	500360	500365	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	523408689
13553	NC_017559	ACG	2	6	500396	500401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408689
13554	NC_017559	CCAG	2	8	500432	500439	25 %	0 %	25 %	50 %	523408689
13555	NC_017559	CG	3	6	500472	500477	0 %	0 %	50 %	50 %	523408689
13556	NC_017559	CG	4	8	500535	500542	0 %	0 %	50 %	50 %	523408689
13557	NC_017559	GGGCA	2	10	500548	500557	20 %	0 %	60 %	20 %	523408689
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13564	NC_017559	CGG	2	6	500730	500735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408689
13565	NC_017559	GTC	2	6	500752	500757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408689
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13567	NC_017559	TCA	2	6	500804	500809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13568	NC_017559	ATC	2	6	500830	500835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13569	NC_017559	TGG	2	6	501019	501024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_017559	CAC	2	6	501073	501078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13571	NC_017559	TTCAA	2	10	501202	501211	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13572	NC_017559	TCA	2	6	501270	501275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	523408690
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13581	NC_017559	TGG	2	6	501584	501589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408690
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13583	NC_017559	GAC	2	6	501638	501643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408690
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13586	NC_017559	TGG	2	6	501823	501828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408691
13587	NC_017559	GTC	2	6	501841	501846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408691
13588	NC_017559	ATTG	2	8	501858	501865	25 %	50 %	25 %	0 %	523408691
13589	NC_017559	GC	3	6	501869	501874	0 %	0 %	50 %	50 %	523408691
13590	NC_017559	GGC	2	6	501884	501889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408691
13591	NC_017559	GCA	2	6	501960	501965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13592	NC_017559	ACT	2	6	501975	501980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13593	NC_017559	CTTCGG	2	12	502009	502020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13594	NC_017559	TCCG	2	8	502047	502054	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13595	NC_017559	GGGC	2	8	502068	502075	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13596	NC_017559	TAT	2	6	502139	502144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13597	NC_017559	AGCG	2	8	502204	502211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13598	NC_017559	CCATC	2	10	502232	502241	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
13599	NC_017559	AGA	2	6	502247	502252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13600	NC_017559	CCG	2	6	502306	502311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	523408692
13601	NC_017559	AGC	2	6	502411	502416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408692
13602	NC_017559	AAG	2	6	502479	502484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	523408692
13603	NC_017559	GCG	2	6	502498	502503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408692
13604	NC_017559	G	7	7	502524	502530	0 %	0 %	100 %	0 %	523408692
13605	NC_017559	CGT	3	9	502604	502612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408692
13606	NC_017559	GAC	2	6	502635	502640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408692
13607	NC_017559	ATG	2	6	502729	502734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408692
13608	NC_017559	CGA	2	6	502756	502761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408692
13609	NC_017559	CAC	2	6	502845	502850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408692
13610	NC_017559	TGA	2	6	502859	502864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	523408692
13611	NC_017559	CA	3	6	502931	502936	50 %	0 %	0 %	50 %	523408692
13612	NC_017559	GCG	2	6	502995	503000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408692
13613	NC_017559	AGC	2	6	503018	503023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	523408692
13614	NC_017559	GTG	2	6	503074	503079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	523408692
13615	NC_017559	AGAGG	2	10	503112	503121	40 %	0 %	60 %	0 %	523408692
13616	NC_017559	CCA	2	6	503181	503186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	523408693
13617	NC_017559	TCG	2	6	503225	503230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	523408693
13618	NC_017559	GGC	2	6	503249	503254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408693
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13992	NC_017559	GGC	2	6	521378	521383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408709
13993	NC_017559	GCCG	2	8	521387	521394	0 %	0 %	50 %	50 %	523408709
13994	NC_017559	CGG	2	6	521409	521414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408709
13995	NC_017559	CGGG	3	12	521424	521435	0 %	0 %	75 %	25 %	523408709
13996	NC_017559	GGC	2	6	521436	521441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	523408709
13997	NC_017559	GC	3	6	521474	521479	0 %	0 %	50 %	50 %	523408709
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