MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_017066	TA	4	8	1102090	1102097	50 %	50 %	0 %	0 %	383752818
30003	NC_017066	ATAA	2	8	1102144	1102151	75 %	25 %	0 %	0 %	383752818
30004	NC_017066	ACC	2	6	1102183	1102188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752818
30005	NC_017066	TAA	2	6	1102225	1102230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752818
30006	NC_017066	TTC	2	6	1102231	1102236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752818
30007	NC_017066	TA	3	6	1102260	1102265	50 %	50 %	0 %	0 %	383752818
30008	NC_017066	CTA	2	6	1102278	1102283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752818
30009	NC_017066	TTA	2	6	1102319	1102324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752818
30010	NC_017066	TAT	2	6	1102475	1102480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30011	NC_017066	TAA	2	6	1102551	1102556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30012	NC_017066	TAA	2	6	1102654	1102659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30013	NC_017066	TTTA	2	8	1102660	1102667	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30014	NC_017066	TTA	2	6	1102681	1102686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30015	NC_017066	ATT	2	6	1102714	1102719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30016	NC_017066	TTC	2	6	1102720	1102725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30017	NC_017066	TCT	2	6	1102732	1102737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30018	NC_017066	A	8	8	1102747	1102754	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30019	NC_017066	AAC	2	6	1102792	1102797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30020	NC_017066	AAC	2	6	1102845	1102850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30021	NC_017066	TGA	2	6	1102895	1102900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30022	NC_017066	TG	3	6	1102965	1102970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30023	NC_017066	T	6	6	1103119	1103124	0 %	100 %	0 %	0 %	383752819
30024	NC_017066	T	6	6	1103142	1103147	0 %	100 %	0 %	0 %	383752819
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30027	NC_017066	AAGC	2	8	1103276	1103283	50 %	0 %	25 %	25 %	383752819
30028	NC_017066	TAC	2	6	1103349	1103354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752819
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30031	NC_017066	TTTTA	2	10	1103416	1103425	20 %	80 %	0 %	0 %	383752820
30032	NC_017066	T	6	6	1103426	1103431	0 %	100 %	0 %	0 %	383752820
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30038	NC_017066	TACT	2	8	1103546	1103553	25 %	50 %	0 %	25 %	383752820
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30041	NC_017066	T	6	6	1103616	1103621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30042	NC_017066	AAC	2	6	1103684	1103689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30043	NC_017066	ATA	2	6	1103690	1103695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30044	NC_017066	TGT	2	6	1103772	1103777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752821
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30065	NC_017066	TA	3	6	1104838	1104843	50 %	50 %	0 %	0 %	383752821
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30081	NC_017066	TAC	2	6	1105541	1105546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752822
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30089	NC_017066	AT	3	6	1105733	1105738	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30092	NC_017066	T	6	6	1105770	1105775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30093	NC_017066	AAT	2	6	1105782	1105787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30094	NC_017066	AGTA	2	8	1105811	1105818	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30095	NC_017066	TA	3	6	1105817	1105822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30096	NC_017066	TAG	2	6	1105826	1105831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30100	NC_017066	TA	3	6	1106074	1106079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30101	NC_017066	TAAG	2	8	1106119	1106126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30102	NC_017066	ATC	2	6	1106128	1106133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30103	NC_017066	TAG	2	6	1106139	1106144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30104	NC_017066	GATG	2	8	1106151	1106158	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30105	NC_017066	TTA	2	6	1106194	1106199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30106	NC_017066	A	6	6	1106199	1106204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30107	NC_017066	TAAC	2	8	1106205	1106212	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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30109	NC_017066	TAA	2	6	1106277	1106282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30111	NC_017066	AAT	2	6	1106309	1106314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30112	NC_017066	AAG	2	6	1106317	1106322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30113	NC_017066	TACA	2	8	1106331	1106338	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30114	NC_017066	TAT	2	6	1106411	1106416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30115	NC_017066	A	6	6	1106417	1106422	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30116	NC_017066	AGA	2	6	1106441	1106446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30117	NC_017066	TA	3	6	1106475	1106480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30118	NC_017066	ATATT	2	10	1106522	1106531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30119	NC_017066	TTCTTA	2	12	1106644	1106655	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30120	NC_017066	TAA	2	6	1106699	1106704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30121	NC_017066	TAAT	2	8	1106713	1106720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30122	NC_017066	T	7	7	1106754	1106760	0 %	100 %	0 %	0 %	383752823
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