MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_017066	TAA	2	6	839216	839221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23002	NC_017066	TAATA	2	10	839248	839257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23003	NC_017066	TACCT	2	10	839282	839291	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23004	NC_017066	AATCT	2	10	839348	839357	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
23005	NC_017066	ATT	2	6	839363	839368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23006	NC_017066	TTAA	2	8	839390	839397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23007	NC_017066	TAA	2	6	839399	839404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23008	NC_017066	T	6	6	839445	839450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23009	NC_017066	TAA	2	6	839460	839465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23010	NC_017066	T	6	6	839486	839491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23011	NC_017066	T	10	10	839493	839502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23012	NC_017066	TC	3	6	839508	839513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23013	NC_017066	CAA	2	6	839539	839544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23014	NC_017066	AC	3	6	839677	839682	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23015	NC_017066	TTA	3	9	839761	839769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23016	NC_017066	GTT	2	6	839799	839804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23017	NC_017066	TCT	2	6	839813	839818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23018	NC_017066	TCT	2	6	839833	839838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23019	NC_017066	AT	3	6	839883	839888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23020	NC_017066	CTA	2	6	839944	839949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23021	NC_017066	TA	3	6	839958	839963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23022	NC_017066	CTA	2	6	840032	840037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23023	NC_017066	TTC	2	6	840090	840095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23024	NC_017066	ATA	2	6	840113	840118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23025	NC_017066	TTA	3	9	840161	840169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23030	NC_017066	TAT	2	6	840482	840487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23031	NC_017066	ATT	2	6	840536	840541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23032	NC_017066	TGC	2	6	840550	840555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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23037	NC_017066	ATT	2	6	840763	840768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23038	NC_017066	GT	3	6	840785	840790	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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23040	NC_017066	TTA	2	6	840826	840831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23041	NC_017066	ATA	2	6	840844	840849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23042	NC_017066	TTTA	2	8	840879	840886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23043	NC_017066	ATA	2	6	840943	840948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23044	NC_017066	TA	3	6	840956	840961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23045	NC_017066	TAA	2	6	840992	840997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23046	NC_017066	ATT	2	6	841054	841059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23047	NC_017066	TAT	2	6	841093	841098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23048	NC_017066	TAA	2	6	841121	841126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23049	NC_017066	CAT	2	6	841134	841139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23051	NC_017066	CTGTA	2	10	841186	841195	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
23052	NC_017066	TCT	2	6	841264	841269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23053	NC_017066	AAT	2	6	841273	841278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23054	NC_017066	AATT	2	8	841301	841308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23055	NC_017066	GAT	2	6	841314	841319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23056	NC_017066	CAT	2	6	841346	841351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23057	NC_017066	ATATTT	2	12	841395	841406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23058	NC_017066	ATA	2	6	841413	841418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23059	NC_017066	GAAA	2	8	841420	841427	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23060	NC_017066	A	7	7	841460	841466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23061	NC_017066	ACA	2	6	841478	841483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23062	NC_017066	A	6	6	841483	841488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23063	NC_017066	ATT	2	6	841496	841501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23064	NC_017066	AAC	2	6	841508	841513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23065	NC_017066	TAA	2	6	841538	841543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23066	NC_017066	TA	3	6	841568	841573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23076	NC_017066	ATT	2	6	841927	841932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23102	NC_017066	TAT	2	6	842825	842830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752627
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23108	NC_017066	ATTT	2	8	843113	843120	25 %	75 %	0 %	0 %	383752627
23109	NC_017066	TAA	2	6	843136	843141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752627
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23115	NC_017066	T	7	7	843362	843368	0 %	100 %	0 %	0 %	383752627
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23124	NC_017066	T	6	6	843581	843586	0 %	100 %	0 %	0 %	383752628
23125	NC_017066	TAC	2	6	843624	843629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752628
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