MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_017066	A	6	6	710913	710918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19503	NC_017066	TCA	2	6	710979	710984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19504	NC_017066	ATT	2	6	711020	711025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19505	NC_017066	ATT	2	6	711035	711040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19506	NC_017066	AC	3	6	711061	711066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19507	NC_017066	ACT	2	6	711080	711085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19508	NC_017066	TATCCA	2	12	711090	711101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19509	NC_017066	CAA	2	6	711180	711185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19510	NC_017066	TA	3	6	711197	711202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19511	NC_017066	TAA	2	6	711218	711223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19512	NC_017066	A	6	6	711233	711238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19513	NC_017066	A	7	7	711259	711265	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19514	NC_017066	CTTT	2	8	711271	711278	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19515	NC_017066	AG	3	6	711371	711376	50 %	0 %	50 %	0 %	383752518
19516	NC_017066	TGC	2	6	711392	711397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752518
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19518	NC_017066	A	6	6	711549	711554	100 %	0 %	0 %	0 %	383752518
19519	NC_017066	ATT	2	6	711579	711584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752518
19520	NC_017066	CAG	2	6	711607	711612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752518
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19522	NC_017066	ATTA	2	8	711671	711678	50 %	50 %	0 %	0 %	383752518
19523	NC_017066	GGA	2	6	711768	711773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752518
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19525	NC_017066	GCA	2	6	711873	711878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752518
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19527	NC_017066	TAA	2	6	711908	711913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752518
19528	NC_017066	TAT	2	6	711920	711925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752518
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19530	NC_017066	ATT	2	6	711968	711973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752518
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19534	NC_017066	TA	4	8	712045	712052	50 %	50 %	0 %	0 %	383752518
19535	NC_017066	ATTCCT	2	12	712068	712079	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	383752518
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19539	NC_017066	TAT	2	6	712227	712232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752518
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19541	NC_017066	AGA	2	6	712280	712285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752518
19542	NC_017066	ACT	2	6	712292	712297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752518
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19544	NC_017066	GTT	2	6	712422	712427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752518
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19546	NC_017066	GA	3	6	712577	712582	50 %	0 %	50 %	0 %	383752518
19547	NC_017066	TAA	3	9	712625	712633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752518
19548	NC_017066	CTT	2	6	712645	712650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752518
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19554	NC_017066	TTA	2	6	712792	712797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752519
19555	NC_017066	TTAC	2	8	712834	712841	25 %	50 %	0 %	25 %	383752519
19556	NC_017066	TATCA	2	10	712872	712881	40 %	40 %	0 %	20 %	383752519
19557	NC_017066	GAAA	2	8	712911	712918	75 %	0 %	25 %	0 %	383752519
19558	NC_017066	CTT	2	6	712997	713002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752519
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20000	NC_017066	GTT	2	6	729196	729201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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