MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

< Previous12...3233343536373839404142...6061Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_017066	ATTT	2	8	655996	656003	25 %	75 %	0 %	0 %	383752486
18003	NC_017066	ATT	2	6	656021	656026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752486
18004	NC_017066	A	6	6	656028	656033	100 %	0 %	0 %	0 %	383752486
18005	NC_017066	TTC	2	6	656042	656047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752486
18006	NC_017066	CAG	2	6	656056	656061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752486
18007	NC_017066	CTG	2	6	656074	656079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752486
18008	NC_017066	TAT	2	6	656102	656107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752486
18009	NC_017066	CTT	2	6	656275	656280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752486
18010	NC_017066	CAA	2	6	656284	656289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752486
18011	NC_017066	ATA	2	6	656290	656295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752486
18012	NC_017066	ACT	2	6	656297	656302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752486
18013	NC_017066	TCG	2	6	656334	656339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752486
18014	NC_017066	TAA	2	6	656345	656350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752486
18015	NC_017066	ATT	2	6	656369	656374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752486
18016	NC_017066	TGCT	2	8	656401	656408	0 %	50 %	25 %	25 %	383752486
18017	NC_017066	TAG	2	6	656422	656427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752486
18018	NC_017066	TAAAA	2	10	656489	656498	80 %	20 %	0 %	0 %	383752486
18019	NC_017066	TGC	2	6	656574	656579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752486
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18022	NC_017066	CTT	2	6	656717	656722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752486
18023	NC_017066	ATA	2	6	656731	656736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752486
18024	NC_017066	TCA	2	6	656796	656801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752486
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18029	NC_017066	T	6	6	656968	656973	0 %	100 %	0 %	0 %	383752486
18030	NC_017066	AT	3	6	657005	657010	50 %	50 %	0 %	0 %	383752486
18031	NC_017066	ATATT	2	10	657034	657043	40 %	60 %	0 %	0 %	383752486
18032	NC_017066	GCT	2	6	657072	657077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752486
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18035	NC_017066	A	6	6	657219	657224	100 %	0 %	0 %	0 %	383752486
18036	NC_017066	ATT	2	6	657242	657247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752486
18037	NC_017066	TCT	2	6	657318	657323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752486
18038	NC_017066	TTTATT	2	12	657380	657391	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18039	NC_017066	TCA	2	6	657506	657511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752487
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18042	NC_017066	ACCT	2	8	657658	657665	25 %	25 %	0 %	50 %	383752487
18043	NC_017066	CGT	2	6	657704	657709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752487
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18052	NC_017066	GACGCT	2	12	658058	658069	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	383752487
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18063	NC_017066	ATTTT	2	10	658547	658556	20 %	80 %	0 %	0 %	383752487
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18066	NC_017066	AGT	2	6	658581	658586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18067	NC_017066	TTGA	2	8	658587	658594	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18068	NC_017066	AGCA	2	8	658596	658603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18069	NC_017066	AAC	2	6	658612	658617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18070	NC_017066	TAATAT	2	12	658627	658638	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18115	NC_017066	AT	3	6	660618	660623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18116	NC_017066	TTATT	2	10	660634	660643	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18117	NC_017066	ATA	2	6	660659	660664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18118	NC_017066	TTTA	2	8	660673	660680	25 %	75 %	0 %	0 %	383752490
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