MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17502	NC_017066	TTAT	2	8	639421	639428	25 %	75 %	0 %	0 %	383752474
17503	NC_017066	ATTT	2	8	639440	639447	25 %	75 %	0 %	0 %	383752474
17504	NC_017066	T	8	8	639445	639452	0 %	100 %	0 %	0 %	383752474
17505	NC_017066	TTA	2	6	639489	639494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17506	NC_017066	T	6	6	639501	639506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17507	NC_017066	AAT	3	9	639558	639566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17508	NC_017066	T	10	10	639588	639597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17509	NC_017066	TTGAC	2	10	639603	639612	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17510	NC_017066	ATTT	2	8	639633	639640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17511	NC_017066	T	7	7	639638	639644	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17512	NC_017066	TTGAC	2	10	639650	639659	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17513	NC_017066	TTA	2	6	639726	639731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17514	NC_017066	A	6	6	639753	639758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17515	NC_017066	A	6	6	639821	639826	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17516	NC_017066	TAG	2	6	639849	639854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17517	NC_017066	AAT	2	6	639869	639874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17518	NC_017066	TAT	2	6	639912	639917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17519	NC_017066	AAT	2	6	639918	639923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17520	NC_017066	ATAA	2	8	639928	639935	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17521	NC_017066	TTAT	2	8	639938	639945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17522	NC_017066	AATA	2	8	639954	639961	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17523	NC_017066	T	7	7	639997	640003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17524	NC_017066	TTA	2	6	640018	640023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17525	NC_017066	A	6	6	640041	640046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17526	NC_017066	CAA	2	6	640061	640066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17527	NC_017066	A	7	7	640082	640088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17528	NC_017066	TAA	2	6	640154	640159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17529	NC_017066	T	9	9	640162	640170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17530	NC_017066	ATT	2	6	640233	640238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17531	NC_017066	TAA	2	6	640250	640255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17532	NC_017066	CTT	2	6	640315	640320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17533	NC_017066	ATC	2	6	640343	640348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17534	NC_017066	AC	3	6	640365	640370	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17535	NC_017066	TAT	2	6	640371	640376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17536	NC_017066	ATT	2	6	640386	640391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17537	NC_017066	CAT	2	6	640394	640399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17538	NC_017066	TA	3	6	640409	640414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17539	NC_017066	ATT	2	6	640482	640487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17540	NC_017066	T	6	6	640486	640491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17541	NC_017066	CAA	2	6	640573	640578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17542	NC_017066	TAAT	2	8	640601	640608	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17543	NC_017066	A	6	6	640629	640634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17544	NC_017066	TAA	2	6	640643	640648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17545	NC_017066	TAC	2	6	640707	640712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17546	NC_017066	AAT	3	9	640719	640727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17547	NC_017066	A	7	7	640764	640770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17548	NC_017066	TAA	2	6	640805	640810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17549	NC_017066	A	6	6	640824	640829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17550	NC_017066	TAC	2	6	640833	640838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17551	NC_017066	ATT	2	6	640877	640882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17552	NC_017066	TCA	2	6	640883	640888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17553	NC_017066	CTT	2	6	640904	640909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17554	NC_017066	AAT	2	6	640925	640930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752475
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17561	NC_017066	A	6	6	641231	641236	100 %	0 %	0 %	0 %	383752475
17562	NC_017066	TAT	2	6	641240	641245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752475
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17575	NC_017066	AT	3	6	641647	641652	50 %	50 %	0 %	0 %	383752475
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17583	NC_017066	AAAGA	2	10	641956	641965	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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17586	NC_017066	TTA	2	6	642058	642063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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17593	NC_017066	A	6	6	642285	642290	100 %	0 %	0 %	0 %	383752476
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17599	NC_017066	TAC	2	6	642461	642466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752476
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17601	NC_017066	A	7	7	642573	642579	100 %	0 %	0 %	0 %	383752476
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17608	NC_017066	T	6	6	643029	643034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17609	NC_017066	CTT	2	6	643069	643074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752477
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