MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

< Previous12...3031323334353637383940...6061Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_017066	CAT	2	6	621098	621103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752460
17003	NC_017066	A	7	7	621128	621134	100 %	0 %	0 %	0 %	383752460
17004	NC_017066	TTCTTG	2	12	621135	621146	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383752460
17005	NC_017066	TGT	3	9	621154	621162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752460
17006	NC_017066	A	6	6	621251	621256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_017066	A	7	7	621305	621311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17008	NC_017066	CTTAA	2	10	621331	621340	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17009	NC_017066	A	6	6	621359	621364	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17010	NC_017066	TAA	2	6	621385	621390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17011	NC_017066	A	7	7	621462	621468	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17012	NC_017066	ATT	2	6	621474	621479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752461
17013	NC_017066	TTTA	2	8	621511	621518	25 %	75 %	0 %	0 %	383752461
17014	NC_017066	TAG	2	6	621525	621530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752461
17015	NC_017066	AGA	2	6	621598	621603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752461
17016	NC_017066	TAAAA	2	10	621823	621832	80 %	20 %	0 %	0 %	383752461
17017	NC_017066	TAT	2	6	621838	621843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752461
17018	NC_017066	ATT	2	6	621865	621870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752461
17019	NC_017066	A	6	6	621877	621882	100 %	0 %	0 %	0 %	383752461
17020	NC_017066	TAA	2	6	621894	621899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752461
17021	NC_017066	TTC	2	6	621942	621947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752461
17022	NC_017066	TGC	3	9	622057	622065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752461
17023	NC_017066	CTA	2	6	622080	622085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752461
17024	NC_017066	AATT	2	8	622086	622093	50 %	50 %	0 %	0 %	383752461
17025	NC_017066	TGA	2	6	622141	622146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752461
17026	NC_017066	ATC	2	6	622151	622156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752461
17027	NC_017066	ATTT	2	8	622182	622189	25 %	75 %	0 %	0 %	383752461
17028	NC_017066	T	6	6	622187	622192	0 %	100 %	0 %	0 %	383752461
17029	NC_017066	TAGT	2	8	622290	622297	25 %	50 %	25 %	0 %	383752461
17030	NC_017066	GT	3	6	622314	622319	0 %	50 %	50 %	0 %	383752461
17031	NC_017066	ATA	2	6	622354	622359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752461
17032	NC_017066	TAAA	2	8	622396	622403	75 %	25 %	0 %	0 %	383752461
17033	NC_017066	AAT	2	6	622427	622432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752461
17034	NC_017066	TTC	2	6	622450	622455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752461
17035	NC_017066	GTA	2	6	622460	622465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752461
17036	NC_017066	ATT	2	6	622468	622473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752461
17037	NC_017066	TAT	2	6	622525	622530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752461
17038	NC_017066	AAG	2	6	622561	622566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752461
17039	NC_017066	TTG	2	6	622593	622598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752461
17040	NC_017066	A	7	7	622682	622688	100 %	0 %	0 %	0 %	383752461
17041	NC_017066	AT	3	6	622707	622712	50 %	50 %	0 %	0 %	383752461
17042	NC_017066	ACAT	2	8	622742	622749	50 %	25 %	0 %	25 %	383752461
17043	NC_017066	TTA	2	6	622755	622760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752461
17044	NC_017066	A	6	6	622760	622765	100 %	0 %	0 %	0 %	383752461
17045	NC_017066	TAG	2	6	622821	622826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752461
17046	NC_017066	AATA	2	8	622864	622871	75 %	25 %	0 %	0 %	383752461
17047	NC_017066	TAA	2	6	622885	622890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752461
17048	NC_017066	ATT	2	6	623012	623017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752461
17049	NC_017066	TA	3	6	623047	623052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17050	NC_017066	TAA	2	6	623118	623123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17051	NC_017066	ATT	2	6	623230	623235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752462
17052	NC_017066	A	8	8	623291	623298	100 %	0 %	0 %	0 %	383752462
17053	NC_017066	GGAA	2	8	623348	623355	50 %	0 %	50 %	0 %	383752462
17054	NC_017066	A	6	6	623489	623494	100 %	0 %	0 %	0 %	383752462
17055	NC_017066	TA	3	6	623496	623501	50 %	50 %	0 %	0 %	383752462
17056	NC_017066	AAG	2	6	623509	623514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752462
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17058	NC_017066	AGT	2	6	623627	623632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752462
17059	NC_017066	TA	3	6	623657	623662	50 %	50 %	0 %	0 %	383752462
17060	NC_017066	TA	3	6	623736	623741	50 %	50 %	0 %	0 %	383752462
17061	NC_017066	AGA	2	6	623753	623758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752462
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17063	NC_017066	A	7	7	623886	623892	100 %	0 %	0 %	0 %	383752462
17064	NC_017066	GAC	2	6	623916	623921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752462
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17066	NC_017066	GAA	2	6	623994	623999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752462
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17068	NC_017066	GTT	2	6	624064	624069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752462
17069	NC_017066	ATTTA	2	10	624086	624095	40 %	60 %	0 %	0 %	383752462
17070	NC_017066	TTAAG	2	10	624105	624114	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17071	NC_017066	TAC	2	6	624135	624140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752463
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17074	NC_017066	AAT	2	6	624235	624240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752463
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17080	NC_017066	AGT	2	6	624398	624403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752463
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17082	NC_017066	TA	3	6	624461	624466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17083	NC_017066	TGA	2	6	624491	624496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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17087	NC_017066	AATT	2	8	624727	624734	50 %	50 %	0 %	0 %	383752464
17088	NC_017066	CTG	2	6	624753	624758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752464
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17093	NC_017066	CTG	2	6	624951	624956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752464
17094	NC_017066	TGC	2	6	624994	624999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752464
17095	NC_017066	AAGTA	2	10	625000	625009	60 %	20 %	20 %	0 %	383752464
17096	NC_017066	TAAT	2	8	625014	625021	50 %	50 %	0 %	0 %	383752464
17097	NC_017066	ATT	2	6	625051	625056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752464
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17101	NC_017066	GAA	2	6	625139	625144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752464
17102	NC_017066	A	6	6	625143	625148	100 %	0 %	0 %	0 %	383752464
17103	NC_017066	TCA	2	6	625191	625196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752464
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17105	NC_017066	CTT	2	6	625260	625265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752464
17106	NC_017066	AAAG	2	8	625270	625277	75 %	0 %	25 %	0 %	383752464
17107	NC_017066	ATT	2	6	625288	625293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752464
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17116	NC_017066	TAGT	2	8	625602	625609	25 %	50 %	25 %	0 %	383752464
17117	NC_017066	TA	3	6	625688	625693	50 %	50 %	0 %	0 %	383752464
17118	NC_017066	GTC	2	6	625740	625745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752464
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17121	NC_017066	ACT	2	6	625841	625846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752464
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17493	NC_017066	TCCA	2	8	639142	639149	25 %	25 %	0 %	50 %	383752474
17494	NC_017066	ATC	2	6	639174	639179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752474
17495	NC_017066	CT	3	6	639212	639217	0 %	50 %	0 %	50 %	383752474
17496	NC_017066	TCC	2	6	639222	639227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752474
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17498	NC_017066	ATA	2	6	639312	639317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752474
17499	NC_017066	AAAT	2	8	639333	639340	75 %	25 %	0 %	0 %	383752474
17500	NC_017066	AGTA	2	8	639399	639406	50 %	25 %	25 %	0 %	383752474

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