MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

< Previous12...2627282930313233343536...6061Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017066	ATT	2	6	550273	550278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_017066	AGA	2	6	550335	550340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_017066	TAAG	2	8	550363	550370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_017066	TTG	2	6	550449	550454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_017066	CAG	2	6	550464	550469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_017066	A	7	7	550505	550511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_017066	AT	3	6	550527	550532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_017066	TAA	2	6	550561	550566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_017066	AG	3	6	550571	550576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_017066	TAG	2	6	550604	550609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_017066	ATA	2	6	550618	550623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_017066	AAG	2	6	550639	550644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_017066	ATTA	2	8	550657	550664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_017066	A	6	6	550666	550671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_017066	GAT	2	6	550687	550692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_017066	A	6	6	550730	550735	100 %	0 %	0 %	0 %	383752415
15017	NC_017066	A	8	8	550738	550745	100 %	0 %	0 %	0 %	383752415
15018	NC_017066	TGA	2	6	550746	550751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752415
15019	NC_017066	AAT	2	6	550785	550790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752415
15020	NC_017066	A	6	6	550797	550802	100 %	0 %	0 %	0 %	383752415
15021	NC_017066	TAG	2	6	550809	550814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752415
15022	NC_017066	GAA	2	6	550876	550881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752415
15023	NC_017066	TA	3	6	550882	550887	50 %	50 %	0 %	0 %	383752415
15024	NC_017066	ATT	2	6	550918	550923	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752415
15025	NC_017066	TAG	2	6	550958	550963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752415
15026	NC_017066	GCA	2	6	551011	551016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752415
15027	NC_017066	AGC	2	6	551049	551054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752415
15028	NC_017066	TAC	2	6	551069	551074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752415
15029	NC_017066	ATG	2	6	551081	551086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752415
15030	NC_017066	TGA	2	6	551097	551102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752415
15031	NC_017066	AGA	2	6	551121	551126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752415
15032	NC_017066	A	6	6	551164	551169	100 %	0 %	0 %	0 %	383752415
15033	NC_017066	ACA	2	6	551250	551255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752415
15034	NC_017066	TAT	2	6	551301	551306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752415
15035	NC_017066	TAA	2	6	551331	551336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752415
15036	NC_017066	TAAA	2	8	551363	551370	75 %	25 %	0 %	0 %	383752415
15037	NC_017066	TGC	2	6	551403	551408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752415
15038	NC_017066	A	7	7	551444	551450	100 %	0 %	0 %	0 %	383752415
15039	NC_017066	TCA	2	6	551497	551502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752415
15040	NC_017066	TAA	2	6	551525	551530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752415
15041	NC_017066	TAA	3	9	551604	551612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752415
15042	NC_017066	ATT	2	6	551660	551665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752415
15043	NC_017066	AGA	2	6	551667	551672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752415
15044	NC_017066	ATAAAG	2	12	551810	551821	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383752415
15045	NC_017066	ACT	2	6	551824	551829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752415
15046	NC_017066	CAA	2	6	551887	551892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752415
15047	NC_017066	AATTTA	2	12	551899	551910	50 %	50 %	0 %	0 %	383752415
15048	NC_017066	CTA	2	6	552020	552025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752415
15049	NC_017066	AAG	2	6	552032	552037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752415
15050	NC_017066	AAG	2	6	552042	552047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752415
15051	NC_017066	AAT	2	6	552063	552068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_017066	TGG	2	6	552208	552213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752416
15053	NC_017066	ATC	2	6	552226	552231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752416
15054	NC_017066	GCC	2	6	552268	552273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752416
15055	NC_017066	TAG	2	6	552286	552291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752416
15056	NC_017066	TTA	2	6	552324	552329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752416
15057	NC_017066	TAC	2	6	552345	552350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752416
15058	NC_017066	AT	3	6	552403	552408	50 %	50 %	0 %	0 %	383752416
15059	NC_017066	TTC	2	6	552415	552420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752416
15060	NC_017066	TAAA	2	8	552424	552431	75 %	25 %	0 %	0 %	383752416
15061	NC_017066	T	7	7	552442	552448	0 %	100 %	0 %	0 %	383752416
15062	NC_017066	GT	3	6	552510	552515	0 %	50 %	50 %	0 %	383752416
15063	NC_017066	TA	4	8	552525	552532	50 %	50 %	0 %	0 %	383752416
15064	NC_017066	TTA	2	6	552533	552538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752416
15065	NC_017066	ATAA	2	8	552549	552556	75 %	25 %	0 %	0 %	383752416
15066	NC_017066	CAT	2	6	552558	552563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752416
15067	NC_017066	TAA	2	6	552589	552594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752416
15068	NC_017066	CCG	3	9	552647	552655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752416
15069	NC_017066	CCTGCT	2	12	552719	552730	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383752416
15070	NC_017066	TAG	2	6	552761	552766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752416
15071	NC_017066	TTC	2	6	552775	552780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752416
15072	NC_017066	CTT	2	6	552804	552809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752416
15073	NC_017066	TA	3	6	552824	552829	50 %	50 %	0 %	0 %	383752416
15074	NC_017066	TAA	2	6	552842	552847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752416
15075	NC_017066	GCT	2	6	552851	552856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752416
15076	NC_017066	TAAA	2	8	552886	552893	75 %	25 %	0 %	0 %	383752416
15077	NC_017066	AAT	2	6	552911	552916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752416
15078	NC_017066	ACT	2	6	552952	552957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752416
15079	NC_017066	ATT	2	6	553009	553014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752416
15080	NC_017066	CTC	2	6	553020	553025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752416
15081	NC_017066	T	6	6	553044	553049	0 %	100 %	0 %	0 %	383752416
15082	NC_017066	A	8	8	553066	553073	100 %	0 %	0 %	0 %	383752416
15083	NC_017066	TA	3	6	553129	553134	50 %	50 %	0 %	0 %	383752416
15084	NC_017066	TAT	2	6	553146	553151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752416
15085	NC_017066	GAG	2	6	553170	553175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752416
15086	NC_017066	GTA	2	6	553179	553184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752416
15087	NC_017066	TAAT	2	8	553200	553207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_017066	TATAT	2	10	553235	553244	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_017066	TA	3	6	553265	553270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_017066	TGA	2	6	553292	553297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752417
15091	NC_017066	A	6	6	553300	553305	100 %	0 %	0 %	0 %	383752417
15092	NC_017066	GA	3	6	553326	553331	50 %	0 %	50 %	0 %	383752417
15093	NC_017066	TTG	2	6	553367	553372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752417
15094	NC_017066	A	6	6	553378	553383	100 %	0 %	0 %	0 %	383752417
15095	NC_017066	CT	3	6	553396	553401	0 %	50 %	0 %	50 %	383752417
15096	NC_017066	TAC	2	6	553404	553409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752417
15097	NC_017066	GAA	2	6	553417	553422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752417
15098	NC_017066	AAT	2	6	553423	553428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752417
15099	NC_017066	AT	3	6	553434	553439	50 %	50 %	0 %	0 %	383752417
15100	NC_017066	A	6	6	553456	553461	100 %	0 %	0 %	0 %	383752417
15101	NC_017066	GAA	2	6	553606	553611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752417
15102	NC_017066	ATT	2	6	553633	553638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752417
15103	NC_017066	GAA	2	6	553645	553650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752417
15104	NC_017066	ATA	2	6	553664	553669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752417
15105	NC_017066	TAA	2	6	553704	553709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752417
15106	NC_017066	AATG	2	8	553716	553723	50 %	25 %	25 %	0 %	383752417
15107	NC_017066	ATT	2	6	553744	553749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752417
15108	NC_017066	TAA	2	6	553758	553763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752417
15109	NC_017066	TAA	2	6	553773	553778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752417
15110	NC_017066	AT	3	6	553802	553807	50 %	50 %	0 %	0 %	383752417
15111	NC_017066	AAACA	2	10	553835	553844	80 %	0 %	0 %	20 %	383752417
15112	NC_017066	TTA	2	6	553849	553854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752417
15113	NC_017066	GAA	2	6	553855	553860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752417
15114	NC_017066	ACT	2	6	553882	553887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752417
15115	NC_017066	TTA	2	6	553889	553894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752417
15116	NC_017066	GCAT	2	8	553932	553939	25 %	25 %	25 %	25 %	383752417
15117	NC_017066	GCA	2	6	553941	553946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752417
15118	NC_017066	A	6	6	553967	553972	100 %	0 %	0 %	0 %	383752417
15119	NC_017066	ATT	3	9	553982	553990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752417
15120	NC_017066	TGA	2	6	554025	554030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752417
15121	NC_017066	A	7	7	554059	554065	100 %	0 %	0 %	0 %	383752417
15122	NC_017066	AAG	2	6	554087	554092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752417
15123	NC_017066	CTGAAT	2	12	554105	554116	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383752417
15124	NC_017066	ATA	2	6	554213	554218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752417
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15245	NC_017066	AGTA	2	8	559267	559274	50 %	25 %	25 %	0 %	383752418
15246	NC_017066	TAG	2	6	559282	559287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752418
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15350	NC_017066	TAGA	2	8	563565	563572	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15351	NC_017066	T	7	7	563605	563611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15354	NC_017066	TTA	2	6	563743	563748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15355	NC_017066	ATTT	2	8	563753	563760	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15357	NC_017066	TAT	2	6	563826	563831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15358	NC_017066	ATT	2	6	563853	563858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15359	NC_017066	T	6	6	563897	563902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15360	NC_017066	AT	3	6	563955	563960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15361	NC_017066	ATT	2	6	563963	563968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752419
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15495	NC_017066	ATA	2	6	568833	568838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752423
15496	NC_017066	TAT	3	9	568869	568877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752423
15497	NC_017066	T	7	7	568879	568885	0 %	100 %	0 %	0 %	383752423
15498	NC_017066	ATT	2	6	568901	568906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752423
15499	NC_017066	A	8	8	568962	568969	100 %	0 %	0 %	0 %	383752423
15500	NC_017066	A	7	7	569020	569026	100 %	0 %	0 %	0 %	383752423

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