MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_017066	ATTT	2	8	532957	532964	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_017066	TTA	2	6	532965	532970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_017066	A	6	6	532970	532975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_017066	ATT	2	6	533009	533014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_017066	ATT	2	6	533055	533060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_017066	TTA	2	6	533074	533079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14509	NC_017066	CGTAAT	2	12	533239	533250	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383752402
14510	NC_017066	TTTAT	2	10	533280	533289	20 %	80 %	0 %	0 %	383752402
14511	NC_017066	TAA	2	6	533293	533298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752402
14512	NC_017066	ATT	2	6	533321	533326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752402
14513	NC_017066	GAAA	2	8	533371	533378	75 %	0 %	25 %	0 %	383752402
14514	NC_017066	CTG	2	6	533401	533406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752402
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14516	NC_017066	TGCT	2	8	533503	533510	0 %	50 %	25 %	25 %	383752402
14517	NC_017066	TGT	2	6	533517	533522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752402
14518	NC_017066	T	6	6	533546	533551	0 %	100 %	0 %	0 %	383752402
14519	NC_017066	AT	3	6	533563	533568	50 %	50 %	0 %	0 %	383752403
14520	NC_017066	ATA	2	6	533582	533587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752403
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14525	NC_017066	TATAA	2	10	533716	533725	60 %	40 %	0 %	0 %	383752403
14526	NC_017066	A	6	6	533776	533781	100 %	0 %	0 %	0 %	383752403
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14533	NC_017066	ATA	2	6	533922	533927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752403
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14536	NC_017066	T	6	6	533995	534000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14538	NC_017066	A	7	7	534021	534027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_017066	TAA	2	6	534041	534046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_017066	AATTT	2	10	534077	534086	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_017066	TA	3	6	534105	534110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_017066	CAA	3	9	534144	534152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752404
14543	NC_017066	ATT	2	6	534164	534169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752404
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14545	NC_017066	T	6	6	534192	534197	0 %	100 %	0 %	0 %	383752404
14546	NC_017066	T	7	7	534256	534262	0 %	100 %	0 %	0 %	383752404
14547	NC_017066	TAT	2	6	534267	534272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752404
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14553	NC_017066	TAC	2	6	534421	534426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752404
14554	NC_017066	AT	3	6	534429	534434	50 %	50 %	0 %	0 %	383752404
14555	NC_017066	TAT	2	6	534467	534472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752404
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14557	NC_017066	T	8	8	534597	534604	0 %	100 %	0 %	0 %	383752404
14558	NC_017066	T	6	6	534609	534614	0 %	100 %	0 %	0 %	383752404
14559	NC_017066	A	6	6	534620	534625	100 %	0 %	0 %	0 %	383752404
14560	NC_017066	GATAG	2	10	534638	534647	40 %	20 %	40 %	0 %	383752404
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14562	NC_017066	A	7	7	534687	534693	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_017066	ATT	2	6	534702	534707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_017066	TGT	2	6	534736	534741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14565	NC_017066	CTT	2	6	534785	534790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14606	NC_017066	T	7	7	536698	536704	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_017066	ATA	2	6	536718	536723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_017066	TTA	2	6	536727	536732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_017066	CGTGA	2	10	536733	536742	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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14611	NC_017066	TATT	2	8	536777	536784	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14619	NC_017066	TTG	2	6	537005	537010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14620	NC_017066	AT	3	6	537014	537019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_017066	TAT	2	6	537022	537027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14624	NC_017066	ATT	2	6	537128	537133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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