MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_017066	ACC	2	6	463744	463749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752344
12503	NC_017066	ACTAT	2	10	463754	463763	40 %	40 %	0 %	20 %	383752344
12504	NC_017066	TGA	2	6	463816	463821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752344
12505	NC_017066	TAT	2	6	463851	463856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752344
12506	NC_017066	CTTT	2	8	463868	463875	0 %	75 %	0 %	25 %	383752344
12507	NC_017066	ATA	2	6	463892	463897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752344
12508	NC_017066	T	7	7	463942	463948	0 %	100 %	0 %	0 %	383752344
12509	NC_017066	ATC	2	6	463996	464001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752344
12510	NC_017066	TAA	2	6	464037	464042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752344
12511	NC_017066	GTT	2	6	464074	464079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752344
12512	NC_017066	TTTTA	2	10	464086	464095	20 %	80 %	0 %	0 %	383752344
12513	NC_017066	AGC	2	6	464116	464121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752344
12514	NC_017066	ATA	2	6	464172	464177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752344
12515	NC_017066	T	6	6	464191	464196	0 %	100 %	0 %	0 %	383752344
12516	NC_017066	ACC	2	6	464221	464226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752344
12517	NC_017066	T	6	6	464261	464266	0 %	100 %	0 %	0 %	383752344
12518	NC_017066	AT	4	8	464285	464292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12519	NC_017066	A	6	6	464330	464335	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_017066	AT	3	6	464452	464457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12521	NC_017066	ATT	2	6	464500	464505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_017066	ATT	2	6	464547	464552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_017066	ATT	2	6	464581	464586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_017066	AAGAT	2	10	464599	464608	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_017066	ATT	2	6	464620	464625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_017066	ATA	2	6	464663	464668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12527	NC_017066	TAG	2	6	464677	464682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_017066	ATT	2	6	464726	464731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_017066	A	7	7	464756	464762	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_017066	CATA	2	8	464763	464770	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12531	NC_017066	AGA	2	6	464791	464796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_017066	T	6	6	464814	464819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12533	NC_017066	AT	3	6	464841	464846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12534	NC_017066	ATG	2	6	464859	464864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12535	NC_017066	CAA	2	6	464881	464886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12536	NC_017066	A	6	6	464885	464890	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_017066	TAA	2	6	464891	464896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_017066	CAA	2	6	464927	464932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12539	NC_017066	TAT	2	6	464933	464938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_017066	ATT	2	6	464943	464948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752345
12541	NC_017066	TAT	3	9	464964	464972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752345
12542	NC_017066	AT	3	6	464995	465000	50 %	50 %	0 %	0 %	383752345
12543	NC_017066	ATA	2	6	465003	465008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752345
12544	NC_017066	ATA	2	6	465017	465022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752345
12545	NC_017066	TGAAT	2	10	465087	465096	40 %	40 %	20 %	0 %	383752345
12546	NC_017066	CTG	2	6	465141	465146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752345
12547	NC_017066	AT	3	6	465182	465187	50 %	50 %	0 %	0 %	383752345
12548	NC_017066	TAG	2	6	465198	465203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752345
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12553	NC_017066	A	7	7	465339	465345	100 %	0 %	0 %	0 %	383752345
12554	NC_017066	CAT	2	6	465364	465369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752345
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12556	NC_017066	ACT	2	6	465418	465423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752345
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12598	NC_017066	TAC	2	6	466886	466891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752346
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12604	NC_017066	AT	3	6	467050	467055	50 %	50 %	0 %	0 %	383752346
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12614	NC_017066	TAA	2	6	467441	467446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752346
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