MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_017066	TA	3	6	408432	408437	50 %	50 %	0 %	0 %	383752300
11003	NC_017066	AAT	2	6	408472	408477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752300
11004	NC_017066	AAAG	2	8	408500	408507	75 %	0 %	25 %	0 %	383752300
11005	NC_017066	TAA	3	9	408513	408521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752300
11006	NC_017066	TGA	2	6	408522	408527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752300
11007	NC_017066	GCT	2	6	408535	408540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752300
11008	NC_017066	T	7	7	408630	408636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_017066	AT	3	6	408647	408652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11010	NC_017066	TTG	2	6	408656	408661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_017066	ATTA	2	8	408746	408753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_017066	ACT	2	6	408785	408790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_017066	TA	3	6	408802	408807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_017066	TA	3	6	408815	408820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_017066	CA	3	6	408889	408894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11016	NC_017066	TAT	2	6	408909	408914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11017	NC_017066	GTT	2	6	408932	408937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_017066	T	6	6	408961	408966	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_017066	ATT	2	6	408969	408974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11020	NC_017066	AAAGT	2	10	408991	409000	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11021	NC_017066	TTA	2	6	409059	409064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11022	NC_017066	TAA	2	6	409071	409076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11023	NC_017066	ATT	2	6	409081	409086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_017066	TAGT	2	8	409096	409103	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_017066	T	7	7	409123	409129	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_017066	TGT	2	6	409144	409149	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11027	NC_017066	ATT	2	6	409156	409161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_017066	TA	3	6	409168	409173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11029	NC_017066	TTG	2	6	409211	409216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11030	NC_017066	TAAA	2	8	409225	409232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11031	NC_017066	ATTA	2	8	409236	409243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11032	NC_017066	AATAAA	2	12	409253	409264	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_017066	AAT	2	6	409270	409275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_017066	TAT	2	6	409281	409286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_017066	CTTTAA	2	12	409339	409350	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11036	NC_017066	TAA	2	6	409363	409368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_017066	TTTA	2	8	409405	409412	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_017066	ATTT	2	8	409454	409461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_017066	ATTA	2	8	409499	409506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_017066	A	6	6	409534	409539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_017066	A	6	6	409546	409551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11042	NC_017066	AT	3	6	409565	409570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11043	NC_017066	ATAA	2	8	409599	409606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_017066	AAT	2	6	409713	409718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752301
11045	NC_017066	GCA	2	6	409719	409724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752301
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11048	NC_017066	TGT	2	6	409826	409831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752301
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11050	NC_017066	TGA	2	6	410027	410032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752301
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11053	NC_017066	TATT	2	8	410186	410193	25 %	75 %	0 %	0 %	383752301
11054	NC_017066	TAA	2	6	410291	410296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752301
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11059	NC_017066	TA	4	8	410493	410500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11062	NC_017066	A	7	7	410628	410634	100 %	0 %	0 %	0 %	383752302
11063	NC_017066	AAG	2	6	410637	410642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752302
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11074	NC_017066	ATC	2	6	411304	411309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752302
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11109	NC_017066	TTA	2	6	412716	412721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752304
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11112	NC_017066	A	6	6	412831	412836	100 %	0 %	0 %	0 %	383752304
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11120	NC_017066	TAC	2	6	413188	413193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752304
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11122	NC_017066	TA	3	6	413229	413234	50 %	50 %	0 %	0 %	383752304
11123	NC_017066	ATT	2	6	413241	413246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752304
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