MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017066	A	6	6	369710	369715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_017066	TGT	2	6	369747	369752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_017066	AGT	2	6	369764	369769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_017066	AAC	2	6	369786	369791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10005	NC_017066	TGCAAA	2	12	369807	369818	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10006	NC_017066	TTA	2	6	370122	370127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752271
10007	NC_017066	TGA	2	6	370147	370152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752271
10008	NC_017066	TAA	2	6	370224	370229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752271
10009	NC_017066	TGC	2	6	370236	370241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752271
10010	NC_017066	TG	3	6	370269	370274	0 %	50 %	50 %	0 %	383752271
10011	NC_017066	TTTA	2	8	370386	370393	25 %	75 %	0 %	0 %	383752271
10012	NC_017066	ATAA	2	8	370427	370434	75 %	25 %	0 %	0 %	383752271
10013	NC_017066	A	6	6	370463	370468	100 %	0 %	0 %	0 %	383752271
10014	NC_017066	AGA	3	9	370495	370503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752271
10015	NC_017066	TGA	2	6	370536	370541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752271
10016	NC_017066	TGA	2	6	370546	370551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752271
10017	NC_017066	AG	3	6	370592	370597	50 %	0 %	50 %	0 %	383752271
10018	NC_017066	ATT	2	6	370623	370628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752271
10019	NC_017066	T	6	6	370672	370677	0 %	100 %	0 %	0 %	383752271
10020	NC_017066	GAG	2	6	370898	370903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752271
10021	NC_017066	AC	3	6	371025	371030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10022	NC_017066	ATT	2	6	371125	371130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752272
10023	NC_017066	AATA	2	8	371158	371165	75 %	25 %	0 %	0 %	383752272
10024	NC_017066	TAAA	2	8	371202	371209	75 %	25 %	0 %	0 %	383752272
10025	NC_017066	TAA	2	6	371227	371232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752272
10026	NC_017066	TAG	2	6	371238	371243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752272
10027	NC_017066	TGT	2	6	371251	371256	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752272
10028	NC_017066	ATT	2	6	371290	371295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752272
10029	NC_017066	TCT	2	6	371306	371311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752272
10030	NC_017066	AGA	2	6	371323	371328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752272
10031	NC_017066	TGC	2	6	371359	371364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752272
10032	NC_017066	TAT	2	6	371445	371450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752272
10033	NC_017066	A	6	6	371550	371555	100 %	0 %	0 %	0 %	383752272
10034	NC_017066	ATG	2	6	371649	371654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752272
10035	NC_017066	AATA	2	8	371663	371670	75 %	25 %	0 %	0 %	383752272
10036	NC_017066	T	6	6	371730	371735	0 %	100 %	0 %	0 %	383752272
10037	NC_017066	CTA	2	6	371748	371753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752272
10038	NC_017066	AAAG	2	8	371795	371802	75 %	0 %	25 %	0 %	383752272
10039	NC_017066	TTG	2	6	371817	371822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752272
10040	NC_017066	A	6	6	371858	371863	100 %	0 %	0 %	0 %	383752272
10041	NC_017066	CTA	2	6	371919	371924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752272
10042	NC_017066	TAA	2	6	371932	371937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752272
10043	NC_017066	A	7	7	371990	371996	100 %	0 %	0 %	0 %	383752272
10044	NC_017066	TA	3	6	372000	372005	50 %	50 %	0 %	0 %	383752272
10045	NC_017066	TA	3	6	372033	372038	50 %	50 %	0 %	0 %	383752272
10046	NC_017066	TGG	3	9	372079	372087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752272
10047	NC_017066	TA	3	6	372125	372130	50 %	50 %	0 %	0 %	383752272
10048	NC_017066	GA	3	6	372159	372164	50 %	0 %	50 %	0 %	383752272
10049	NC_017066	TTG	2	6	372256	372261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752272
10050	NC_017066	TTA	2	6	372279	372284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752272
10051	NC_017066	A	6	6	372325	372330	100 %	0 %	0 %	0 %	383752272
10052	NC_017066	T	6	6	372450	372455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_017066	TGA	2	6	372546	372551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_017066	TAT	3	9	372580	372588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752273
10055	NC_017066	T	6	6	372600	372605	0 %	100 %	0 %	0 %	383752273
10056	NC_017066	T	6	6	372607	372612	0 %	100 %	0 %	0 %	383752273
10057	NC_017066	ATATT	2	10	372654	372663	40 %	60 %	0 %	0 %	383752273
10058	NC_017066	TTA	2	6	372792	372797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752273
10059	NC_017066	CAT	2	6	372862	372867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752273
10060	NC_017066	ATC	2	6	372974	372979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752273
10061	NC_017066	GTA	2	6	372981	372986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752273
10062	NC_017066	TTA	2	6	373026	373031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752273
10063	NC_017066	A	6	6	373037	373042	100 %	0 %	0 %	0 %	383752273
10064	NC_017066	T	8	8	373046	373053	0 %	100 %	0 %	0 %	383752273
10065	NC_017066	TGC	2	6	373055	373060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752273
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10070	NC_017066	CTGC	2	8	373180	373187	0 %	25 %	25 %	50 %	383752273
10071	NC_017066	CAA	2	6	373264	373269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752273
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10073	NC_017066	T	6	6	373381	373386	0 %	100 %	0 %	0 %	383752273
10074	NC_017066	ATT	2	6	373436	373441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752273
10075	NC_017066	ATA	2	6	373446	373451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752273
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10077	NC_017066	AT	3	6	373484	373489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10082	NC_017066	TAC	2	6	373662	373667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10084	NC_017066	ATT	2	6	373701	373706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_017066	A	7	7	373851	373857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10087	NC_017066	TA	3	6	373924	373929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10088	NC_017066	A	6	6	373960	373965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10089	NC_017066	T	7	7	373994	374000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10090	NC_017066	GTT	2	6	374069	374074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10093	NC_017066	TCA	2	6	374278	374283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752274
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10095	NC_017066	ATG	2	6	374349	374354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752274
10096	NC_017066	AAT	2	6	374475	374480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752274
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10103	NC_017066	TATAA	2	10	374712	374721	60 %	40 %	0 %	0 %	383752274
10104	NC_017066	AAT	2	6	374785	374790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752274
10105	NC_017066	TA	3	6	374796	374801	50 %	50 %	0 %	0 %	383752274
10106	NC_017066	TTA	2	6	374836	374841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752274
10107	NC_017066	GTA	2	6	374857	374862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752274
10108	NC_017066	TAAA	2	8	374907	374914	75 %	25 %	0 %	0 %	383752274
10109	NC_017066	AT	3	6	374938	374943	50 %	50 %	0 %	0 %	383752274
10110	NC_017066	TAA	2	6	374972	374977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752274
10111	NC_017066	ATA	2	6	375001	375006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752274
10112	NC_017066	TTG	2	6	375083	375088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10113	NC_017066	TG	3	6	375087	375092	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_017066	GTG	2	6	375131	375136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_017066	ATT	2	6	375161	375166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_017066	AT	3	6	375191	375196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_017066	TAATT	2	10	375212	375221	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_017066	TAAT	2	8	375273	375280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10119	NC_017066	CTA	2	6	375287	375292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752275
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10123	NC_017066	GCA	2	6	375334	375339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752275
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10498	NC_017066	GTA	2	6	390116	390121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752285
10499	NC_017066	AG	3	6	390151	390156	50 %	0 %	50 %	0 %	383752285
10500	NC_017066	TTA	2	6	390181	390186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752285

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