MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_017066	AT	3	6	332392	332397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9003	NC_017066	TAT	2	6	332523	332528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9004	NC_017066	GTA	2	6	332555	332560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9005	NC_017066	ATT	2	6	332585	332590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9006	NC_017066	T	8	8	332599	332606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9007	NC_017066	TA	3	6	332660	332665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_017066	TAA	2	6	332678	332683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9009	NC_017066	AT	3	6	332708	332713	50 %	50 %	0 %	0 %	383752244
9010	NC_017066	TAT	2	6	332729	332734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752244
9011	NC_017066	CGC	2	6	332788	332793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752244
9012	NC_017066	GATA	2	8	332813	332820	50 %	25 %	25 %	0 %	383752244
9013	NC_017066	ATTT	2	8	332842	332849	25 %	75 %	0 %	0 %	383752244
9014	NC_017066	AAT	2	6	332850	332855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752244
9015	NC_017066	TAG	2	6	332876	332881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752244
9016	NC_017066	TTA	2	6	332896	332901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752244
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9018	NC_017066	TTAAA	2	10	332965	332974	60 %	40 %	0 %	0 %	383752244
9019	NC_017066	ATT	2	6	332984	332989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752244
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9021	NC_017066	A	7	7	333010	333016	100 %	0 %	0 %	0 %	383752244
9022	NC_017066	CAAA	2	8	333090	333097	75 %	0 %	0 %	25 %	383752244
9023	NC_017066	GC	3	6	333105	333110	0 %	0 %	50 %	50 %	383752244
9024	NC_017066	TACT	2	8	333124	333131	25 %	50 %	0 %	25 %	383752244
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9027	NC_017066	TATT	2	8	333209	333216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9028	NC_017066	ATTTA	2	10	333219	333228	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9029	NC_017066	AT	3	6	333274	333279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9031	NC_017066	T	6	6	333303	333308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9032	NC_017066	AT	3	6	333436	333441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9033	NC_017066	A	6	6	333455	333460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9035	NC_017066	ATTTT	2	10	333490	333499	20 %	80 %	0 %	0 %	383752245
9036	NC_017066	TTA	2	6	333500	333505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752245
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9048	NC_017066	CAT	2	6	334162	334167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752245
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9051	NC_017066	ATTTG	2	10	334381	334390	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9052	NC_017066	TTA	2	6	334394	334399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9053	NC_017066	TCT	2	6	334415	334420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9054	NC_017066	T	6	6	334428	334433	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9055	NC_017066	GCATTA	2	12	334451	334462	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9056	NC_017066	CTG	2	6	334482	334487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9057	NC_017066	TTC	2	6	334492	334497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9058	NC_017066	T	6	6	334572	334577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9059	NC_017066	ATT	2	6	334602	334607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9060	NC_017066	T	6	6	334606	334611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9061	NC_017066	TAT	2	6	334634	334639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9062	NC_017066	TTG	2	6	334710	334715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9063	NC_017066	T	6	6	334718	334723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9103	NC_017066	ATA	2	6	336711	336716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9109	NC_017066	GTA	2	6	336882	336887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9111	NC_017066	TA	3	6	336908	336913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9112	NC_017066	GTT	2	6	337057	337062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9113	NC_017066	TTAT	2	8	337085	337092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9114	NC_017066	AATAA	2	10	337129	337138	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9118	NC_017066	GAT	2	6	337276	337281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9121	NC_017066	AT	3	6	337335	337340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9122	NC_017066	TGA	2	6	337361	337366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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9125	NC_017066	ATT	2	6	337430	337435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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