MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8502	NC_017066	ATT	2	6	313967	313972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752228
8503	NC_017066	GAA	3	9	314040	314048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752228
8504	NC_017066	A	7	7	314051	314057	100 %	0 %	0 %	0 %	383752228
8505	NC_017066	A	6	6	314069	314074	100 %	0 %	0 %	0 %	383752228
8506	NC_017066	TAA	3	9	314096	314104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752228
8507	NC_017066	AAT	2	6	314178	314183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752228
8508	NC_017066	AGA	2	6	314195	314200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752228
8509	NC_017066	A	6	6	314216	314221	100 %	0 %	0 %	0 %	383752228
8510	NC_017066	TAA	2	6	314240	314245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752228
8511	NC_017066	TAAA	2	8	314251	314258	75 %	25 %	0 %	0 %	383752228
8512	NC_017066	A	6	6	314256	314261	100 %	0 %	0 %	0 %	383752228
8513	NC_017066	TGGA	2	8	314281	314288	25 %	25 %	50 %	0 %	383752228
8514	NC_017066	TAC	2	6	314412	314417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8515	NC_017066	GCAAT	2	10	314448	314457	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8516	NC_017066	A	7	7	314471	314477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8517	NC_017066	TGTT	2	8	314481	314488	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8518	NC_017066	CGTA	2	8	314490	314497	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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8520	NC_017066	T	6	6	314525	314530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8522	NC_017066	ATT	2	6	314568	314573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8523	NC_017066	TTA	2	6	314610	314615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8524	NC_017066	TA	3	6	314652	314657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8525	NC_017066	AAT	2	6	314668	314673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8526	NC_017066	T	6	6	314730	314735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8528	NC_017066	T	7	7	314775	314781	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8531	NC_017066	ATT	2	6	314995	315000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8532	NC_017066	CTGGTT	2	12	315025	315036	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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8535	NC_017066	TTG	2	6	315182	315187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8536	NC_017066	AT	4	8	315224	315231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8537	NC_017066	AT	3	6	315242	315247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8538	NC_017066	TAT	2	6	315292	315297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8541	NC_017066	ATT	2	6	315416	315421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8542	NC_017066	TTTA	2	8	315433	315440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8544	NC_017066	A	6	6	315450	315455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8545	NC_017066	TTA	2	6	315456	315461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8546	NC_017066	ATC	2	6	315477	315482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8547	NC_017066	T	7	7	315511	315517	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8548	NC_017066	TATT	2	8	315525	315532	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8549	NC_017066	AT	5	10	315534	315543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8550	NC_017066	T	6	6	315549	315554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8551	NC_017066	TA	3	6	315578	315583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8552	NC_017066	TA	3	6	315585	315590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8555	NC_017066	TAT	2	6	315791	315796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8559	NC_017066	TTTG	2	8	315911	315918	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8560	NC_017066	TAT	2	6	315951	315956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8562	NC_017066	ATAC	2	8	315993	316000	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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8564	NC_017066	ATA	2	6	316018	316023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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