MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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8002	NC_017066	TGA	2	6	296526	296531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752212
8003	NC_017066	A	6	6	296560	296565	100 %	0 %	0 %	0 %	383752212
8004	NC_017066	AAG	2	6	296616	296621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752212
8005	NC_017066	GAT	2	6	296669	296674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752212
8006	NC_017066	ATA	2	6	296699	296704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_017066	ATTT	2	8	296742	296749	25 %	75 %	0 %	0 %	383752213
8008	NC_017066	ATT	2	6	296753	296758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752213
8009	NC_017066	AT	4	8	296770	296777	50 %	50 %	0 %	0 %	383752213
8010	NC_017066	T	6	6	296803	296808	0 %	100 %	0 %	0 %	383752213
8011	NC_017066	CTA	2	6	296853	296858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752213
8012	NC_017066	TATT	2	8	296866	296873	25 %	75 %	0 %	0 %	383752213
8013	NC_017066	T	6	6	296872	296877	0 %	100 %	0 %	0 %	383752213
8014	NC_017066	TGA	2	6	296908	296913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752213
8015	NC_017066	AAT	2	6	296938	296943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752213
8016	NC_017066	CAC	2	6	296964	296969	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752213
8017	NC_017066	T	6	6	297098	297103	0 %	100 %	0 %	0 %	383752213
8018	NC_017066	CAGT	2	8	297143	297150	25 %	25 %	25 %	25 %	383752213
8019	NC_017066	AGA	2	6	297232	297237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752213
8020	NC_017066	TTA	2	6	297323	297328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752213
8021	NC_017066	CGG	2	6	297352	297357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752213
8022	NC_017066	AGA	2	6	297394	297399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752213
8023	NC_017066	ACT	2	6	297421	297426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752213
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8025	NC_017066	ATT	2	6	297455	297460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_017066	ATG	2	6	297521	297526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_017066	TTA	2	6	297531	297536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_017066	TAA	2	6	297600	297605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752214
8029	NC_017066	TTA	2	6	297621	297626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752214
8030	NC_017066	TAG	2	6	297676	297681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752214
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8034	NC_017066	AT	3	6	297836	297841	50 %	50 %	0 %	0 %	383752214
8035	NC_017066	CAA	2	6	297854	297859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752214
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8039	NC_017066	A	7	7	297965	297971	100 %	0 %	0 %	0 %	383752214
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8041	NC_017066	TTA	2	6	298058	298063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752214
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8043	NC_017066	TAG	2	6	298132	298137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752214
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8045	NC_017066	A	6	6	298156	298161	100 %	0 %	0 %	0 %	383752214
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8048	NC_017066	AT	3	6	298268	298273	50 %	50 %	0 %	0 %	383752214
8049	NC_017066	TTCT	2	8	298275	298282	0 %	75 %	0 %	25 %	383752214
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8054	NC_017066	ATT	2	6	298396	298401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752215
8055	NC_017066	TA	3	6	298477	298482	50 %	50 %	0 %	0 %	383752215
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8058	NC_017066	TAA	2	6	298560	298565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752215
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8060	NC_017066	AAGGC	2	10	298603	298612	40 %	0 %	40 %	20 %	383752215
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8098	NC_017066	ATA	2	6	299944	299949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8099	NC_017066	A	6	6	299963	299968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8111	NC_017066	GCTCT	2	10	300290	300299	0 %	40 %	20 %	40 %	383752217
8112	NC_017066	CAT	2	6	300346	300351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752217
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8115	NC_017066	AT	3	6	300488	300493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8118	NC_017066	ATTA	3	12	300595	300606	50 %	50 %	0 %	0 %	383752218
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8122	NC_017066	ATT	2	6	300733	300738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752218
8123	NC_017066	TAC	2	6	300748	300753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752218
8124	NC_017066	TATT	2	8	300791	300798	25 %	75 %	0 %	0 %	383752218
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