MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7502	NC_017066	TAT	2	6	278772	278777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752197
7503	NC_017066	TAA	2	6	278784	278789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752197
7504	NC_017066	GTAC	2	8	278846	278853	25 %	25 %	25 %	25 %	383752197
7505	NC_017066	GCT	2	6	278921	278926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752197
7506	NC_017066	AGGGC	2	10	278930	278939	20 %	0 %	60 %	20 %	383752197
7507	NC_017066	GCA	3	9	278942	278950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752197
7508	NC_017066	GCT	2	6	278966	278971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752197
7509	NC_017066	A	6	6	278990	278995	100 %	0 %	0 %	0 %	383752197
7510	NC_017066	TTA	2	6	279003	279008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752197
7511	NC_017066	GCT	2	6	279095	279100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752197
7512	NC_017066	ATT	2	6	279178	279183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752197
7513	NC_017066	AAGT	2	8	279189	279196	50 %	25 %	25 %	0 %	383752197
7514	NC_017066	GCT	2	6	279202	279207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752197
7515	NC_017066	TAC	3	9	279271	279279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752197
7516	NC_017066	AGG	2	6	279310	279315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752197
7517	NC_017066	GTT	2	6	279407	279412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752197
7518	NC_017066	TGC	2	6	279454	279459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752197
7519	NC_017066	ATT	2	6	279631	279636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752197
7520	NC_017066	GAA	2	6	279692	279697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752197
7521	NC_017066	AGA	2	6	279779	279784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752198
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7523	NC_017066	AT	3	6	279859	279864	50 %	50 %	0 %	0 %	383752198
7524	NC_017066	GAA	3	9	279894	279902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752198
7525	NC_017066	ATA	2	6	279985	279990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752198
7526	NC_017066	GAA	2	6	280014	280019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752198
7527	NC_017066	TAG	2	6	280093	280098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752198
7528	NC_017066	AG	3	6	280132	280137	50 %	0 %	50 %	0 %	383752198
7529	NC_017066	GTA	2	6	280141	280146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752198
7530	NC_017066	CAT	2	6	280155	280160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7531	NC_017066	AT	3	6	280168	280173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_017066	AGC	2	6	280191	280196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7533	NC_017066	AAC	2	6	280209	280214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7534	NC_017066	ATT	3	9	280268	280276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7535	NC_017066	TAAA	2	8	280291	280298	75 %	25 %	0 %	0 %	383752199
7536	NC_017066	ATT	2	6	280310	280315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752199
7537	NC_017066	TAT	2	6	280327	280332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752199
7538	NC_017066	TTG	2	6	280387	280392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752199
7539	NC_017066	T	7	7	280448	280454	0 %	100 %	0 %	0 %	383752199
7540	NC_017066	T	6	6	280470	280475	0 %	100 %	0 %	0 %	383752199
7541	NC_017066	A	7	7	280483	280489	100 %	0 %	0 %	0 %	383752199
7542	NC_017066	AT	3	6	280495	280500	50 %	50 %	0 %	0 %	383752199
7543	NC_017066	GATC	2	8	280553	280560	25 %	25 %	25 %	25 %	383752199
7544	NC_017066	AG	3	6	280563	280568	50 %	0 %	50 %	0 %	383752199
7545	NC_017066	AATGAA	2	12	280572	280583	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383752199
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7547	NC_017066	CAA	2	6	280783	280788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752199
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7552	NC_017066	CTA	2	6	280948	280953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752199
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7554	NC_017066	A	7	7	281008	281014	100 %	0 %	0 %	0 %	383752199
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7557	NC_017066	ACT	2	6	281094	281099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752199
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7567	NC_017066	AAGA	2	8	281284	281291	75 %	0 %	25 %	0 %	383752199
7568	NC_017066	A	7	7	281315	281321	100 %	0 %	0 %	0 %	383752199
7569	NC_017066	CTTTAG	2	12	281386	281397	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383752199
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7574	NC_017066	TGA	3	9	281561	281569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752199
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7582	NC_017066	ATCT	2	8	281746	281753	25 %	50 %	0 %	25 %	383752199
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7588	NC_017066	TGT	2	6	282114	282119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7589	NC_017066	AAT	2	6	282141	282146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7590	NC_017066	TAA	2	6	282149	282154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7591	NC_017066	TAGTT	2	10	282189	282198	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7592	NC_017066	TTAA	3	12	282207	282218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7593	NC_017066	AT	3	6	282225	282230	50 %	50 %	0 %	0 %	383752200
7594	NC_017066	TAA	3	9	282249	282257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752200
7595	NC_017066	AGAAA	2	10	282258	282267	80 %	0 %	20 %	0 %	383752200
7596	NC_017066	GTAT	2	8	282347	282354	25 %	50 %	25 %	0 %	383752200
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7603	NC_017066	GTA	2	6	282578	282583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752200
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7605	NC_017066	GTA	2	6	282640	282645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752200
7606	NC_017066	CAA	2	6	282682	282687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752200
7607	NC_017066	TA	3	6	282695	282700	50 %	50 %	0 %	0 %	383752200
7608	NC_017066	ACATT	2	10	282814	282823	40 %	40 %	0 %	20 %	383752200
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7612	NC_017066	TAA	2	6	282938	282943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752200
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7615	NC_017066	TTG	2	6	283068	283073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752200
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7622	NC_017066	GTT	2	6	283258	283263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752200
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