MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017066	ATC	2	6	260741	260746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_017066	AAT	2	6	260747	260752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_017066	GTA	2	6	260782	260787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_017066	ATT	2	6	260797	260802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_017066	TCA	2	6	260803	260808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7006	NC_017066	ACA	2	6	260823	260828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7007	NC_017066	TAT	2	6	260838	260843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_017066	AT	3	6	260842	260847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_017066	AGT	2	6	260857	260862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_017066	TA	3	6	260869	260874	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_017066	TTA	2	6	260950	260955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_017066	T	6	6	260966	260971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_017066	ATT	2	6	260989	260994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7014	NC_017066	TAA	2	6	261010	261015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_017066	AT	3	6	261042	261047	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_017066	ATTTTC	2	12	261099	261110	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7017	NC_017066	TAA	2	6	261146	261151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_017066	TTA	2	6	261152	261157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_017066	A	6	6	261176	261181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_017066	AT	3	6	261196	261201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_017066	T	6	6	261274	261279	0 %	100 %	0 %	0 %	383752185
7022	NC_017066	TA	3	6	261295	261300	50 %	50 %	0 %	0 %	383752185
7023	NC_017066	GCAT	2	8	261303	261310	25 %	25 %	25 %	25 %	383752185
7024	NC_017066	AATA	2	8	261341	261348	75 %	25 %	0 %	0 %	383752185
7025	NC_017066	GAAAAT	2	12	261361	261372	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383752185
7026	NC_017066	CAG	2	6	261377	261382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752185
7027	NC_017066	TTA	2	6	261459	261464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752185
7028	NC_017066	AAT	2	6	261506	261511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752185
7029	NC_017066	TGTTT	2	10	261525	261534	0 %	80 %	20 %	0 %	383752185
7030	NC_017066	TGA	2	6	261538	261543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752185
7031	NC_017066	CAG	2	6	261547	261552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752185
7032	NC_017066	A	6	6	261621	261626	100 %	0 %	0 %	0 %	383752185
7033	NC_017066	TGC	2	6	261725	261730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752185
7034	NC_017066	CTAT	2	8	261786	261793	25 %	50 %	0 %	25 %	383752185
7035	NC_017066	TG	3	6	261832	261837	0 %	50 %	50 %	0 %	383752185
7036	NC_017066	GT	3	6	261856	261861	0 %	50 %	50 %	0 %	383752185
7037	NC_017066	AAC	2	6	261892	261897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752185
7038	NC_017066	ATT	2	6	261974	261979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752185
7039	NC_017066	TAA	2	6	262024	262029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752185
7040	NC_017066	TG	3	6	262036	262041	0 %	50 %	50 %	0 %	383752185
7041	NC_017066	TCA	2	6	262056	262061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752185
7042	NC_017066	ATTTA	2	10	262067	262076	40 %	60 %	0 %	0 %	383752185
7043	NC_017066	CAA	2	6	262101	262106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752185
7044	NC_017066	T	6	6	262118	262123	0 %	100 %	0 %	0 %	383752185
7045	NC_017066	TAA	2	6	262168	262173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752185
7046	NC_017066	TAT	2	6	262180	262185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752185
7047	NC_017066	TAA	2	6	262193	262198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752185
7048	NC_017066	CTT	2	6	262204	262209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752185
7049	NC_017066	TAT	2	6	262220	262225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752185
7050	NC_017066	CGCT	2	8	262284	262291	0 %	25 %	25 %	50 %	383752185
7051	NC_017066	TTTA	2	8	262426	262433	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_017066	TAA	2	6	262438	262443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_017066	TAT	2	6	262450	262455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7054	NC_017066	TAA	2	6	262463	262468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_017066	ATT	2	6	262532	262537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_017066	AGT	2	6	262568	262573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_017066	TTAA	2	8	262598	262605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_017066	TATG	2	8	262614	262621	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_017066	TAA	2	6	262629	262634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_017066	TAT	2	6	262750	262755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_017066	AAT	2	6	262778	262783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_017066	A	6	6	262809	262814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7063	NC_017066	TA	3	6	262880	262885	50 %	50 %	0 %	0 %	383752186
7064	NC_017066	T	6	6	262894	262899	0 %	100 %	0 %	0 %	383752186
7065	NC_017066	AAT	2	6	262900	262905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752186
7066	NC_017066	TG	3	6	262908	262913	0 %	50 %	50 %	0 %	383752186
7067	NC_017066	CAT	2	6	262919	262924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752186
7068	NC_017066	TGC	2	6	262931	262936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752186
7069	NC_017066	AAT	2	6	263021	263026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752186
7070	NC_017066	ACT	2	6	263067	263072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752186
7071	NC_017066	TCA	2	6	263080	263085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752186
7072	NC_017066	T	6	6	263104	263109	0 %	100 %	0 %	0 %	383752186
7073	NC_017066	ATT	2	6	263157	263162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752186
7074	NC_017066	CA	3	6	263174	263179	50 %	0 %	0 %	50 %	383752186
7075	NC_017066	TGC	2	6	263226	263231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752186
7076	NC_017066	GCT	2	6	263236	263241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752186
7077	NC_017066	TCA	2	6	263251	263256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752186
7078	NC_017066	T	7	7	263268	263274	0 %	100 %	0 %	0 %	383752186
7079	NC_017066	TCT	2	6	263404	263409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752186
7080	NC_017066	TAA	2	6	263435	263440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752186
7081	NC_017066	AGT	2	6	263442	263447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752186
7082	NC_017066	CTA	2	6	263468	263473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752186
7083	NC_017066	TAT	2	6	263510	263515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752186
7084	NC_017066	ATT	4	12	263523	263534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752186
7085	NC_017066	AAT	2	6	263565	263570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752186
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7089	NC_017066	ATA	2	6	263787	263792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752186
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7091	NC_017066	AG	3	6	263830	263835	50 %	0 %	50 %	0 %	383752186
7092	NC_017066	CAA	2	6	263984	263989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752186
7093	NC_017066	ATAAA	2	10	264074	264083	80 %	20 %	0 %	0 %	383752186
7094	NC_017066	AAT	2	6	264135	264140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752186
7095	NC_017066	ATC	2	6	264181	264186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752186
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7097	NC_017066	AAT	2	6	264332	264337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752186
7098	NC_017066	CCA	2	6	264369	264374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752186
7099	NC_017066	TCA	2	6	264430	264435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752186
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7101	NC_017066	AAT	2	6	264492	264497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752186
7102	NC_017066	AAATA	2	10	264501	264510	80 %	20 %	0 %	0 %	383752186
7103	NC_017066	TAATTT	2	12	264530	264541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752186
7104	NC_017066	A	6	6	264553	264558	100 %	0 %	0 %	0 %	383752186
7105	NC_017066	TGT	3	9	264642	264650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_017066	TTA	2	6	264655	264660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_017066	ATT	2	6	264667	264672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_017066	ATA	2	6	264712	264717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7109	NC_017066	CTT	2	6	264729	264734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_017066	AAT	2	6	264741	264746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_017066	TAA	2	6	264805	264810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752187
7112	NC_017066	T	6	6	264811	264816	0 %	100 %	0 %	0 %	383752187
7113	NC_017066	AGA	2	6	264817	264822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752187
7114	NC_017066	AT	3	6	264865	264870	50 %	50 %	0 %	0 %	383752187
7115	NC_017066	CAAG	2	8	264875	264882	50 %	0 %	25 %	25 %	383752187
7116	NC_017066	TTA	2	6	264884	264889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752187
7117	NC_017066	ATG	2	6	264915	264920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752187
7118	NC_017066	TAA	3	9	265033	265041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752187
7119	NC_017066	TG	3	6	265082	265087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_017066	T	6	6	265091	265096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_017066	A	6	6	265105	265110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_017066	TA	3	6	265128	265133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_017066	TCAGGA	2	12	265194	265205	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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7125	NC_017066	ATA	2	6	265279	265284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752188
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