MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017066	T	6	6	240942	240947	0 %	100 %	0 %	0 %	383752172
6502	NC_017066	T	6	6	240966	240971	0 %	100 %	0 %	0 %	383752172
6503	NC_017066	GAAG	2	8	241079	241086	50 %	0 %	50 %	0 %	383752173
6504	NC_017066	TCCA	2	8	241099	241106	25 %	25 %	0 %	50 %	383752173
6505	NC_017066	TTC	2	6	241108	241113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752173
6506	NC_017066	AAT	2	6	241120	241125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752173
6507	NC_017066	T	7	7	241198	241204	0 %	100 %	0 %	0 %	383752173
6508	NC_017066	TGT	2	6	241209	241214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752173
6509	NC_017066	TTC	3	9	241219	241227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752173
6510	NC_017066	CAAG	2	8	241250	241257	50 %	0 %	25 %	25 %	383752173
6511	NC_017066	T	6	6	241341	241346	0 %	100 %	0 %	0 %	383752173
6512	NC_017066	CTT	2	6	241347	241352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752173
6513	NC_017066	CAT	2	6	241353	241358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752173
6514	NC_017066	TAA	2	6	241362	241367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752173
6515	NC_017066	TA	3	6	241425	241430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_017066	ATT	2	6	241440	241445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6517	NC_017066	ATTAAT	2	12	241472	241483	50 %	50 %	0 %	0 %	383752174
6518	NC_017066	AT	3	6	241498	241503	50 %	50 %	0 %	0 %	383752174
6519	NC_017066	T	6	6	241503	241508	0 %	100 %	0 %	0 %	383752174
6520	NC_017066	TTAA	2	8	241539	241546	50 %	50 %	0 %	0 %	383752174
6521	NC_017066	TAT	2	6	241579	241584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
6522	NC_017066	ATTA	2	8	241595	241602	50 %	50 %	0 %	0 %	383752174
6523	NC_017066	GTT	2	6	241629	241634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752174
6524	NC_017066	TAT	2	6	241640	241645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
6525	NC_017066	ATT	2	6	241683	241688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
6526	NC_017066	TCT	2	6	241689	241694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752174
6527	NC_017066	TAA	2	6	241697	241702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752174
6528	NC_017066	TAG	2	6	241705	241710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752174
6529	NC_017066	AATCTC	2	12	241751	241762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752174
6530	NC_017066	AT	3	6	241807	241812	50 %	50 %	0 %	0 %	383752174
6531	NC_017066	T	6	6	241819	241824	0 %	100 %	0 %	0 %	383752174
6532	NC_017066	ATA	2	6	241840	241845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752174
6533	NC_017066	GGT	2	6	241902	241907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752174
6534	NC_017066	AT	3	6	241972	241977	50 %	50 %	0 %	0 %	383752174
6535	NC_017066	TTA	2	6	242023	242028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
6536	NC_017066	T	6	6	242062	242067	0 %	100 %	0 %	0 %	383752174
6537	NC_017066	TAC	2	6	242108	242113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752174
6538	NC_017066	ATCA	2	8	242114	242121	50 %	25 %	0 %	25 %	383752174
6539	NC_017066	ATTT	2	8	242213	242220	25 %	75 %	0 %	0 %	383752174
6540	NC_017066	TA	3	6	242230	242235	50 %	50 %	0 %	0 %	383752174
6541	NC_017066	GTC	2	6	242262	242267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752174
6542	NC_017066	CTA	2	6	242272	242277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752174
6543	NC_017066	GT	3	6	242340	242345	0 %	50 %	50 %	0 %	383752174
6544	NC_017066	GTT	2	6	242365	242370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752174
6545	NC_017066	TTA	2	6	242382	242387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
6546	NC_017066	ATA	2	6	242394	242399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752174
6547	NC_017066	ATT	2	6	242402	242407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
6548	NC_017066	CT	3	6	242412	242417	0 %	50 %	0 %	50 %	383752174
6549	NC_017066	T	7	7	242441	242447	0 %	100 %	0 %	0 %	383752174
6550	NC_017066	TTA	2	6	242487	242492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
6551	NC_017066	TAC	2	6	242510	242515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752174
6552	NC_017066	TCG	2	6	242523	242528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752174
6553	NC_017066	CCA	2	6	242529	242534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752174
6554	NC_017066	CTT	2	6	242575	242580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752174
6555	NC_017066	ACC	2	6	242609	242614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752174
6556	NC_017066	ATT	2	6	242736	242741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
6557	NC_017066	ATT	2	6	242798	242803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
6558	NC_017066	T	6	6	242802	242807	0 %	100 %	0 %	0 %	383752174
6559	NC_017066	T	6	6	242826	242831	0 %	100 %	0 %	0 %	383752174
6560	NC_017066	TAAA	2	8	242835	242842	75 %	25 %	0 %	0 %	383752174
6561	NC_017066	CTG	2	6	242848	242853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752174
6562	NC_017066	TTA	2	6	242877	242882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
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6566	NC_017066	TAT	2	6	243010	243015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
6567	NC_017066	TAT	2	6	243020	243025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752174
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6570	NC_017066	TAG	2	6	243106	243111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752174
6571	NC_017066	TAG	2	6	243130	243135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752174
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6580	NC_017066	TAAA	2	8	243384	243391	75 %	25 %	0 %	0 %	383752175
6581	NC_017066	TCA	2	6	243467	243472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752175
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6588	NC_017066	AAT	2	6	243696	243701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752175
6589	NC_017066	TAT	2	6	243721	243726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_017066	TTA	2	6	243735	243740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_017066	TGCAA	2	10	243758	243767	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6592	NC_017066	ACT	2	6	243850	243855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6593	NC_017066	ATT	2	6	243877	243882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6595	NC_017066	TAT	2	6	244137	244142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752176
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6599	NC_017066	TTA	2	6	244277	244282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752176
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6605	NC_017066	ATT	2	6	244697	244702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752177
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6607	NC_017066	T	6	6	244721	244726	0 %	100 %	0 %	0 %	383752177
6608	NC_017066	TAT	2	6	244735	244740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752177
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6614	NC_017066	CT	3	6	245027	245032	0 %	50 %	0 %	50 %	383752177
6615	NC_017066	CTA	2	6	245047	245052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752177
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