MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. TH1527 chromosome

Total Repeats: 30284

< Previous12...7891011121314151617...6061Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017066	AAT	2	6	204444	204449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5502	NC_017066	GTT	2	6	204455	204460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_017066	ACAA	2	8	204486	204493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5504	NC_017066	ATTTTA	2	12	204495	204506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_017066	A	6	6	204510	204515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_017066	A	6	6	204588	204593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_017066	AAG	2	6	204597	204602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017066	TAT	2	6	204614	204619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017066	TAA	2	6	204634	204639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017066	ATA	2	6	204655	204660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017066	TTG	3	9	204661	204669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_017066	ATT	2	6	204699	204704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017066	CAAA	2	8	204872	204879	75 %	0 %	0 %	25 %	383752148
5514	NC_017066	AGG	2	6	204892	204897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383752148
5515	NC_017066	TTA	2	6	204898	204903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752148
5516	NC_017066	GAT	2	6	204923	204928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752148
5517	NC_017066	ATT	2	6	204936	204941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752148
5518	NC_017066	GAT	2	6	204950	204955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752148
5519	NC_017066	ACA	2	6	204981	204986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383752148
5520	NC_017066	ACC	2	6	205007	205012	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752148
5521	NC_017066	TTA	2	6	205020	205025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752148
5522	NC_017066	GCTT	2	8	205070	205077	0 %	50 %	25 %	25 %	383752148
5523	NC_017066	CTT	2	6	205080	205085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752148
5524	NC_017066	A	6	6	205098	205103	100 %	0 %	0 %	0 %	383752148
5525	NC_017066	GCA	2	6	205137	205142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752148
5526	NC_017066	TGA	2	6	205309	205314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752148
5527	NC_017066	GAA	2	6	205317	205322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752148
5528	NC_017066	A	6	6	205334	205339	100 %	0 %	0 %	0 %	383752148
5529	NC_017066	GTT	2	6	205398	205403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752148
5530	NC_017066	AAG	2	6	205409	205414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752148
5531	NC_017066	GGT	2	6	205476	205481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752148
5532	NC_017066	GCA	2	6	205482	205487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752148
5533	NC_017066	AGA	2	6	205556	205561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752148
5534	NC_017066	A	7	7	205622	205628	100 %	0 %	0 %	0 %	383752148
5535	NC_017066	GCG	2	6	205629	205634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383752148
5536	NC_017066	AGA	2	6	205649	205654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752148
5537	NC_017066	A	8	8	205730	205737	100 %	0 %	0 %	0 %	383752148
5538	NC_017066	ATT	2	6	205785	205790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752148
5539	NC_017066	ATCA	2	8	205801	205808	50 %	25 %	0 %	25 %	383752148
5540	NC_017066	TAG	2	6	205817	205822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752148
5541	NC_017066	ATT	2	6	205845	205850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752148
5542	NC_017066	TAAT	2	8	205888	205895	50 %	50 %	0 %	0 %	383752148
5543	NC_017066	GCT	2	6	205917	205922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383752148
5544	NC_017066	TGA	2	6	205987	205992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752148
5545	NC_017066	A	6	6	205992	205997	100 %	0 %	0 %	0 %	383752148
5546	NC_017066	ATT	2	6	206065	206070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017066	TTGT	2	8	206136	206143	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017066	ATG	2	6	206181	206186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_017066	TAAT	2	8	206235	206242	50 %	50 %	0 %	0 %	383752149
5550	NC_017066	A	6	6	206264	206269	100 %	0 %	0 %	0 %	383752149
5551	NC_017066	TAA	2	6	206281	206286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752149
5552	NC_017066	AAT	2	6	206287	206292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752149
5553	NC_017066	CT	3	6	206298	206303	0 %	50 %	0 %	50 %	383752149
5554	NC_017066	CACTAC	2	12	206311	206322	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	383752149
5555	NC_017066	AAGT	2	8	206349	206356	50 %	25 %	25 %	0 %	383752149
5556	NC_017066	TTC	2	6	206395	206400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752149
5557	NC_017066	T	6	6	206495	206500	0 %	100 %	0 %	0 %	383752149
5558	NC_017066	TAA	2	6	206507	206512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752149
5559	NC_017066	TATCA	2	10	206582	206591	40 %	40 %	0 %	20 %	383752149
5560	NC_017066	CCG	2	6	206664	206669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383752149
5561	NC_017066	CTCC	2	8	206673	206680	0 %	25 %	0 %	75 %	383752149
5562	NC_017066	CTC	2	6	206726	206731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383752149
5563	NC_017066	A	7	7	206741	206747	100 %	0 %	0 %	0 %	383752149
5564	NC_017066	CCA	2	6	206811	206816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752149
5565	NC_017066	CCA	2	6	206910	206915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752149
5566	NC_017066	AAT	2	6	207065	207070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752149
5567	NC_017066	ATAG	2	8	207098	207105	50 %	25 %	25 %	0 %	383752149
5568	NC_017066	TGG	2	6	207107	207112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752149
5569	NC_017066	TAAT	2	8	207133	207140	50 %	50 %	0 %	0 %	383752149
5570	NC_017066	CTT	2	6	207145	207150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752149
5571	NC_017066	AAG	2	6	207160	207165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752149
5572	NC_017066	ATA	2	6	207340	207345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752149
5573	NC_017066	TAG	2	6	207377	207382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752149
5574	NC_017066	GCCT	2	8	207410	207417	0 %	25 %	25 %	50 %	383752149
5575	NC_017066	TAT	2	6	207421	207426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752149
5576	NC_017066	GCA	2	6	207451	207456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752149
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5578	NC_017066	GAA	2	6	207606	207611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752149
5579	NC_017066	AT	5	10	207644	207653	50 %	50 %	0 %	0 %	383752149
5580	NC_017066	T	6	6	207674	207679	0 %	100 %	0 %	0 %	383752149
5581	NC_017066	ATA	2	6	207774	207779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752149
5582	NC_017066	TTG	2	6	207786	207791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383752149
5583	NC_017066	TAA	2	6	207821	207826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752149
5584	NC_017066	T	8	8	207872	207879	0 %	100 %	0 %	0 %	383752149
5585	NC_017066	A	6	6	207896	207901	100 %	0 %	0 %	0 %	383752149
5586	NC_017066	CATCT	2	10	207902	207911	20 %	40 %	0 %	40 %	383752149
5587	NC_017066	ACC	2	6	207914	207919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383752149
5588	NC_017066	TTAC	2	8	207963	207970	25 %	50 %	0 %	25 %	383752149
5589	NC_017066	T	6	6	207986	207991	0 %	100 %	0 %	0 %	383752149
5590	NC_017066	T	8	8	207997	208004	0 %	100 %	0 %	0 %	383752149
5591	NC_017066	ATC	2	6	208100	208105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383752149
5592	NC_017066	T	6	6	208187	208192	0 %	100 %	0 %	0 %	383752149
5593	NC_017066	TTGC	2	8	208213	208220	0 %	50 %	25 %	25 %	383752149
5594	NC_017066	CTT	2	6	208282	208287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383752149
5595	NC_017066	TAT	3	9	208324	208332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752149
5596	NC_017066	TAA	2	6	208358	208363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752149
5597	NC_017066	AAT	2	6	208364	208369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752149
5598	NC_017066	TAA	2	6	208398	208403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_017066	TAA	2	6	208408	208413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5600	NC_017066	AT	4	8	208462	208469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_017066	TAAA	2	8	208470	208477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_017066	T	6	6	208507	208512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_017066	TAA	2	6	208551	208556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5604	NC_017066	ATA	2	6	208610	208615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5605	NC_017066	CATT	2	8	208670	208677	25 %	50 %	0 %	25 %	383752150
5606	NC_017066	TTTG	2	8	208684	208691	0 %	75 %	25 %	0 %	383752150
5607	NC_017066	GTA	2	6	208725	208730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383752150
5608	NC_017066	TAT	2	6	208793	208798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752150
5609	NC_017066	AT	3	6	208808	208813	50 %	50 %	0 %	0 %	383752150
5610	NC_017066	T	8	8	208822	208829	0 %	100 %	0 %	0 %	383752150
5611	NC_017066	GGT	3	9	208830	208838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383752150
5612	NC_017066	TAA	2	6	208876	208881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752150
5613	NC_017066	ATAAA	2	10	208882	208891	80 %	20 %	0 %	0 %	383752150
5614	NC_017066	ATT	2	6	208902	208907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752150
5615	NC_017066	ATA	2	6	208909	208914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383752150
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5618	NC_017066	ATTTG	2	10	209117	209126	20 %	60 %	20 %	0 %	383752150
5619	NC_017066	AT	3	6	209127	209132	50 %	50 %	0 %	0 %	383752150
5620	NC_017066	GAA	2	6	209163	209168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383752150
5621	NC_017066	AAGC	2	8	209175	209182	50 %	0 %	25 %	25 %	383752150
5622	NC_017066	ATT	2	6	209252	209257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383752150
5623	NC_017066	TAATT	2	10	209267	209276	40 %	60 %	0 %	0 %	383752150
5624	NC_017066	AGC	2	6	209294	209299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383752150
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