MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 32591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017065	CCA	2	6	588666	588671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383751250
15003	NC_017065	TAT	2	6	588743	588748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751250
15004	NC_017065	TGA	2	6	588788	588793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751250
15005	NC_017065	ATG	2	6	588916	588921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751250
15006	NC_017065	AGT	2	6	588923	588928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751250
15007	NC_017065	GGTGG	3	15	588948	588962	0 %	20 %	80 %	0 %	383751250
15008	NC_017065	AT	3	6	588991	588996	50 %	50 %	0 %	0 %	383751250
15009	NC_017065	TAC	2	6	589063	589068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751250
15010	NC_017065	TA	3	6	589072	589077	50 %	50 %	0 %	0 %	383751250
15011	NC_017065	ATT	2	6	589082	589087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751250
15012	NC_017065	TCCGAT	2	12	589100	589111	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383751250
15013	NC_017065	TGC	2	6	589118	589123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751250
15014	NC_017065	ATT	2	6	589126	589131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751250
15015	NC_017065	AAGC	2	8	589171	589178	50 %	0 %	25 %	25 %	383751250
15016	NC_017065	A	6	6	589188	589193	100 %	0 %	0 %	0 %	383751250
15017	NC_017065	CAT	2	6	589205	589210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751250
15018	NC_017065	CTAT	2	8	589218	589225	25 %	50 %	0 %	25 %	383751250
15019	NC_017065	ATT	2	6	589281	589286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751251
15020	NC_017065	GAA	2	6	589292	589297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751251
15021	NC_017065	GTATT	2	10	589311	589320	20 %	60 %	20 %	0 %	383751251
15022	NC_017065	AGA	2	6	589366	589371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751251
15023	NC_017065	ATT	2	6	589477	589482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751251
15024	NC_017065	TAGAAT	2	12	589516	589527	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383751251
15025	NC_017065	TAG	2	6	589542	589547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751251
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15027	NC_017065	A	8	8	589568	589575	100 %	0 %	0 %	0 %	383751251
15028	NC_017065	AG	3	6	589628	589633	50 %	0 %	50 %	0 %	383751251
15029	NC_017065	TAA	2	6	589674	589679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751251
15030	NC_017065	A	6	6	589809	589814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_017065	GCA	2	6	589824	589829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751252
15032	NC_017065	TAT	2	6	589830	589835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751252
15033	NC_017065	AAT	2	6	589980	589985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751252
15034	NC_017065	ATT	2	6	589991	589996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751252
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15037	NC_017065	TA	3	6	590083	590088	50 %	50 %	0 %	0 %	383751252
15038	NC_017065	ATA	2	6	590093	590098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751252
15039	NC_017065	AAT	2	6	590160	590165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751252
15040	NC_017065	A	6	6	590197	590202	100 %	0 %	0 %	0 %	383751252
15041	NC_017065	ATT	2	6	590223	590228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751252
15042	NC_017065	AAAGTT	2	12	590242	590253	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	383751252
15043	NC_017065	ATG	2	6	590354	590359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751252
15044	NC_017065	TAA	2	6	590363	590368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751252
15045	NC_017065	ATT	2	6	590403	590408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751252
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15047	NC_017065	TA	3	6	590530	590535	50 %	50 %	0 %	0 %	383751252
15048	NC_017065	TTG	2	6	590627	590632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15049	NC_017065	TTG	2	6	590675	590680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15050	NC_017065	ATC	2	6	590693	590698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15051	NC_017065	GAG	2	6	590704	590709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15052	NC_017065	GAC	2	6	590782	590787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15053	NC_017065	CAA	2	6	590802	590807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15054	NC_017065	TAG	2	6	590812	590817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15056	NC_017065	TTC	2	6	590956	590961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751253
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15058	NC_017065	TCT	3	9	591075	591083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751253
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15063	NC_017065	CGC	2	6	591184	591189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383751253
15064	NC_017065	AC	3	6	591198	591203	50 %	0 %	0 %	50 %	383751253
15065	NC_017065	CTG	2	6	591223	591228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751253
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15069	NC_017065	TAC	3	9	591443	591451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751253
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15074	NC_017065	TTA	2	6	591709	591714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751253
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15076	NC_017065	TTTTA	2	10	591744	591753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15078	NC_017065	T	7	7	591802	591808	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15080	NC_017065	TATTT	2	10	591918	591927	20 %	80 %	0 %	0 %	383751254
15081	NC_017065	TAT	2	6	591954	591959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751254
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15089	NC_017065	CCA	2	6	592186	592191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383751254
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15099	NC_017065	CTC	2	6	592670	592675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383751254
15100	NC_017065	ATACT	2	10	592721	592730	40 %	40 %	0 %	20 %	383751254
15101	NC_017065	ATA	2	6	592734	592739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751254
15102	NC_017065	TGA	2	6	592807	592812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751254
15103	NC_017065	T	6	6	592848	592853	0 %	100 %	0 %	0 %	383751254
15104	NC_017065	CTT	3	9	592856	592864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751254
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15107	NC_017065	ATTTA	2	10	592944	592953	40 %	60 %	0 %	0 %	383751254
15108	NC_017065	AAC	2	6	592986	592991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383751254
15109	NC_017065	ATTT	2	8	593069	593076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_017065	TTA	2	6	593151	593156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751255
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15112	NC_017065	AT	3	6	593217	593222	50 %	50 %	0 %	0 %	383751255
15113	NC_017065	ATT	2	6	593238	593243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751255
15114	NC_017065	ATTA	2	8	593285	593292	50 %	50 %	0 %	0 %	383751255
15115	NC_017065	ATTT	2	8	593320	593327	25 %	75 %	0 %	0 %	383751255
15116	NC_017065	ATG	2	6	593362	593367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751255
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15119	NC_017065	GCT	2	6	593412	593417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751255
15120	NC_017065	TCA	2	6	593430	593435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751255
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15497	NC_017065	TCTAT	2	10	607444	607453	20 %	60 %	0 %	20 %	383751271
15498	NC_017065	TTAT	2	8	607469	607476	25 %	75 %	0 %	0 %	383751271
15499	NC_017065	ACT	2	6	607534	607539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751271
15500	NC_017065	CAC	2	6	607548	607553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383751271

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