MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 32591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13002	NC_017065	TTC	2	6	509633	509638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751163
13003	NC_017065	AAT	2	6	509667	509672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751163
13004	NC_017065	AT	3	6	509697	509702	50 %	50 %	0 %	0 %	383751163
13005	NC_017065	ATT	2	6	509709	509714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751163
13006	NC_017065	TCT	2	6	509724	509729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751164
13007	NC_017065	ATTTT	2	10	509803	509812	20 %	80 %	0 %	0 %	383751164
13008	NC_017065	T	6	6	509809	509814	0 %	100 %	0 %	0 %	383751164
13009	NC_017065	AT	3	6	509976	509981	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_017065	AAAT	2	8	510020	510027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_017065	TGT	2	6	510053	510058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_017065	GTT	2	6	510060	510065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_017065	A	7	7	510074	510080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_017065	ATTAA	2	10	510115	510124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_017065	CA	3	6	510133	510138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13016	NC_017065	T	6	6	510202	510207	0 %	100 %	0 %	0 %	383751165
13017	NC_017065	T	6	6	510215	510220	0 %	100 %	0 %	0 %	383751165
13018	NC_017065	TTA	2	6	510235	510240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751165
13019	NC_017065	ACT	2	6	510316	510321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751165
13020	NC_017065	T	7	7	510325	510331	0 %	100 %	0 %	0 %	383751165
13021	NC_017065	TCCT	2	8	510472	510479	0 %	50 %	0 %	50 %	383751165
13022	NC_017065	ATA	2	6	510485	510490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751165
13023	NC_017065	T	7	7	510531	510537	0 %	100 %	0 %	0 %	383751165
13024	NC_017065	A	6	6	510585	510590	100 %	0 %	0 %	0 %	383751165
13025	NC_017065	TTA	3	9	510670	510678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751165
13026	NC_017065	TGA	2	6	510756	510761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751165
13027	NC_017065	T	7	7	510766	510772	0 %	100 %	0 %	0 %	383751165
13028	NC_017065	AAAG	2	8	510773	510780	75 %	0 %	25 %	0 %	383751165
13029	NC_017065	TCA	2	6	510800	510805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751165
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13031	NC_017065	TAA	2	6	510864	510869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751165
13032	NC_017065	T	7	7	510918	510924	0 %	100 %	0 %	0 %	383751165
13033	NC_017065	ATC	2	6	510945	510950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751165
13034	NC_017065	TAC	3	9	510979	510987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751165
13035	NC_017065	ATAAA	2	10	511026	511035	80 %	20 %	0 %	0 %	383751165
13036	NC_017065	ATT	2	6	511073	511078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751165
13037	NC_017065	AAT	2	6	511096	511101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751165
13038	NC_017065	ACAA	2	8	511107	511114	75 %	0 %	0 %	25 %	383751165
13039	NC_017065	GCA	2	6	511154	511159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751165
13040	NC_017065	ATT	2	6	511181	511186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751165
13041	NC_017065	TAT	2	6	511252	511257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751165
13042	NC_017065	ACT	2	6	511268	511273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751165
13043	NC_017065	CTTT	2	8	511275	511282	0 %	75 %	0 %	25 %	383751165
13044	NC_017065	TGT	2	6	511287	511292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383751165
13045	NC_017065	TC	3	6	511316	511321	0 %	50 %	0 %	50 %	383751165
13046	NC_017065	TTG	2	6	511410	511415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13047	NC_017065	AT	3	6	511486	511491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_017065	A	6	6	511510	511515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_017065	T	8	8	511520	511527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_017065	CAA	2	6	511570	511575	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_017065	TA	3	6	511607	511612	50 %	50 %	0 %	0 %	383751166
13052	NC_017065	TTC	2	6	511614	511619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751166
13053	NC_017065	ACT	2	6	511654	511659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751166
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13055	NC_017065	T	6	6	511739	511744	0 %	100 %	0 %	0 %	383751166
13056	NC_017065	GAT	2	6	511806	511811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_017065	AT	3	6	511810	511815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_017065	TTA	2	6	511872	511877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_017065	TCC	2	6	511913	511918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13060	NC_017065	TATCC	2	10	511923	511932	20 %	40 %	0 %	40 %	383751167
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13063	NC_017065	GAG	2	6	512055	512060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383751167
13064	NC_017065	TA	3	6	512062	512067	50 %	50 %	0 %	0 %	383751167
13065	NC_017065	TGT	2	6	512087	512092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383751167
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13067	NC_017065	T	6	6	512128	512133	0 %	100 %	0 %	0 %	383751167
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13072	NC_017065	TAC	2	6	512436	512441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751168
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13075	NC_017065	AT	3	6	512472	512477	50 %	50 %	0 %	0 %	383751168
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13077	NC_017065	TTG	2	6	512494	512499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383751168
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13080	NC_017065	ATT	2	6	512554	512559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_017065	TCT	2	6	512615	512620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751169
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13087	NC_017065	AGG	2	6	512833	512838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_017065	ATCAGT	2	12	512866	512877	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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13091	NC_017065	TTTA	2	8	512963	512970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_017065	TTC	2	6	513017	513022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13093	NC_017065	TCT	2	6	513053	513058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13094	NC_017065	CTT	2	6	513081	513086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13095	NC_017065	TTGG	2	8	513087	513094	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_017065	ATTTGA	2	12	513142	513153	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383751170
13097	NC_017065	AATTA	2	10	513185	513194	60 %	40 %	0 %	0 %	383751170
13098	NC_017065	GCT	2	6	513200	513205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751170
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13103	NC_017065	AAG	2	6	513460	513465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751170
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13106	NC_017065	ATA	2	6	513539	513544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751170
13107	NC_017065	TTGTTA	2	12	513553	513564	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383751170
13108	NC_017065	CCT	2	6	513590	513595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13109	NC_017065	TAT	2	6	513611	513616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751171
13110	NC_017065	AAC	2	6	513620	513625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383751171
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13112	NC_017065	TTTA	2	8	513679	513686	25 %	75 %	0 %	0 %	383751171
13113	NC_017065	CTT	2	6	513747	513752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751171
13114	NC_017065	T	6	6	513755	513760	0 %	100 %	0 %	0 %	383751171
13115	NC_017065	AAAT	2	8	513769	513776	75 %	25 %	0 %	0 %	383751171
13116	NC_017065	CTT	2	6	513827	513832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751171
13117	NC_017065	TTG	2	6	513862	513867	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383751171
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13119	NC_017065	TTTCA	2	10	513940	513949	20 %	60 %	0 %	20 %	383751171
13120	NC_017065	T	6	6	513975	513980	0 %	100 %	0 %	0 %	383751171
13121	NC_017065	TC	4	8	513985	513992	0 %	50 %	0 %	50 %	383751171
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13123	NC_017065	A	6	6	514030	514035	100 %	0 %	0 %	0 %	383751171
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