MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 32591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017065	AATATC	2	12	489067	489078	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12502	NC_017065	TTA	2	6	489091	489096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_017065	ATT	2	6	489258	489263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_017065	AT	3	6	489324	489329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_017065	A	7	7	489368	489374	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_017065	CAA	2	6	489464	489469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12507	NC_017065	GGT	2	6	489494	489499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_017065	TAG	2	6	489657	489662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_017065	T	6	6	489750	489755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_017065	GTA	2	6	489768	489773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_017065	TCG	2	6	489925	489930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12512	NC_017065	GA	3	6	490015	490020	50 %	0 %	50 %	0 %	383751140
12513	NC_017065	A	6	6	490029	490034	100 %	0 %	0 %	0 %	383751140
12514	NC_017065	TAC	2	6	490113	490118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751140
12515	NC_017065	TCAA	2	8	490174	490181	50 %	25 %	0 %	25 %	383751140
12516	NC_017065	TTA	2	6	490206	490211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751140
12517	NC_017065	TAA	2	6	490452	490457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751140
12518	NC_017065	TAA	2	6	490506	490511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751140
12519	NC_017065	TAA	2	6	490526	490531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751140
12520	NC_017065	ATTT	3	12	490612	490623	25 %	75 %	0 %	0 %	383751140
12521	NC_017065	TCA	2	6	490627	490632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751140
12522	NC_017065	CTG	2	6	490682	490687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751140
12523	NC_017065	AT	3	6	490727	490732	50 %	50 %	0 %	0 %	383751140
12524	NC_017065	GCT	2	6	490794	490799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751140
12525	NC_017065	AT	3	6	490811	490816	50 %	50 %	0 %	0 %	383751140
12526	NC_017065	CTA	2	6	490817	490822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751140
12527	NC_017065	AT	3	6	490828	490833	50 %	50 %	0 %	0 %	383751140
12528	NC_017065	ATC	2	6	490850	490855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751140
12529	NC_017065	A	6	6	490858	490863	100 %	0 %	0 %	0 %	383751140
12530	NC_017065	TTG	2	6	490867	490872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383751140
12531	NC_017065	CAT	2	6	490873	490878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751140
12532	NC_017065	AATT	2	8	490891	490898	50 %	50 %	0 %	0 %	383751140
12533	NC_017065	TCT	2	6	490907	490912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12534	NC_017065	TTC	2	6	490932	490937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12535	NC_017065	ATA	2	6	490945	490950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12536	NC_017065	TTA	2	6	490955	490960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_017065	AAG	2	6	491108	491113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751141
12538	NC_017065	TAT	2	6	491128	491133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751141
12539	NC_017065	A	7	7	491143	491149	100 %	0 %	0 %	0 %	383751141
12540	NC_017065	CAA	2	6	491152	491157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383751141
12541	NC_017065	GAT	2	6	491206	491211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751141
12542	NC_017065	A	6	6	491212	491217	100 %	0 %	0 %	0 %	383751141
12543	NC_017065	GCA	2	6	491233	491238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751141
12544	NC_017065	CAA	2	6	491276	491281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383751141
12545	NC_017065	T	6	6	491325	491330	0 %	100 %	0 %	0 %	383751141
12546	NC_017065	AT	3	6	491371	491376	50 %	50 %	0 %	0 %	383751141
12547	NC_017065	A	6	6	491416	491421	100 %	0 %	0 %	0 %	383751141
12548	NC_017065	A	6	6	491494	491499	100 %	0 %	0 %	0 %	383751141
12549	NC_017065	A	6	6	491521	491526	100 %	0 %	0 %	0 %	383751141
12550	NC_017065	ATT	2	6	491538	491543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751141
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12552	NC_017065	A	7	7	491579	491585	100 %	0 %	0 %	0 %	383751141
12553	NC_017065	A	6	6	491596	491601	100 %	0 %	0 %	0 %	383751141
12554	NC_017065	ATT	2	6	491613	491618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751141
12555	NC_017065	GAA	2	6	491641	491646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751141
12556	NC_017065	T	7	7	491652	491658	0 %	100 %	0 %	0 %	383751141
12557	NC_017065	GAA	2	6	491764	491769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751141
12558	NC_017065	A	6	6	491791	491796	100 %	0 %	0 %	0 %	383751141
12559	NC_017065	CTG	2	6	491831	491836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751141
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12561	NC_017065	ATG	2	6	491870	491875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751141
12562	NC_017065	TTAAT	2	10	492057	492066	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12563	NC_017065	AAT	2	6	492083	492088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_017065	A	6	6	492120	492125	100 %	0 %	0 %	0 %	383751142
12565	NC_017065	A	6	6	492127	492132	100 %	0 %	0 %	0 %	383751142
12566	NC_017065	A	6	6	492153	492158	100 %	0 %	0 %	0 %	383751142
12567	NC_017065	ATTTTG	2	12	492197	492208	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383751142
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12569	NC_017065	TAA	2	6	492297	492302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751142
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12571	NC_017065	AAT	2	6	492330	492335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751142
12572	NC_017065	TAA	3	9	492393	492401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751142
12573	NC_017065	ATT	3	9	492417	492425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751142
12574	NC_017065	GATA	2	8	492573	492580	50 %	25 %	25 %	0 %	383751142
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12581	NC_017065	A	6	6	492850	492855	100 %	0 %	0 %	0 %	383751142
12582	NC_017065	TA	3	6	492928	492933	50 %	50 %	0 %	0 %	383751142
12583	NC_017065	A	8	8	492943	492950	100 %	0 %	0 %	0 %	383751142
12584	NC_017065	TAG	2	6	492956	492961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751142
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12592	NC_017065	TCC	2	6	493230	493235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383751142
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12596	NC_017065	ATT	2	6	493352	493357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12597	NC_017065	CAAG	2	8	493430	493437	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12598	NC_017065	AAT	2	6	493467	493472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751143
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12602	NC_017065	CTG	2	6	493558	493563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751143
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12609	NC_017065	AG	3	6	493875	493880	50 %	0 %	50 %	0 %	383751143
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12611	NC_017065	ATC	2	6	494012	494017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751143
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12614	NC_017065	ATT	2	6	494192	494197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751143
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12620	NC_017065	AAT	2	6	494310	494315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_017065	CTTT	2	8	494388	494395	0 %	75 %	0 %	25 %	383751144
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12623	NC_017065	CTTA	2	8	494418	494425	25 %	50 %	0 %	25 %	383751144
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12997	NC_017065	TTTA	2	8	509513	509520	25 %	75 %	0 %	0 %	383751163
12998	NC_017065	T	6	6	509567	509572	0 %	100 %	0 %	0 %	383751163
12999	NC_017065	CTA	2	6	509584	509589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751163
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