MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia slovaca str. D-CWPP chromosome

Total Repeats: 32591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017065	TAAT	2	8	451951	451958	50 %	50 %	0 %	0 %	383751100
11502	NC_017065	A	6	6	452020	452025	100 %	0 %	0 %	0 %	383751100
11503	NC_017065	GAA	2	6	452071	452076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751100
11504	NC_017065	T	6	6	452083	452088	0 %	100 %	0 %	0 %	383751100
11505	NC_017065	TAT	2	6	452132	452137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751100
11506	NC_017065	CTA	2	6	452189	452194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751100
11507	NC_017065	ACAA	2	8	452256	452263	75 %	0 %	0 %	25 %	383751100
11508	NC_017065	TAT	2	6	452297	452302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751100
11509	NC_017065	GCA	2	6	452308	452313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383751100
11510	NC_017065	TAT	3	9	452342	452350	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751100
11511	NC_017065	ATA	2	6	452356	452361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751100
11512	NC_017065	ATTA	2	8	452423	452430	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_017065	TGATA	2	10	452437	452446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_017065	TA	3	6	452445	452450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11515	NC_017065	ATT	3	9	452457	452465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11516	NC_017065	AAT	2	6	452468	452473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11517	NC_017065	GAA	3	9	452512	452520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751101
11518	NC_017065	ACT	2	6	452562	452567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751101
11519	NC_017065	AT	3	6	452635	452640	50 %	50 %	0 %	0 %	383751101
11520	NC_017065	TCC	2	6	452673	452678	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383751101
11521	NC_017065	T	6	6	452681	452686	0 %	100 %	0 %	0 %	383751101
11522	NC_017065	GTAGCG	2	12	452722	452733	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383751101
11523	NC_017065	GCTTCA	2	12	452746	452757	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383751101
11524	NC_017065	AAG	2	6	452786	452791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383751101
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11528	NC_017065	TCTA	2	8	453048	453055	25 %	50 %	0 %	25 %	383751101
11529	NC_017065	TAG	2	6	453083	453088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751101
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11532	NC_017065	CTT	3	9	453236	453244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751101
11533	NC_017065	CT	3	6	453266	453271	0 %	50 %	0 %	50 %	383751101
11534	NC_017065	CTA	2	6	453335	453340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751101
11535	NC_017065	TTG	3	9	453348	453356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383751101
11536	NC_017065	TAT	2	6	453378	453383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751101
11537	NC_017065	TAA	2	6	453411	453416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751101
11538	NC_017065	T	7	7	453440	453446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11539	NC_017065	TAT	2	6	453459	453464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11540	NC_017065	A	7	7	453475	453481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_017065	TA	3	6	453507	453512	50 %	50 %	0 %	0 %	383751102
11542	NC_017065	T	8	8	453513	453520	0 %	100 %	0 %	0 %	383751102
11543	NC_017065	AAAG	2	8	453552	453559	75 %	0 %	25 %	0 %	383751102
11544	NC_017065	TTC	2	6	453572	453577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383751102
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11547	NC_017065	AATA	2	8	453633	453640	75 %	25 %	0 %	0 %	383751102
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11550	NC_017065	GTC	2	6	453707	453712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383751102
11551	NC_017065	ATA	3	9	453732	453740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751102
11552	NC_017065	TTATAT	2	12	453751	453762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11553	NC_017065	T	6	6	453768	453773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11554	NC_017065	AAT	2	6	453774	453779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11555	NC_017065	AAT	2	6	453782	453787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11556	NC_017065	TAT	2	6	453823	453828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751103
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11558	NC_017065	ATC	2	6	453943	453948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383751103
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11562	NC_017065	ATA	2	6	454053	454058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751103
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11564	NC_017065	A	9	9	454100	454108	100 %	0 %	0 %	0 %	383751103
11565	NC_017065	TA	3	6	454113	454118	50 %	50 %	0 %	0 %	383751103
11566	NC_017065	AAGC	2	8	454146	454153	50 %	0 %	25 %	25 %	383751103
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11603	NC_017065	TAATT	2	10	455311	455320	40 %	60 %	0 %	0 %	383751103
11604	NC_017065	ATAA	2	8	455357	455364	75 %	25 %	0 %	0 %	383751103
11605	NC_017065	TAAT	2	8	455365	455372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11606	NC_017065	A	6	6	455402	455407	100 %	0 %	0 %	0 %	383751104
11607	NC_017065	A	6	6	455472	455477	100 %	0 %	0 %	0 %	383751104
11608	NC_017065	GTA	2	6	455506	455511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751104
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11610	NC_017065	A	7	7	455547	455553	100 %	0 %	0 %	0 %	383751104
11611	NC_017065	TTA	2	6	455557	455562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751104
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11613	NC_017065	TGA	2	6	455662	455667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383751104
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11615	NC_017065	AAT	2	6	455745	455750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383751104
11616	NC_017065	GAAAA	2	10	455771	455780	80 %	0 %	20 %	0 %	383751104
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11621	NC_017065	GAG	2	6	455872	455877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11622	NC_017065	TTG	2	6	455878	455883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11997	NC_017065	ATT	2	6	469701	469706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751118
11998	NC_017065	TTA	2	6	469708	469713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383751118
11999	NC_017065	GTT	2	6	469742	469747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383751118
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