MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_017062	A	6	6	950269	950274	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26002	NC_017062	TAAA	2	8	950344	950351	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26003	NC_017062	TATAA	2	10	950439	950448	60 %	40 %	0 %	0 %	383843540
26004	NC_017062	CAT	2	6	950453	950458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843540
26005	NC_017062	TCA	2	6	950484	950489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843540
26006	NC_017062	TA	3	6	950491	950496	50 %	50 %	0 %	0 %	383843540
26007	NC_017062	TA	3	6	950526	950531	50 %	50 %	0 %	0 %	383843540
26008	NC_017062	AAT	2	6	950535	950540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843540
26009	NC_017062	AATA	2	8	950639	950646	75 %	25 %	0 %	0 %	383843540
26010	NC_017062	ATA	2	6	950668	950673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843540
26011	NC_017062	AAT	2	6	950754	950759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843540
26012	NC_017062	TAAA	2	8	950815	950822	75 %	25 %	0 %	0 %	383843540
26013	NC_017062	GAA	3	9	950829	950837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843540
26014	NC_017062	ATA	2	6	950947	950952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843540
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26016	NC_017062	AT	3	6	950975	950980	50 %	50 %	0 %	0 %	383843540
26017	NC_017062	ATG	2	6	951004	951009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843540
26018	NC_017062	CTA	2	6	951013	951018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843540
26019	NC_017062	ATG	2	6	951046	951051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843540
26020	NC_017062	TAT	4	12	951063	951074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843540
26021	NC_017062	GTA	2	6	951075	951080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843540
26022	NC_017062	A	6	6	951158	951163	100 %	0 %	0 %	0 %	383843540
26023	NC_017062	ATA	2	6	951208	951213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843540
26024	NC_017062	ACT	2	6	951233	951238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843540
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26029	NC_017062	GCAA	2	8	951426	951433	50 %	0 %	25 %	25 %	383843540
26030	NC_017062	TAC	2	6	951479	951484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843540
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26033	NC_017062	AGCA	2	8	951551	951558	50 %	0 %	25 %	25 %	383843540
26034	NC_017062	AT	3	6	951574	951579	50 %	50 %	0 %	0 %	383843540
26035	NC_017062	TC	3	6	951583	951588	0 %	50 %	0 %	50 %	383843540
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26039	NC_017062	ATT	2	6	951673	951678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26040	NC_017062	T	6	6	951688	951693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26041	NC_017062	TTATT	2	10	951731	951740	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26042	NC_017062	ACT	2	6	951898	951903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26043	NC_017062	ATC	2	6	951950	951955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26044	NC_017062	ATTTCT	2	12	951957	951968	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26045	NC_017062	AC	3	6	951983	951988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
26046	NC_017062	TAA	2	6	952002	952007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26047	NC_017062	CAATA	2	10	952014	952023	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26048	NC_017062	TCTT	2	8	952065	952072	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26049	NC_017062	ACA	2	6	952073	952078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26050	NC_017062	CATT	2	8	952082	952089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26051	NC_017062	ATT	2	6	952117	952122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26052	NC_017062	CAA	2	6	952286	952291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26053	NC_017062	AT	3	6	952307	952312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26054	NC_017062	AT	3	6	952424	952429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26055	NC_017062	CAATA	2	10	952467	952476	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26056	NC_017062	T	6	6	952531	952536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26057	NC_017062	A	6	6	952549	952554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26058	NC_017062	A	6	6	952611	952616	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26059	NC_017062	AAT	2	6	952619	952624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26060	NC_017062	A	6	6	952649	952654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26061	NC_017062	CAA	2	6	952749	952754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26062	NC_017062	GTA	2	6	952779	952784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26063	NC_017062	AAT	2	6	952797	952802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26064	NC_017062	ATTA	2	8	952815	952822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26065	NC_017062	TGT	2	6	952831	952836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26066	NC_017062	TTA	2	6	952848	952853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26067	NC_017062	TATG	2	8	952885	952892	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26068	NC_017062	GT	3	6	952977	952982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26069	NC_017062	ATT	2	6	953000	953005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26070	NC_017062	TAAT	2	8	953032	953039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26071	NC_017062	AAT	2	6	953061	953066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26072	NC_017062	ATAAC	2	10	953069	953078	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
26073	NC_017062	AAG	2	6	953095	953100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26074	NC_017062	AATA	2	8	953124	953131	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26075	NC_017062	TTTC	2	8	953142	953149	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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26099	NC_017062	GGC	2	6	954262	954267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383843542
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26111	NC_017062	A	6	6	954812	954817	100 %	0 %	0 %	0 %	383843542
26112	NC_017062	AGCA	2	8	954873	954880	50 %	0 %	25 %	25 %	383843542
26113	NC_017062	CAT	2	6	954887	954892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843542
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26117	NC_017062	T	6	6	954966	954971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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26119	NC_017062	TAT	2	6	955061	955066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26120	NC_017062	ATA	2	6	955067	955072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26121	NC_017062	TA	3	6	955071	955076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26122	NC_017062	TAAA	2	8	955159	955166	75 %	25 %	0 %	0 %	383843543
26123	NC_017062	ATA	2	6	955176	955181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843543
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