MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

< Previous12...3233343536373839404142...6061Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18002	NC_017062	TA	3	6	655740	655745	50 %	50 %	0 %	0 %	383843320
18003	NC_017062	ATT	2	6	655788	655793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843320
18004	NC_017062	AT	3	6	655872	655877	50 %	50 %	0 %	0 %	383843320
18005	NC_017062	ACC	3	9	655935	655943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383843320
18006	NC_017062	ATT	3	9	655962	655970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843320
18007	NC_017062	TTTTC	2	10	655975	655984	0 %	80 %	0 %	20 %	383843320
18008	NC_017062	TA	3	6	655988	655993	50 %	50 %	0 %	0 %	383843320
18009	NC_017062	A	6	6	655993	655998	100 %	0 %	0 %	0 %	383843320
18010	NC_017062	CAC	2	6	656021	656026	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383843320
18011	NC_017062	AGGATA	2	12	656070	656081	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	383843320
18012	NC_017062	T	6	6	656131	656136	0 %	100 %	0 %	0 %	383843320
18013	NC_017062	ATT	2	6	656148	656153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843320
18014	NC_017062	TTAT	2	8	656161	656168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18015	NC_017062	ATT	2	6	656237	656242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843321
18016	NC_017062	TAA	2	6	656288	656293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843321
18017	NC_017062	TTA	2	6	656346	656351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843321
18018	NC_017062	ATAA	2	8	656421	656428	75 %	25 %	0 %	0 %	383843321
18019	NC_017062	ATC	2	6	656429	656434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843321
18020	NC_017062	TCC	2	6	656490	656495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383843321
18021	NC_017062	TAAA	2	8	656498	656505	75 %	25 %	0 %	0 %	383843321
18022	NC_017062	ATTT	2	8	656563	656570	25 %	75 %	0 %	0 %	383843321
18023	NC_017062	ATT	2	6	656588	656593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843321
18024	NC_017062	A	6	6	656595	656600	100 %	0 %	0 %	0 %	383843321
18025	NC_017062	TTC	2	6	656609	656614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843321
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18027	NC_017062	CTG	2	6	656641	656646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843321
18028	NC_017062	TAT	2	6	656669	656674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843321
18029	NC_017062	CTT	2	6	656842	656847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843321
18030	NC_017062	CAA	2	6	656851	656856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383843321
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18032	NC_017062	ACT	2	6	656864	656869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843321
18033	NC_017062	TCG	2	6	656901	656906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843321
18034	NC_017062	TAA	2	6	656912	656917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843321
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18036	NC_017062	TGCT	2	8	656968	656975	0 %	50 %	25 %	25 %	383843321
18037	NC_017062	TAG	2	6	656989	656994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843321
18038	NC_017062	TAAAA	2	10	657056	657065	80 %	20 %	0 %	0 %	383843321
18039	NC_017062	TGC	2	6	657141	657146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843321
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18042	NC_017062	CTT	2	6	657284	657289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843321
18043	NC_017062	ATA	2	6	657298	657303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843321
18044	NC_017062	TCA	2	6	657363	657368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843321
18045	NC_017062	ATG	2	6	657422	657427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843321
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18049	NC_017062	T	6	6	657535	657540	0 %	100 %	0 %	0 %	383843321
18050	NC_017062	AT	3	6	657572	657577	50 %	50 %	0 %	0 %	383843321
18051	NC_017062	ATATT	2	10	657601	657610	40 %	60 %	0 %	0 %	383843321
18052	NC_017062	GCT	2	6	657639	657644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843321
18053	NC_017062	TTG	2	6	657686	657691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843321
18054	NC_017062	TAA	2	6	657761	657766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843321
18055	NC_017062	A	6	6	657786	657791	100 %	0 %	0 %	0 %	383843321
18056	NC_017062	ATT	2	6	657809	657814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843321
18057	NC_017062	TCT	2	6	657885	657890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843321
18058	NC_017062	TTTATT	2	12	657947	657958	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18059	NC_017062	TCA	2	6	658073	658078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843322
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18062	NC_017062	ACCT	2	8	658225	658232	25 %	25 %	0 %	50 %	383843322
18063	NC_017062	CGT	2	6	658271	658276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843322
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18088	NC_017062	AGCA	2	8	659163	659170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18089	NC_017062	AAC	2	6	659179	659184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18090	NC_017062	TAATAT	2	12	659194	659205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18121	NC_017062	TTA	2	6	660530	660535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18122	NC_017062	T	6	6	660536	660541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18162	NC_017062	A	6	6	661997	662002	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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