MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

< Previous12...3031323334353637383940...6061Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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17002	NC_017062	TTA	2	6	620744	620749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843296
17003	NC_017062	TCA	2	6	620852	620857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843296
17004	NC_017062	CCA	2	6	620902	620907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383843296
17005	NC_017062	CAT	2	6	620927	620932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843296
17006	NC_017062	CTT	2	6	621002	621007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843296
17007	NC_017062	ATCT	2	8	621123	621130	25 %	50 %	0 %	25 %	383843296
17008	NC_017062	CT	3	6	621129	621134	0 %	50 %	0 %	50 %	383843296
17009	NC_017062	GTT	2	6	621199	621204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843296
17010	NC_017062	TTC	2	6	621222	621227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843296
17011	NC_017062	CAT	2	6	621233	621238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843296
17012	NC_017062	GCA	2	6	621322	621327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843296
17013	NC_017062	AG	3	6	621336	621341	50 %	0 %	50 %	0 %	383843296
17014	NC_017062	CTT	2	6	621368	621373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843296
17015	NC_017062	ATTA	2	8	621411	621418	50 %	50 %	0 %	0 %	383843296
17016	NC_017062	A	6	6	621442	621447	100 %	0 %	0 %	0 %	383843296
17017	NC_017062	T	6	6	621456	621461	0 %	100 %	0 %	0 %	383843296
17018	NC_017062	TCT	3	9	621466	621474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843296
17019	NC_017062	AT	3	6	621527	621532	50 %	50 %	0 %	0 %	383843296
17020	NC_017062	TTTCT	2	10	621551	621560	0 %	80 %	0 %	20 %	383843296
17021	NC_017062	GAA	2	6	621643	621648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843296
17022	NC_017062	CAT	2	6	621665	621670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843296
17023	NC_017062	A	7	7	621695	621701	100 %	0 %	0 %	0 %	383843296
17024	NC_017062	TTCTTG	2	12	621702	621713	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	383843296
17025	NC_017062	TGT	3	9	621721	621729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843296
17026	NC_017062	A	6	6	621818	621823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17027	NC_017062	A	7	7	621872	621878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17028	NC_017062	CTTAA	2	10	621898	621907	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17029	NC_017062	A	6	6	621926	621931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17030	NC_017062	TAA	2	6	621952	621957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17031	NC_017062	A	7	7	622029	622035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17032	NC_017062	ATT	2	6	622041	622046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843297
17033	NC_017062	TTTA	2	8	622078	622085	25 %	75 %	0 %	0 %	383843297
17034	NC_017062	TAG	2	6	622092	622097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843297
17035	NC_017062	AGA	2	6	622165	622170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843297
17036	NC_017062	TAAAA	2	10	622390	622399	80 %	20 %	0 %	0 %	383843297
17037	NC_017062	TAT	2	6	622405	622410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843297
17038	NC_017062	ATT	2	6	622432	622437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843297
17039	NC_017062	A	6	6	622444	622449	100 %	0 %	0 %	0 %	383843297
17040	NC_017062	TAA	2	6	622461	622466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843297
17041	NC_017062	TTC	2	6	622509	622514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843297
17042	NC_017062	TGC	3	9	622624	622632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843297
17043	NC_017062	CTA	2	6	622647	622652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843297
17044	NC_017062	AATT	2	8	622653	622660	50 %	50 %	0 %	0 %	383843297
17045	NC_017062	TGA	2	6	622708	622713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843297
17046	NC_017062	ATC	2	6	622718	622723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843297
17047	NC_017062	ATTT	2	8	622749	622756	25 %	75 %	0 %	0 %	383843297
17048	NC_017062	T	6	6	622754	622759	0 %	100 %	0 %	0 %	383843297
17049	NC_017062	TAGT	2	8	622857	622864	25 %	50 %	25 %	0 %	383843297
17050	NC_017062	GT	3	6	622881	622886	0 %	50 %	50 %	0 %	383843297
17051	NC_017062	ATA	2	6	622921	622926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843297
17052	NC_017062	TAAA	2	8	622963	622970	75 %	25 %	0 %	0 %	383843297
17053	NC_017062	AAT	2	6	622994	622999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843297
17054	NC_017062	TTC	2	6	623017	623022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843297
17055	NC_017062	GTA	2	6	623027	623032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843297
17056	NC_017062	ATT	2	6	623035	623040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843297
17057	NC_017062	TAT	2	6	623092	623097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843297
17058	NC_017062	AAG	2	6	623128	623133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843297
17059	NC_017062	TTG	2	6	623160	623165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843297
17060	NC_017062	A	7	7	623249	623255	100 %	0 %	0 %	0 %	383843297
17061	NC_017062	AT	3	6	623274	623279	50 %	50 %	0 %	0 %	383843297
17062	NC_017062	ACAT	2	8	623309	623316	50 %	25 %	0 %	25 %	383843297
17063	NC_017062	TTA	2	6	623322	623327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843297
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17065	NC_017062	TAG	2	6	623388	623393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843297
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17067	NC_017062	TAA	2	6	623452	623457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843297
17068	NC_017062	ATT	2	6	623579	623584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843297
17069	NC_017062	TA	3	6	623614	623619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17070	NC_017062	TAA	2	6	623685	623690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17071	NC_017062	ATT	2	6	623797	623802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843298
17072	NC_017062	A	8	8	623858	623865	100 %	0 %	0 %	0 %	383843298
17073	NC_017062	GGAA	2	8	623915	623922	50 %	0 %	50 %	0 %	383843298
17074	NC_017062	A	6	6	624056	624061	100 %	0 %	0 %	0 %	383843298
17075	NC_017062	TA	3	6	624063	624068	50 %	50 %	0 %	0 %	383843298
17076	NC_017062	AAG	2	6	624076	624081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843298
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17080	NC_017062	TA	3	6	624303	624308	50 %	50 %	0 %	0 %	383843298
17081	NC_017062	AGA	2	6	624320	624325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843298
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17084	NC_017062	GAC	2	6	624483	624488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843298
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17087	NC_017062	T	6	6	624575	624580	0 %	100 %	0 %	0 %	383843298
17088	NC_017062	GTT	2	6	624631	624636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843298
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17090	NC_017062	TTAAG	2	10	624672	624681	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
17091	NC_017062	TAC	2	6	624702	624707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843299
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17093	NC_017062	ATTA	2	8	624723	624730	50 %	50 %	0 %	0 %	383843299
17094	NC_017062	AAT	2	6	624802	624807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843299
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17101	NC_017062	TAT	2	6	624976	624981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17102	NC_017062	TA	3	6	625028	625033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17103	NC_017062	TGA	2	6	625058	625063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17104	NC_017062	GCA	2	6	625199	625204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843300
17105	NC_017062	TAT	2	6	625233	625238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843300
17106	NC_017062	GT	3	6	625243	625248	0 %	50 %	50 %	0 %	383843300
17107	NC_017062	AATT	2	8	625294	625301	50 %	50 %	0 %	0 %	383843300
17108	NC_017062	CTG	2	6	625320	625325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843300
17109	NC_017062	G	6	6	625337	625342	0 %	0 %	100 %	0 %	383843300
17110	NC_017062	ATAG	2	8	625397	625404	50 %	25 %	25 %	0 %	383843300
17111	NC_017062	ATT	2	6	625417	625422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843300
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17113	NC_017062	CTG	2	6	625518	625523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843300
17114	NC_017062	TGC	2	6	625561	625566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843300
17115	NC_017062	AAGTA	2	10	625567	625576	60 %	20 %	20 %	0 %	383843300
17116	NC_017062	TAAT	2	8	625581	625588	50 %	50 %	0 %	0 %	383843300
17117	NC_017062	ATT	2	6	625618	625623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843300
17118	NC_017062	TAG	3	9	625644	625652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843300
17119	NC_017062	TGA	2	6	625671	625676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843300
17120	NC_017062	CT	3	6	625700	625705	0 %	50 %	0 %	50 %	383843300
17121	NC_017062	GAA	2	6	625706	625711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843300
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