MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_017062	ATT	2	6	603316	603321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16502	NC_017062	AC	3	6	603346	603351	50 %	0 %	0 %	50 %	383843284
16503	NC_017062	AGTAAA	2	12	603395	603406	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383843284
16504	NC_017062	ACC	2	6	603504	603509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383843284
16505	NC_017062	TAT	2	6	603526	603531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843284
16506	NC_017062	TAA	2	6	603546	603551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843284
16507	NC_017062	ACC	2	6	603566	603571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383843284
16508	NC_017062	TACC	2	8	603580	603587	25 %	25 %	0 %	50 %	383843284
16509	NC_017062	AGGT	2	8	603598	603605	25 %	25 %	50 %	0 %	383843284
16510	NC_017062	GCA	2	6	603642	603647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843284
16511	NC_017062	TTC	2	6	603669	603674	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843284
16512	NC_017062	T	6	6	603689	603694	0 %	100 %	0 %	0 %	383843285
16513	NC_017062	T	6	6	603701	603706	0 %	100 %	0 %	0 %	383843285
16514	NC_017062	GCT	2	6	603726	603731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843285
16515	NC_017062	TCT	2	6	603741	603746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843285
16516	NC_017062	CGG	2	6	603773	603778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383843285
16517	NC_017062	TCT	2	6	603825	603830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843285
16518	NC_017062	TAA	2	6	603916	603921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843285
16519	NC_017062	TCGTCA	2	12	603924	603935	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383843285
16520	NC_017062	GCAG	2	8	603965	603972	25 %	0 %	50 %	25 %	383843285
16521	NC_017062	CAA	2	6	603979	603984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383843285
16522	NC_017062	T	8	8	603999	604006	0 %	100 %	0 %	0 %	383843285
16523	NC_017062	T	6	6	604058	604063	0 %	100 %	0 %	0 %	383843285
16524	NC_017062	TTATA	2	10	604094	604103	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16525	NC_017062	TCT	2	6	604142	604147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843286
16526	NC_017062	CTT	2	6	604160	604165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843286
16527	NC_017062	CAT	2	6	604167	604172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843286
16528	NC_017062	AGT	2	6	604251	604256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843286
16529	NC_017062	TTC	2	6	604296	604301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843286
16530	NC_017062	ATG	2	6	604328	604333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843286
16531	NC_017062	AGA	2	6	604365	604370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843286
16532	NC_017062	AAT	2	6	604395	604400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843286
16533	NC_017062	TAAA	2	8	604470	604477	75 %	25 %	0 %	0 %	383843286
16534	NC_017062	CTA	2	6	604489	604494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843286
16535	NC_017062	TA	4	8	604493	604500	50 %	50 %	0 %	0 %	383843286
16536	NC_017062	CAG	2	6	604571	604576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843286
16537	NC_017062	CT	4	8	604628	604635	0 %	50 %	0 %	50 %	383843286
16538	NC_017062	CCA	3	9	604639	604647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383843286
16539	NC_017062	GTG	2	6	604655	604660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383843286
16540	NC_017062	T	7	7	604677	604683	0 %	100 %	0 %	0 %	383843286
16541	NC_017062	TA	4	8	604686	604693	50 %	50 %	0 %	0 %	383843286
16542	NC_017062	A	6	6	604809	604814	100 %	0 %	0 %	0 %	383843286
16543	NC_017062	CTT	2	6	604819	604824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843286
16544	NC_017062	ATT	2	6	604875	604880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843286
16545	NC_017062	TAT	2	6	604944	604949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843286
16546	NC_017062	CTT	2	6	604988	604993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843286
16547	NC_017062	ATA	2	6	605047	605052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843286
16548	NC_017062	T	8	8	605056	605063	0 %	100 %	0 %	0 %	383843286
16549	NC_017062	TTA	2	6	605090	605095	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843286
16550	NC_017062	TTA	2	6	605101	605106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843286
16551	NC_017062	AAT	2	6	605130	605135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843286
16552	NC_017062	CCAA	2	8	605205	605212	50 %	0 %	0 %	50 %	383843286
16553	NC_017062	TAG	2	6	605246	605251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843286
16554	NC_017062	AGT	2	6	605295	605300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843286
16555	NC_017062	AT	4	8	605314	605321	50 %	50 %	0 %	0 %	383843286
16556	NC_017062	T	6	6	605335	605340	0 %	100 %	0 %	0 %	383843286
16557	NC_017062	TTG	2	6	605343	605348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843286
16558	NC_017062	AT	3	6	605457	605462	50 %	50 %	0 %	0 %	383843287
16559	NC_017062	CTC	2	6	605463	605468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383843287
16560	NC_017062	CTT	3	9	605543	605551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843287
16561	NC_017062	TGA	2	6	605598	605603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843287
16562	NC_017062	GTA	2	6	605692	605697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843287
16563	NC_017062	TTA	2	6	605716	605721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843287
16564	NC_017062	TAA	2	6	605723	605728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843287
16565	NC_017062	T	7	7	605745	605751	0 %	100 %	0 %	0 %	383843287
16566	NC_017062	TCTT	2	8	605766	605773	0 %	75 %	0 %	25 %	383843287
16567	NC_017062	T	6	6	605809	605814	0 %	100 %	0 %	0 %	383843287
16568	NC_017062	CAG	2	6	605825	605830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843287
16569	NC_017062	CCT	3	9	605893	605901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383843287
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16573	NC_017062	CAT	2	6	606065	606070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843287
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16585	NC_017062	GCCA	2	8	606447	606454	25 %	0 %	25 %	50 %	383843287
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16588	NC_017062	AGT	2	6	606528	606533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16590	NC_017062	AT	3	6	606556	606561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16591	NC_017062	TTAAA	2	10	606562	606571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16592	NC_017062	ACA	2	6	606576	606581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16593	NC_017062	AT	3	6	606592	606597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16594	NC_017062	ATA	2	6	606695	606700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16595	NC_017062	ACA	2	6	606713	606718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16596	NC_017062	ATA	2	6	606722	606727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16597	NC_017062	AT	3	6	606765	606770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16598	NC_017062	T	6	6	606809	606814	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16599	NC_017062	AAT	2	6	606837	606842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16600	NC_017062	AT	4	8	606849	606856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16601	NC_017062	TTA	2	6	606892	606897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16602	NC_017062	TAAAT	2	10	607050	607059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16603	NC_017062	TAG	2	6	607073	607078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16604	NC_017062	ATG	2	6	607089	607094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16605	NC_017062	T	6	6	607116	607121	0 %	100 %	0 %	0 %	383843288
16606	NC_017062	TTA	2	6	607139	607144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843288
16607	NC_017062	AATA	2	8	607159	607166	75 %	25 %	0 %	0 %	383843288
16608	NC_017062	A	6	6	607169	607174	100 %	0 %	0 %	0 %	383843288
16609	NC_017062	GTA	2	6	607188	607193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843288
16610	NC_017062	TAATA	2	10	607222	607231	60 %	40 %	0 %	0 %	383843288
16611	NC_017062	ATT	2	6	607247	607252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843288
16612	NC_017062	TAA	2	6	607308	607313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843288
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16614	NC_017062	CTC	2	6	607352	607357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383843288
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16619	NC_017062	TAAA	2	8	607413	607420	75 %	25 %	0 %	0 %	383843288
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