MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_017062	AAT	2	6	550277	550282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_017062	TCAA	2	8	550290	550297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15003	NC_017062	TAA	2	6	550342	550347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15004	NC_017062	AT	3	6	550355	550360	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15005	NC_017062	TTA	2	6	550380	550385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15006	NC_017062	AAT	2	6	550386	550391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_017062	GTG	2	6	550392	550397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15008	NC_017062	TA	3	6	550415	550420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15009	NC_017062	ATG	2	6	550427	550432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_017062	AAT	2	6	550452	550457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_017062	AAAAT	2	10	550488	550497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_017062	T	6	6	550509	550514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15013	NC_017062	A	6	6	550540	550545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_017062	TA	3	6	550560	550565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15015	NC_017062	AAG	2	6	550581	550586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15016	NC_017062	TAA	2	6	550621	550626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15017	NC_017062	A	6	6	550645	550650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_017062	ATT	2	6	550684	550689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_017062	A	6	6	550696	550701	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15020	NC_017062	ATT	2	6	550709	550714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_017062	A	6	6	550778	550783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15022	NC_017062	ATT	2	6	550840	550845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15023	NC_017062	AGA	2	6	550902	550907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_017062	TAAG	2	8	550930	550937	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15025	NC_017062	TTG	2	6	551016	551021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_017062	CAG	2	6	551031	551036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15027	NC_017062	A	7	7	551072	551078	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15028	NC_017062	AT	3	6	551094	551099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_017062	TAA	2	6	551128	551133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15030	NC_017062	AG	3	6	551138	551143	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15031	NC_017062	TAG	2	6	551171	551176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15032	NC_017062	ATA	2	6	551185	551190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_017062	AAG	2	6	551206	551211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15034	NC_017062	ATTA	2	8	551224	551231	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_017062	A	6	6	551233	551238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15036	NC_017062	GAT	2	6	551254	551259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15037	NC_017062	A	6	6	551297	551302	100 %	0 %	0 %	0 %	383843252
15038	NC_017062	A	8	8	551305	551312	100 %	0 %	0 %	0 %	383843252
15039	NC_017062	TGA	2	6	551313	551318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843252
15040	NC_017062	AAT	2	6	551352	551357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843252
15041	NC_017062	A	6	6	551364	551369	100 %	0 %	0 %	0 %	383843252
15042	NC_017062	TAG	2	6	551376	551381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843252
15043	NC_017062	GAA	2	6	551443	551448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843252
15044	NC_017062	TA	3	6	551449	551454	50 %	50 %	0 %	0 %	383843252
15045	NC_017062	ATT	2	6	551485	551490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843252
15046	NC_017062	TAG	2	6	551525	551530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843252
15047	NC_017062	GCA	2	6	551578	551583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843252
15048	NC_017062	AGC	2	6	551616	551621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843252
15049	NC_017062	TAC	2	6	551636	551641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843252
15050	NC_017062	ATG	2	6	551648	551653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843252
15051	NC_017062	TGA	2	6	551664	551669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843252
15052	NC_017062	AGA	2	6	551688	551693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843252
15053	NC_017062	A	6	6	551731	551736	100 %	0 %	0 %	0 %	383843252
15054	NC_017062	ACA	2	6	551817	551822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383843252
15055	NC_017062	TAT	2	6	551868	551873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843252
15056	NC_017062	TAA	2	6	551898	551903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843252
15057	NC_017062	TAAA	2	8	551930	551937	75 %	25 %	0 %	0 %	383843252
15058	NC_017062	TGC	2	6	551970	551975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843252
15059	NC_017062	A	7	7	552011	552017	100 %	0 %	0 %	0 %	383843252
15060	NC_017062	TCA	2	6	552064	552069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843252
15061	NC_017062	TAA	2	6	552092	552097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843252
15062	NC_017062	TAA	3	9	552171	552179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843252
15063	NC_017062	ATT	2	6	552227	552232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843252
15064	NC_017062	AGA	2	6	552234	552239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843252
15065	NC_017062	ATAAAG	2	12	552377	552388	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383843252
15066	NC_017062	ACT	2	6	552391	552396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843252
15067	NC_017062	CAA	2	6	552454	552459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383843252
15068	NC_017062	AATTTA	2	12	552466	552477	50 %	50 %	0 %	0 %	383843252
15069	NC_017062	CTA	2	6	552587	552592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843252
15070	NC_017062	AAG	2	6	552599	552604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843252
15071	NC_017062	AAG	2	6	552609	552614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843252
15072	NC_017062	AAT	2	6	552630	552635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15073	NC_017062	TGG	2	6	552775	552780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383843253
15074	NC_017062	ATC	2	6	552793	552798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843253
15075	NC_017062	GCC	2	6	552835	552840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383843253
15076	NC_017062	TAG	2	6	552853	552858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843253
15077	NC_017062	TTA	2	6	552891	552896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843253
15078	NC_017062	TAC	2	6	552912	552917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843253
15079	NC_017062	AT	3	6	552970	552975	50 %	50 %	0 %	0 %	383843253
15080	NC_017062	TTC	2	6	552982	552987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843253
15081	NC_017062	TAAA	2	8	552991	552998	75 %	25 %	0 %	0 %	383843253
15082	NC_017062	T	7	7	553009	553015	0 %	100 %	0 %	0 %	383843253
15083	NC_017062	GT	3	6	553077	553082	0 %	50 %	50 %	0 %	383843253
15084	NC_017062	TA	4	8	553092	553099	50 %	50 %	0 %	0 %	383843253
15085	NC_017062	TTA	2	6	553100	553105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843253
15086	NC_017062	ATAA	2	8	553116	553123	75 %	25 %	0 %	0 %	383843253
15087	NC_017062	CAT	2	6	553125	553130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843253
15088	NC_017062	TAA	2	6	553156	553161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843253
15089	NC_017062	CCG	3	9	553214	553222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383843253
15090	NC_017062	CCTGCT	2	12	553286	553297	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	383843253
15091	NC_017062	TAG	2	6	553328	553333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843253
15092	NC_017062	TTC	2	6	553342	553347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843253
15093	NC_017062	CTT	2	6	553371	553376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843253
15094	NC_017062	TA	3	6	553391	553396	50 %	50 %	0 %	0 %	383843253
15095	NC_017062	TAA	2	6	553409	553414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843253
15096	NC_017062	GCT	2	6	553418	553423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843253
15097	NC_017062	TAAA	2	8	553453	553460	75 %	25 %	0 %	0 %	383843253
15098	NC_017062	AAT	2	6	553478	553483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843253
15099	NC_017062	ACT	2	6	553519	553524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843253
15100	NC_017062	ATT	2	6	553576	553581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843253
15101	NC_017062	CTC	2	6	553587	553592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383843253
15102	NC_017062	T	6	6	553611	553616	0 %	100 %	0 %	0 %	383843253
15103	NC_017062	A	8	8	553633	553640	100 %	0 %	0 %	0 %	383843253
15104	NC_017062	TA	3	6	553696	553701	50 %	50 %	0 %	0 %	383843253
15105	NC_017062	TAT	2	6	553713	553718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843253
15106	NC_017062	GAG	2	6	553737	553742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383843253
15107	NC_017062	GTA	2	6	553746	553751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843253
15108	NC_017062	TAAT	2	8	553767	553774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_017062	TATAT	2	10	553802	553811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15110	NC_017062	TA	3	6	553832	553837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_017062	TGA	2	6	553859	553864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843254
15112	NC_017062	A	6	6	553867	553872	100 %	0 %	0 %	0 %	383843254
15113	NC_017062	GA	3	6	553893	553898	50 %	0 %	50 %	0 %	383843254
15114	NC_017062	TTG	2	6	553934	553939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843254
15115	NC_017062	A	6	6	553945	553950	100 %	0 %	0 %	0 %	383843254
15116	NC_017062	CT	3	6	553963	553968	0 %	50 %	0 %	50 %	383843254
15117	NC_017062	TAC	2	6	553971	553976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843254
15118	NC_017062	GAA	2	6	553984	553989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843254
15119	NC_017062	AAT	2	6	553990	553995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843254
15120	NC_017062	AT	3	6	554001	554006	50 %	50 %	0 %	0 %	383843254
15121	NC_017062	A	6	6	554023	554028	100 %	0 %	0 %	0 %	383843254
15122	NC_017062	GAA	2	6	554173	554178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843254
15123	NC_017062	ATT	2	6	554200	554205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843254
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15125	NC_017062	ATA	2	6	554231	554236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843254
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