MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_017062	TGA	2	6	532985	532990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843238
14503	NC_017062	A	7	7	532994	533000	100 %	0 %	0 %	0 %	383843238
14504	NC_017062	T	6	6	533020	533025	0 %	100 %	0 %	0 %	383843238
14505	NC_017062	TTC	2	6	533030	533035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843238
14506	NC_017062	T	6	6	533078	533083	0 %	100 %	0 %	0 %	383843238
14507	NC_017062	AGC	2	6	533087	533092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843238
14508	NC_017062	ATT	2	6	533123	533128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843238
14509	NC_017062	TTCCA	2	10	533174	533183	20 %	40 %	0 %	40 %	383843238
14510	NC_017062	TAT	2	6	533213	533218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843238
14511	NC_017062	T	7	7	533256	533262	0 %	100 %	0 %	0 %	383843238
14512	NC_017062	TTA	2	6	533271	533276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843238
14513	NC_017062	ACTGT	2	10	533283	533292	20 %	40 %	20 %	20 %	383843238
14514	NC_017062	TAAT	2	8	533374	533381	50 %	50 %	0 %	0 %	383843238
14515	NC_017062	TTA	2	6	533382	533387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843238
14516	NC_017062	AAT	2	6	533402	533407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843238
14517	NC_017062	TAA	2	6	533417	533422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843238
14518	NC_017062	TAT	2	6	533426	533431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843238
14519	NC_017062	GAG	2	6	533434	533439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383843238
14520	NC_017062	T	8	8	533450	533457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_017062	A	7	7	533486	533492	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_017062	TAA	2	6	533510	533515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_017062	ATTT	2	8	533524	533531	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_017062	TTA	2	6	533532	533537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14525	NC_017062	A	6	6	533537	533542	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_017062	ATT	2	6	533576	533581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_017062	ATT	2	6	533622	533627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_017062	TTA	2	6	533641	533646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_017062	TTTGT	2	10	533742	533751	0 %	80 %	20 %	0 %	383843239
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14531	NC_017062	TTTAT	2	10	533847	533856	20 %	80 %	0 %	0 %	383843239
14532	NC_017062	TAA	2	6	533860	533865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843239
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14535	NC_017062	CTG	2	6	533968	533973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843239
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14537	NC_017062	TGCT	2	8	534070	534077	0 %	50 %	25 %	25 %	383843239
14538	NC_017062	TGT	2	6	534084	534089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843239
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14540	NC_017062	AT	3	6	534130	534135	50 %	50 %	0 %	0 %	383843240
14541	NC_017062	ATA	2	6	534149	534154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843240
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14546	NC_017062	TATAA	2	10	534283	534292	60 %	40 %	0 %	0 %	383843240
14547	NC_017062	A	6	6	534343	534348	100 %	0 %	0 %	0 %	383843240
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14552	NC_017062	TTA	2	6	534424	534429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843240
14553	NC_017062	TAT	2	6	534433	534438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843240
14554	NC_017062	ATA	2	6	534489	534494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843240
14555	NC_017062	AAT	2	6	534519	534524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843240
14556	NC_017062	TAA	2	6	534556	534561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_017062	T	6	6	534562	534567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_017062	ATT	2	6	534576	534581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_017062	A	7	7	534588	534594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_017062	TAA	2	6	534608	534613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_017062	AATTT	2	10	534644	534653	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_017062	TA	3	6	534672	534677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14563	NC_017062	CAA	3	9	534711	534719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383843241
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14566	NC_017062	T	6	6	534759	534764	0 %	100 %	0 %	0 %	383843241
14567	NC_017062	T	7	7	534823	534829	0 %	100 %	0 %	0 %	383843241
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14576	NC_017062	TAT	2	6	535034	535039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843241
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14579	NC_017062	T	6	6	535176	535181	0 %	100 %	0 %	0 %	383843241
14580	NC_017062	A	6	6	535187	535192	100 %	0 %	0 %	0 %	383843241
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14598	NC_017062	AGG	2	6	536058	536063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_017062	TAT	2	6	536067	536072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843243
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14603	NC_017062	AAT	2	6	536308	536313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843243
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14607	NC_017062	TTGC	2	8	536530	536537	0 %	50 %	25 %	25 %	383843243
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14612	NC_017062	TTAT	2	8	536775	536782	25 %	75 %	0 %	0 %	383843243
14613	NC_017062	AAG	2	6	536796	536801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843243
14614	NC_017062	GAAA	2	8	536820	536827	75 %	0 %	25 %	0 %	383843243
14615	NC_017062	ATT	2	6	536828	536833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843243
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14622	NC_017062	TGG	2	6	537027	537032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383843243
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