MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017062	TAA	2	6	497884	497889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_017062	TAG	2	6	497909	497914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_017062	TA	3	6	497963	497968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_017062	AAT	2	6	498001	498006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_017062	AAT	3	9	498025	498033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_017062	TA	3	6	498057	498062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_017062	A	6	6	498150	498155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13508	NC_017062	TAG	2	6	498195	498200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_017062	CCT	2	6	498208	498213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13510	NC_017062	TCT	2	6	498254	498259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_017062	AATT	2	8	498295	498302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13512	NC_017062	AATT	2	8	498345	498352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13513	NC_017062	A	7	7	498367	498373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_017062	ATT	2	6	498399	498404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13515	NC_017062	GATT	2	8	498408	498415	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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13518	NC_017062	TTG	2	6	498495	498500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_017062	CTTA	2	8	498509	498516	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13520	NC_017062	TGAT	2	8	498546	498553	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_017062	T	7	7	498590	498596	0 %	100 %	0 %	0 %	383843210
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13524	NC_017062	GTA	2	6	498712	498717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843210
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13526	NC_017062	ATATA	2	10	498829	498838	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13529	NC_017062	ATTGT	2	10	498912	498921	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13530	NC_017062	AAT	2	6	498922	498927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_017062	ATT	2	6	498956	498961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13532	NC_017062	ATT	2	6	499001	499006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13533	NC_017062	TACA	2	8	499024	499031	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13534	NC_017062	CAA	2	6	499048	499053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_017062	ATA	2	6	499059	499064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_017062	TAA	2	6	499072	499077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_017062	ATG	2	6	499130	499135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13539	NC_017062	A	6	6	499194	499199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_017062	AT	4	8	499212	499219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_017062	TAA	2	6	499259	499264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_017062	TA	3	6	499278	499283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_017062	TAC	2	6	499287	499292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13546	NC_017062	TAA	2	6	499363	499368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_017062	AAGT	2	8	499407	499414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_017062	TATT	2	8	499436	499443	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_017062	AT	3	6	499525	499530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_017062	CAA	2	6	499539	499544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13551	NC_017062	ATT	2	6	499580	499585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13552	NC_017062	TAA	2	6	499656	499661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13553	NC_017062	CAA	2	6	499666	499671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13554	NC_017062	CTA	2	6	499677	499682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13556	NC_017062	ATT	2	6	499725	499730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13557	NC_017062	ATA	3	9	499731	499739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13558	NC_017062	ATG	2	6	499748	499753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13560	NC_017062	TAC	2	6	499776	499781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13562	NC_017062	T	6	6	499860	499865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_017062	ATTT	2	8	499872	499879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13564	NC_017062	AT	3	6	499880	499885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_017062	ATT	2	6	499893	499898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_017062	TAA	2	6	499900	499905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13567	NC_017062	A	6	6	499904	499909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13568	NC_017062	AAT	2	6	499918	499923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13610	NC_017062	AT	3	6	501421	501426	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_017062	ATC	2	6	501429	501434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13613	NC_017062	A	6	6	501451	501456	100 %	0 %	0 %	0 %	383843212
13614	NC_017062	GTA	2	6	501476	501481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843212
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13622	NC_017062	TGA	2	6	501707	501712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843212
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