MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017062	ACT	2	6	480306	480311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843192
13002	NC_017062	ATA	2	6	480421	480426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843192
13003	NC_017062	ACT	2	6	480501	480506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843192
13004	NC_017062	GAA	2	6	480515	480520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843192
13005	NC_017062	TTA	2	6	480538	480543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843192
13006	NC_017062	GCA	2	6	480558	480563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843192
13007	NC_017062	A	6	6	480574	480579	100 %	0 %	0 %	0 %	383843192
13008	NC_017062	ATT	2	6	480587	480592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843192
13009	NC_017062	TAA	3	9	480650	480658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843192
13010	NC_017062	ATA	2	6	480684	480689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843192
13011	NC_017062	GAA	2	6	480695	480700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843192
13012	NC_017062	ATATT	2	10	480713	480722	40 %	60 %	0 %	0 %	383843192
13013	NC_017062	ATA	2	6	480771	480776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_017062	ATT	2	6	480786	480791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_017062	TTCAC	2	10	480810	480819	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13016	NC_017062	AC	3	6	480818	480823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13017	NC_017062	ATT	2	6	480895	480900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843193
13018	NC_017062	T	6	6	480899	480904	0 %	100 %	0 %	0 %	383843193
13019	NC_017062	TAAA	2	8	480915	480922	75 %	25 %	0 %	0 %	383843193
13020	NC_017062	GTT	2	6	480934	480939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843193
13021	NC_017062	ATTTT	2	10	480947	480956	20 %	80 %	0 %	0 %	383843193
13022	NC_017062	T	7	7	480960	480966	0 %	100 %	0 %	0 %	383843193
13023	NC_017062	T	8	8	480975	480982	0 %	100 %	0 %	0 %	383843193
13024	NC_017062	ATTCT	2	10	481011	481020	20 %	60 %	0 %	20 %	383843193
13025	NC_017062	TAT	2	6	481081	481086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843193
13026	NC_017062	TAT	2	6	481137	481142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843193
13027	NC_017062	TGC	2	6	481192	481197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843193
13028	NC_017062	AGTA	2	8	481198	481205	50 %	25 %	25 %	0 %	383843193
13029	NC_017062	T	7	7	481236	481242	0 %	100 %	0 %	0 %	383843193
13030	NC_017062	ATG	2	6	481275	481280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843193
13031	NC_017062	TTTTA	2	10	481333	481342	20 %	80 %	0 %	0 %	383843193
13032	NC_017062	TA	3	6	481369	481374	50 %	50 %	0 %	0 %	383843193
13033	NC_017062	ATC	2	6	481390	481395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843193
13034	NC_017062	A	6	6	481473	481478	100 %	0 %	0 %	0 %	383843193
13035	NC_017062	CAA	2	6	481518	481523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383843193
13036	NC_017062	TCT	2	6	481534	481539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843193
13037	NC_017062	TAT	2	6	481555	481560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843193
13038	NC_017062	T	6	6	481593	481598	0 %	100 %	0 %	0 %	383843193
13039	NC_017062	TGT	2	6	481609	481614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843193
13040	NC_017062	T	6	6	481622	481627	0 %	100 %	0 %	0 %	383843193
13041	NC_017062	AGT	2	6	481635	481640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843193
13042	NC_017062	GAT	2	6	481690	481695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843193
13043	NC_017062	CTGTG	2	10	481704	481713	0 %	40 %	40 %	20 %	383843193
13044	NC_017062	TCT	2	6	481723	481728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843193
13045	NC_017062	ATT	2	6	481781	481786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843193
13046	NC_017062	ATT	2	6	481790	481795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843193
13047	NC_017062	ATT	2	6	481805	481810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843194
13048	NC_017062	AC	3	6	481826	481831	50 %	0 %	0 %	50 %	383843194
13049	NC_017062	CTT	2	6	481885	481890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843194
13050	NC_017062	AAAT	2	8	481907	481914	75 %	25 %	0 %	0 %	383843194
13051	NC_017062	CTAA	2	8	481968	481975	50 %	25 %	0 %	25 %	383843194
13052	NC_017062	ATT	2	6	482039	482044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843194
13053	NC_017062	TTTA	2	8	482048	482055	25 %	75 %	0 %	0 %	383843194
13054	NC_017062	TAA	2	6	482068	482073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843194
13055	NC_017062	CTT	2	6	482074	482079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843194
13056	NC_017062	TAA	2	6	482150	482155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843194
13057	NC_017062	ATTT	2	8	482180	482187	25 %	75 %	0 %	0 %	383843194
13058	NC_017062	ATT	2	6	482207	482212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843194
13059	NC_017062	T	6	6	482211	482216	0 %	100 %	0 %	0 %	383843194
13060	NC_017062	CAT	2	6	482251	482256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843194
13061	NC_017062	AGA	2	6	482352	482357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843194
13062	NC_017062	AAC	2	6	482387	482392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_017062	AT	3	6	482575	482580	50 %	50 %	0 %	0 %	383843195
13064	NC_017062	TAA	2	6	482610	482615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843195
13065	NC_017062	AAAT	2	8	482633	482640	75 %	25 %	0 %	0 %	383843195
13066	NC_017062	ACT	2	6	482710	482715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843195
13067	NC_017062	TAC	2	6	482721	482726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843195
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13069	NC_017062	A	6	6	482740	482745	100 %	0 %	0 %	0 %	383843195
13070	NC_017062	TCT	2	6	482779	482784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843195
13071	NC_017062	CT	3	6	482800	482805	0 %	50 %	0 %	50 %	383843195
13072	NC_017062	ATT	2	6	482854	482859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843195
13073	NC_017062	ATATA	2	10	482871	482880	60 %	40 %	0 %	0 %	383843195
13074	NC_017062	TA	3	6	482895	482900	50 %	50 %	0 %	0 %	383843195
13075	NC_017062	GAA	2	6	482953	482958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843195
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13078	NC_017062	TATAA	2	10	482988	482997	60 %	40 %	0 %	0 %	383843195
13079	NC_017062	ATA	2	6	483013	483018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843195
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13081	NC_017062	A	8	8	483065	483072	100 %	0 %	0 %	0 %	383843195
13082	NC_017062	A	6	6	483078	483083	100 %	0 %	0 %	0 %	383843195
13083	NC_017062	ATT	2	6	483132	483137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_017062	TAA	2	6	483143	483148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13085	NC_017062	AATT	2	8	483149	483156	50 %	50 %	0 %	0 %	383843196
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13094	NC_017062	TTAA	2	8	483482	483489	50 %	50 %	0 %	0 %	383843196
13095	NC_017062	AT	3	6	483496	483501	50 %	50 %	0 %	0 %	383843196
13096	NC_017062	TAT	2	6	483535	483540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843196
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13104	NC_017062	A	6	6	483841	483846	100 %	0 %	0 %	0 %	383843196
13105	NC_017062	ACT	2	6	483866	483871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843196
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13108	NC_017062	TTTGT	2	10	483915	483924	0 %	80 %	20 %	0 %	383843196
13109	NC_017062	TAA	2	6	483946	483951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843196
13110	NC_017062	ACT	2	6	483977	483982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843196
13111	NC_017062	TAT	2	6	484003	484008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_017062	TGA	2	6	484046	484051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843197
13113	NC_017062	T	6	6	484128	484133	0 %	100 %	0 %	0 %	383843197
13114	NC_017062	TTC	2	6	484159	484164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843197
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13116	NC_017062	ATCTT	2	10	484194	484203	20 %	60 %	0 %	20 %	383843197
13117	NC_017062	AT	3	6	484272	484277	50 %	50 %	0 %	0 %	383843197
13118	NC_017062	GTTT	2	8	484282	484289	0 %	75 %	25 %	0 %	383843197
13119	NC_017062	TAT	2	6	484290	484295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843197
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13496	NC_017062	AAT	2	6	497696	497701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13497	NC_017062	GCA	2	6	497723	497728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13498	NC_017062	AATT	2	8	497748	497755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13499	NC_017062	TGA	2	6	497767	497772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13500	NC_017062	CTG	2	6	497810	497815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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