MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017062	TAA	2	6	426888	426893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_017062	A	6	6	426892	426897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11503	NC_017062	TTG	2	6	426912	426917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11504	NC_017062	ATTT	2	8	426976	426983	25 %	75 %	0 %	0 %	383843153
11505	NC_017062	T	6	6	426991	426996	0 %	100 %	0 %	0 %	383843153
11506	NC_017062	GTTT	2	8	427013	427020	0 %	75 %	25 %	0 %	383843153
11507	NC_017062	CTTG	2	8	427031	427038	0 %	50 %	25 %	25 %	383843153
11508	NC_017062	T	6	6	427063	427068	0 %	100 %	0 %	0 %	383843153
11509	NC_017062	TAA	2	6	427109	427114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843153
11510	NC_017062	CTG	2	6	427128	427133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843153
11511	NC_017062	T	6	6	427138	427143	0 %	100 %	0 %	0 %	383843153
11512	NC_017062	AAT	2	6	427181	427186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843153
11513	NC_017062	AGG	2	6	427254	427259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383843153
11514	NC_017062	TAATAT	2	12	427268	427279	50 %	50 %	0 %	0 %	383843153
11515	NC_017062	GCA	2	6	427345	427350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843153
11516	NC_017062	ATTT	2	8	427361	427368	25 %	75 %	0 %	0 %	383843153
11517	NC_017062	CCG	2	6	427429	427434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383843153
11518	NC_017062	TAA	2	6	427448	427453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843153
11519	NC_017062	TAT	2	6	427635	427640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11520	NC_017062	TTTTA	2	10	427641	427650	20 %	80 %	0 %	0 %	383843153
11521	NC_017062	T	6	6	427684	427689	0 %	100 %	0 %	0 %	383843153
11522	NC_017062	TTGATT	2	12	427693	427704	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	383843153
11523	NC_017062	CAC	2	6	427754	427759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383843153
11524	NC_017062	CCG	2	6	427798	427803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383843153
11525	NC_017062	ATT	2	6	427827	427832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11526	NC_017062	TAT	2	6	427833	427838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11527	NC_017062	ATT	2	6	427917	427922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11528	NC_017062	ATT	2	6	427935	427940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11529	NC_017062	TGA	2	6	427960	427965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843153
11530	NC_017062	ATT	2	6	427971	427976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11531	NC_017062	TTTA	2	8	427980	427987	25 %	75 %	0 %	0 %	383843153
11532	NC_017062	TAT	2	6	428129	428134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11533	NC_017062	T	6	6	428156	428161	0 %	100 %	0 %	0 %	383843153
11534	NC_017062	ATT	2	6	428202	428207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11535	NC_017062	ATT	2	6	428238	428243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11536	NC_017062	TC	3	6	428297	428302	0 %	50 %	0 %	50 %	383843153
11537	NC_017062	T	6	6	428391	428396	0 %	100 %	0 %	0 %	383843153
11538	NC_017062	TAA	2	6	428399	428404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843153
11539	NC_017062	ATT	3	9	428550	428558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11540	NC_017062	TAT	2	6	428636	428641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11541	NC_017062	ATT	2	6	428673	428678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11542	NC_017062	ATT	2	6	428742	428747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11543	NC_017062	ATT	2	6	428815	428820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11544	NC_017062	TTA	2	6	428935	428940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11545	NC_017062	ATT	2	6	428952	428957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11546	NC_017062	T	7	7	428956	428962	0 %	100 %	0 %	0 %	383843153
11547	NC_017062	TA	4	8	428964	428971	50 %	50 %	0 %	0 %	383843153
11548	NC_017062	ATTA	2	8	429000	429007	50 %	50 %	0 %	0 %	383843153
11549	NC_017062	TTAT	2	8	429061	429068	25 %	75 %	0 %	0 %	383843153
11550	NC_017062	TTA	3	9	429076	429084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11551	NC_017062	T	7	7	429103	429109	0 %	100 %	0 %	0 %	383843153
11552	NC_017062	CTC	2	6	429176	429181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383843153
11553	NC_017062	ATG	2	6	429203	429208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843153
11554	NC_017062	TGA	2	6	429258	429263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843153
11555	NC_017062	GTA	2	6	429299	429304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843153
11556	NC_017062	TAT	2	6	429366	429371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11557	NC_017062	ATT	2	6	429384	429389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11558	NC_017062	A	7	7	429399	429405	100 %	0 %	0 %	0 %	383843153
11559	NC_017062	ATT	3	9	429409	429417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843153
11560	NC_017062	AAT	2	6	429418	429423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843153
11561	NC_017062	ATA	2	6	429442	429447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843153
11562	NC_017062	CTTT	2	8	429482	429489	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11563	NC_017062	AT	3	6	429547	429552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_017062	GTA	2	6	429553	429558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11565	NC_017062	TC	3	6	429656	429661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11566	NC_017062	AATTT	2	10	429666	429675	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_017062	AT	3	6	429684	429689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_017062	AT	3	6	429698	429703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11569	NC_017062	TA	3	6	429722	429727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11570	NC_017062	AG	3	6	429781	429786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11571	NC_017062	T	6	6	429787	429792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11572	NC_017062	ATTT	2	8	429819	429826	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11573	NC_017062	ATT	2	6	429880	429885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11574	NC_017062	TAATA	2	10	429897	429906	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11575	NC_017062	ACA	2	6	429959	429964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_017062	ATTT	2	8	429983	429990	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_017062	TAT	2	6	429992	429997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_017062	T	7	7	430013	430019	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11579	NC_017062	ATA	2	6	430025	430030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11580	NC_017062	TTTG	2	8	430043	430050	0 %	75 %	25 %	0 %	383843154
11581	NC_017062	TAG	2	6	430080	430085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843154
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11583	NC_017062	TTA	2	6	430097	430102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843154
11584	NC_017062	TAA	2	6	430108	430113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843154
11585	NC_017062	GTT	2	6	430118	430123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843154
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11588	NC_017062	TCT	3	9	430250	430258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843154
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11590	NC_017062	AATT	2	8	430348	430355	50 %	50 %	0 %	0 %	383843154
11591	NC_017062	TTTC	2	8	430418	430425	0 %	75 %	0 %	25 %	383843154
11592	NC_017062	CATGA	2	10	430482	430491	40 %	20 %	20 %	20 %	383843154
11593	NC_017062	AATTAA	2	12	430504	430515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843154
11594	NC_017062	ATT	2	6	430554	430559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11595	NC_017062	AT	3	6	430560	430565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11596	NC_017062	AAT	2	6	430566	430571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11597	NC_017062	AT	3	6	430570	430575	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11598	NC_017062	A	7	7	430604	430610	100 %	0 %	0 %	0 %	383843155
11599	NC_017062	ATT	3	9	430639	430647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843155
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11604	NC_017062	GAA	2	6	430937	430942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843155
11605	NC_017062	TAA	2	6	431011	431016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843155
11606	NC_017062	TAA	2	6	431041	431046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843155
11607	NC_017062	A	7	7	431056	431062	100 %	0 %	0 %	0 %	383843155
11608	NC_017062	ACT	2	6	431096	431101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843155
11609	NC_017062	TAA	2	6	431134	431139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843155
11610	NC_017062	TGA	2	6	431143	431148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843155
11611	NC_017062	TAG	2	6	431151	431156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843155
11612	NC_017062	ATA	2	6	431175	431180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843155
11613	NC_017062	AT	3	6	431280	431285	50 %	50 %	0 %	0 %	383843155
11614	NC_017062	TAAA	2	8	431307	431314	75 %	25 %	0 %	0 %	383843155
11615	NC_017062	AAT	2	6	431357	431362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843155
11616	NC_017062	ATC	2	6	431398	431403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843155
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11618	NC_017062	ATTT	2	8	431551	431558	25 %	75 %	0 %	0 %	383843155
11619	NC_017062	AAT	2	6	431599	431604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843155
11620	NC_017062	TAA	2	6	431611	431616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843155
11621	NC_017062	A	6	6	431628	431633	100 %	0 %	0 %	0 %	383843155
11622	NC_017062	TGC	2	6	431641	431646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843155
11623	NC_017062	TGG	2	6	431701	431706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383843155
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12000	NC_017062	TAC	2	6	445165	445170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843169

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