MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_017062	TAAAA	2	10	278628	278637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7502	NC_017062	AATT	2	8	278664	278671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7503	NC_017062	ACA	2	6	278699	278704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7504	NC_017062	TGT	2	6	278718	278723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7505	NC_017062	ATTAA	2	10	278747	278756	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7506	NC_017062	ATT	2	6	278776	278781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7507	NC_017062	A	6	6	278783	278788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7508	NC_017062	TAC	2	6	278815	278820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843033
7509	NC_017062	ATT	2	6	278821	278826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843033
7510	NC_017062	AAT	2	6	278885	278890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843033
7511	NC_017062	GAG	2	6	278891	278896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383843033
7512	NC_017062	GCT	2	6	278903	278908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843033
7513	NC_017062	ATA	2	6	279012	279017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843033
7514	NC_017062	A	6	6	279017	279022	100 %	0 %	0 %	0 %	383843033
7515	NC_017062	ATT	2	6	279094	279099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843033
7516	NC_017062	GTG	2	6	279102	279107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383843033
7517	NC_017062	TGC	2	6	279118	279123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843033
7518	NC_017062	GCT	2	6	279131	279136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843033
7519	NC_017062	ATGC	2	8	279171	279178	25 %	25 %	25 %	25 %	383843033
7520	NC_017062	A	6	6	279183	279188	100 %	0 %	0 %	0 %	383843033
7521	NC_017062	TAT	2	6	279189	279194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843033
7522	NC_017062	TAA	2	6	279201	279206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843033
7523	NC_017062	GTAC	2	8	279263	279270	25 %	25 %	25 %	25 %	383843033
7524	NC_017062	GCT	2	6	279338	279343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843033
7525	NC_017062	AGGGC	2	10	279347	279356	20 %	0 %	60 %	20 %	383843033
7526	NC_017062	GCA	3	9	279359	279367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843033
7527	NC_017062	GCT	2	6	279383	279388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843033
7528	NC_017062	A	6	6	279407	279412	100 %	0 %	0 %	0 %	383843033
7529	NC_017062	TTA	2	6	279420	279425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843033
7530	NC_017062	GCT	2	6	279512	279517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843033
7531	NC_017062	ATT	2	6	279595	279600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843033
7532	NC_017062	AAGT	2	8	279606	279613	50 %	25 %	25 %	0 %	383843033
7533	NC_017062	GCT	2	6	279619	279624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843033
7534	NC_017062	TAC	3	9	279688	279696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843033
7535	NC_017062	AGG	2	6	279727	279732	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383843033
7536	NC_017062	GTT	2	6	279824	279829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843033
7537	NC_017062	TGC	2	6	279871	279876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843033
7538	NC_017062	ATT	2	6	280048	280053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843033
7539	NC_017062	GAA	2	6	280109	280114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843033
7540	NC_017062	AGA	2	6	280196	280201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843034
7541	NC_017062	AAT	2	6	280223	280228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843034
7542	NC_017062	AT	3	6	280276	280281	50 %	50 %	0 %	0 %	383843034
7543	NC_017062	GAA	3	9	280311	280319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843034
7544	NC_017062	ATA	2	6	280402	280407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843034
7545	NC_017062	GAA	2	6	280431	280436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843034
7546	NC_017062	TAG	2	6	280510	280515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843034
7547	NC_017062	AG	3	6	280549	280554	50 %	0 %	50 %	0 %	383843034
7548	NC_017062	GTA	2	6	280558	280563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843034
7549	NC_017062	CAT	2	6	280572	280577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7550	NC_017062	AT	3	6	280585	280590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7551	NC_017062	AGC	2	6	280608	280613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7552	NC_017062	AAC	2	6	280626	280631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7553	NC_017062	ATT	3	9	280685	280693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7554	NC_017062	TAAA	2	8	280708	280715	75 %	25 %	0 %	0 %	383843035
7555	NC_017062	ATT	2	6	280727	280732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843035
7556	NC_017062	TAT	2	6	280744	280749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843035
7557	NC_017062	TTG	2	6	280804	280809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843035
7558	NC_017062	T	7	7	280865	280871	0 %	100 %	0 %	0 %	383843035
7559	NC_017062	T	6	6	280887	280892	0 %	100 %	0 %	0 %	383843035
7560	NC_017062	A	7	7	280900	280906	100 %	0 %	0 %	0 %	383843035
7561	NC_017062	AT	3	6	280912	280917	50 %	50 %	0 %	0 %	383843035
7562	NC_017062	GATC	2	8	280970	280977	25 %	25 %	25 %	25 %	383843035
7563	NC_017062	AG	3	6	280980	280985	50 %	0 %	50 %	0 %	383843035
7564	NC_017062	AATGAA	2	12	280989	281000	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383843035
7565	NC_017062	ACA	2	6	281129	281134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383843035
7566	NC_017062	CAA	2	6	281200	281205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383843035
7567	NC_017062	ATG	2	6	281319	281324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843035
7568	NC_017062	GTA	2	6	281328	281333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843035
7569	NC_017062	GCA	2	6	281339	281344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843035
7570	NC_017062	AT	3	6	281355	281360	50 %	50 %	0 %	0 %	383843035
7571	NC_017062	CTA	2	6	281365	281370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843035
7572	NC_017062	TAA	2	6	281414	281419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843035
7573	NC_017062	A	7	7	281425	281431	100 %	0 %	0 %	0 %	383843035
7574	NC_017062	ACT	2	6	281457	281462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843035
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7576	NC_017062	ACT	2	6	281511	281516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843035
7577	NC_017062	CTA	2	6	281533	281538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843035
7578	NC_017062	CTA	2	6	281542	281547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843035
7579	NC_017062	CAT	2	6	281569	281574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843035
7580	NC_017062	ATG	2	6	281580	281585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843035
7581	NC_017062	AAT	2	6	281592	281597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843035
7582	NC_017062	ACG	2	6	281616	281621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843035
7583	NC_017062	AGT	2	6	281657	281662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843035
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7586	NC_017062	AAGA	2	8	281701	281708	75 %	0 %	25 %	0 %	383843035
7587	NC_017062	A	7	7	281732	281738	100 %	0 %	0 %	0 %	383843035
7588	NC_017062	CTTTAG	2	12	281803	281814	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	383843035
7589	NC_017062	A	7	7	281817	281823	100 %	0 %	0 %	0 %	383843035
7590	NC_017062	AAT	2	6	281844	281849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843035
7591	NC_017062	TTC	2	6	281873	281878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843035
7592	NC_017062	A	6	6	281948	281953	100 %	0 %	0 %	0 %	383843035
7593	NC_017062	TGA	3	9	281978	281986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843035
7594	NC_017062	AT	3	6	282044	282049	50 %	50 %	0 %	0 %	383843035
7595	NC_017062	GTT	2	6	282053	282058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843035
7596	NC_017062	A	8	8	282061	282068	100 %	0 %	0 %	0 %	383843035
7597	NC_017062	AG	3	6	282107	282112	50 %	0 %	50 %	0 %	383843035
7598	NC_017062	TTA	2	6	282115	282120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843035
7599	NC_017062	TGATAT	2	12	282125	282136	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	383843035
7600	NC_017062	AATAAA	2	12	282138	282149	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383843035
7601	NC_017062	ATCT	2	8	282163	282170	25 %	50 %	0 %	25 %	383843035
7602	NC_017062	TAT	2	6	282171	282176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843035
7603	NC_017062	AAC	2	6	282213	282218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383843035
7604	NC_017062	CTG	2	6	282295	282300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843035
7605	NC_017062	ATT	3	9	282316	282324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843035
7606	NC_017062	A	6	6	282368	282373	100 %	0 %	0 %	0 %	383843035
7607	NC_017062	TGT	2	6	282531	282536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7608	NC_017062	AAT	2	6	282558	282563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7609	NC_017062	TAA	2	6	282566	282571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7610	NC_017062	TAGTT	2	10	282606	282615	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
7611	NC_017062	TTAA	3	12	282624	282635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7612	NC_017062	AT	3	6	282642	282647	50 %	50 %	0 %	0 %	383843036
7613	NC_017062	TAA	3	9	282666	282674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843036
7614	NC_017062	AGAAA	2	10	282675	282684	80 %	0 %	20 %	0 %	383843036
7615	NC_017062	GTAT	2	8	282764	282771	25 %	50 %	25 %	0 %	383843036
7616	NC_017062	CAT	2	6	282799	282804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843036
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7618	NC_017062	ATC	2	6	282935	282940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843036
7619	NC_017062	TAA	2	6	282951	282956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843036
7620	NC_017062	ACT	2	6	282979	282984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843036
7621	NC_017062	TTCA	2	8	282986	282993	25 %	50 %	0 %	25 %	383843036
7622	NC_017062	GTA	2	6	282995	283000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843036
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7624	NC_017062	GTA	2	6	283057	283062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843036
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