MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_017062	TTA	2	6	260617	260622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843020
7003	NC_017062	ATA	2	6	260665	260670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843020
7004	NC_017062	GTTT	2	8	260676	260683	0 %	75 %	25 %	0 %	383843020
7005	NC_017062	TTA	2	6	260803	260808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843020
7006	NC_017062	A	7	7	260813	260819	100 %	0 %	0 %	0 %	383843020
7007	NC_017062	TAAA	2	8	260861	260868	75 %	25 %	0 %	0 %	383843020
7008	NC_017062	T	6	6	260874	260879	0 %	100 %	0 %	0 %	383843020
7009	NC_017062	ATG	2	6	260882	260887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843020
7010	NC_017062	TTA	2	6	260889	260894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843020
7011	NC_017062	CTT	2	6	260926	260931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843020
7012	NC_017062	TAA	2	6	260954	260959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843020
7013	NC_017062	ATGA	2	8	260982	260989	50 %	25 %	25 %	0 %	383843020
7014	NC_017062	ATC	2	6	261003	261008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843020
7015	NC_017062	TAT	2	6	261031	261036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_017062	GGTA	2	8	261054	261061	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_017062	TTAT	2	8	261100	261107	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_017062	TAC	2	6	261122	261127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_017062	T	6	6	261152	261157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_017062	ATC	2	6	261158	261163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7021	NC_017062	AAT	2	6	261164	261169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_017062	GTA	2	6	261199	261204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_017062	ATT	2	6	261214	261219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_017062	TCA	2	6	261220	261225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_017062	ACA	2	6	261240	261245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7026	NC_017062	TAT	2	6	261255	261260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_017062	AT	3	6	261259	261264	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_017062	AGT	2	6	261274	261279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_017062	TA	3	6	261286	261291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_017062	TTA	2	6	261367	261372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_017062	T	6	6	261383	261388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_017062	ATT	2	6	261406	261411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_017062	TAA	2	6	261427	261432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_017062	AT	3	6	261459	261464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_017062	ATTTTC	2	12	261516	261527	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7036	NC_017062	TAA	2	6	261563	261568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_017062	TTA	2	6	261569	261574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7038	NC_017062	A	6	6	261593	261598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_017062	AT	3	6	261613	261618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_017062	T	6	6	261691	261696	0 %	100 %	0 %	0 %	383843021
7041	NC_017062	TA	3	6	261712	261717	50 %	50 %	0 %	0 %	383843021
7042	NC_017062	GCAT	2	8	261720	261727	25 %	25 %	25 %	25 %	383843021
7043	NC_017062	AATA	2	8	261758	261765	75 %	25 %	0 %	0 %	383843021
7044	NC_017062	GAAAAT	2	12	261778	261789	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	383843021
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7047	NC_017062	AAT	2	6	261923	261928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843021
7048	NC_017062	TGTTT	2	10	261942	261951	0 %	80 %	20 %	0 %	383843021
7049	NC_017062	TGA	2	6	261955	261960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843021
7050	NC_017062	CAG	2	6	261964	261969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383843021
7051	NC_017062	A	6	6	262038	262043	100 %	0 %	0 %	0 %	383843021
7052	NC_017062	TGC	2	6	262142	262147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843021
7053	NC_017062	CTAT	2	8	262203	262210	25 %	50 %	0 %	25 %	383843021
7054	NC_017062	TG	3	6	262249	262254	0 %	50 %	50 %	0 %	383843021
7055	NC_017062	GT	3	6	262273	262278	0 %	50 %	50 %	0 %	383843021
7056	NC_017062	AAC	2	6	262309	262314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383843021
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7059	NC_017062	TG	3	6	262453	262458	0 %	50 %	50 %	0 %	383843021
7060	NC_017062	TCA	2	6	262473	262478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843021
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7064	NC_017062	TAA	2	6	262585	262590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843021
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7068	NC_017062	TAT	2	6	262637	262642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843021
7069	NC_017062	CGCT	2	8	262701	262708	0 %	25 %	25 %	50 %	383843021
7070	NC_017062	TTTA	2	8	262843	262850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_017062	TAA	2	6	262855	262860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7072	NC_017062	TAT	2	6	262867	262872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7073	NC_017062	TAA	2	6	262880	262885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7074	NC_017062	ATT	2	6	262949	262954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_017062	AGT	2	6	262985	262990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7076	NC_017062	TTAA	2	8	263015	263022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7077	NC_017062	TATG	2	8	263031	263038	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_017062	TAA	2	6	263046	263051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_017062	TAT	2	6	263167	263172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7080	NC_017062	AAT	2	6	263195	263200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_017062	A	6	6	263226	263231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7083	NC_017062	T	6	6	263311	263316	0 %	100 %	0 %	0 %	383843022
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7092	NC_017062	ATT	2	6	263574	263579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843022
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7098	NC_017062	TCT	2	6	263821	263826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843022
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7109	NC_017062	ATT	2	6	264226	264231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843022
7110	NC_017062	AG	3	6	264247	264252	50 %	0 %	50 %	0 %	383843022
7111	NC_017062	CAA	2	6	264401	264406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383843022
7112	NC_017062	ATAAA	2	10	264491	264500	80 %	20 %	0 %	0 %	383843022
7113	NC_017062	AAT	2	6	264552	264557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843022
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7120	NC_017062	AAT	2	6	264909	264914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843022
7121	NC_017062	AAATA	2	10	264918	264927	80 %	20 %	0 %	0 %	383843022
7122	NC_017062	TAATTT	2	12	264947	264958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843022
7123	NC_017062	A	6	6	264970	264975	100 %	0 %	0 %	0 %	383843022
7124	NC_017062	TGT	3	9	265059	265067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_017062	TTA	2	6	265072	265077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7127	NC_017062	ATA	2	6	265129	265134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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