MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia typhi str. B9991CWPP chromosome

Total Repeats: 30303

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017062	TGT	2	6	240544	240549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843008
6502	NC_017062	AAT	2	6	240593	240598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843008
6503	NC_017062	T	7	7	240610	240616	0 %	100 %	0 %	0 %	383843008
6504	NC_017062	A	6	6	240619	240624	100 %	0 %	0 %	0 %	383843008
6505	NC_017062	ATT	2	6	240629	240634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843008
6506	NC_017062	TTA	2	6	240702	240707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843008
6507	NC_017062	AAATAA	2	12	240757	240768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	383843008
6508	NC_017062	AAG	2	6	240829	240834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383843008
6509	NC_017062	AT	3	6	240910	240915	50 %	50 %	0 %	0 %	383843008
6510	NC_017062	TGA	2	6	240981	240986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843008
6511	NC_017062	TAT	2	6	241009	241014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843008
6512	NC_017062	ATC	2	6	241049	241054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843008
6513	NC_017062	TA	3	6	241066	241071	50 %	50 %	0 %	0 %	383843008
6514	NC_017062	TTA	2	6	241077	241082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843008
6515	NC_017062	ATT	2	6	241106	241111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843008
6516	NC_017062	TAA	2	6	241159	241164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843008
6517	NC_017062	AT	3	6	241204	241209	50 %	50 %	0 %	0 %	383843008
6518	NC_017062	ACTTT	2	10	241261	241270	20 %	60 %	0 %	20 %	383843008
6519	NC_017062	AT	3	6	241331	241336	50 %	50 %	0 %	0 %	383843008
6520	NC_017062	T	6	6	241359	241364	0 %	100 %	0 %	0 %	383843008
6521	NC_017062	T	6	6	241383	241388	0 %	100 %	0 %	0 %	383843008
6522	NC_017062	GAAG	2	8	241496	241503	50 %	0 %	50 %	0 %	383843009
6523	NC_017062	TCCA	2	8	241516	241523	25 %	25 %	0 %	50 %	383843009
6524	NC_017062	TTC	2	6	241525	241530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843009
6525	NC_017062	AAT	2	6	241537	241542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843009
6526	NC_017062	T	7	7	241615	241621	0 %	100 %	0 %	0 %	383843009
6527	NC_017062	TGT	2	6	241626	241631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843009
6528	NC_017062	TTC	3	9	241636	241644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843009
6529	NC_017062	CAAG	2	8	241667	241674	50 %	0 %	25 %	25 %	383843009
6530	NC_017062	T	6	6	241758	241763	0 %	100 %	0 %	0 %	383843009
6531	NC_017062	CTT	2	6	241764	241769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843009
6532	NC_017062	CAT	2	6	241770	241775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843009
6533	NC_017062	TAA	2	6	241779	241784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843009
6534	NC_017062	TA	3	6	241842	241847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_017062	ATT	2	6	241857	241862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_017062	ATTAAT	2	12	241889	241900	50 %	50 %	0 %	0 %	383843010
6537	NC_017062	AT	3	6	241915	241920	50 %	50 %	0 %	0 %	383843010
6538	NC_017062	T	6	6	241920	241925	0 %	100 %	0 %	0 %	383843010
6539	NC_017062	TTAA	2	8	241956	241963	50 %	50 %	0 %	0 %	383843010
6540	NC_017062	TAT	2	6	241996	242001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843010
6541	NC_017062	ATTA	2	8	242012	242019	50 %	50 %	0 %	0 %	383843010
6542	NC_017062	GTT	2	6	242046	242051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843010
6543	NC_017062	TAT	2	6	242057	242062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843010
6544	NC_017062	ATT	2	6	242100	242105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843010
6545	NC_017062	TCT	2	6	242106	242111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383843010
6546	NC_017062	TAA	2	6	242114	242119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843010
6547	NC_017062	TAG	2	6	242122	242127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843010
6548	NC_017062	AATCTC	2	12	242168	242179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843010
6549	NC_017062	AT	3	6	242224	242229	50 %	50 %	0 %	0 %	383843010
6550	NC_017062	T	6	6	242236	242241	0 %	100 %	0 %	0 %	383843010
6551	NC_017062	ATA	2	6	242257	242262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843010
6552	NC_017062	GGT	2	6	242319	242324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383843010
6553	NC_017062	AT	3	6	242389	242394	50 %	50 %	0 %	0 %	383843010
6554	NC_017062	TTA	2	6	242440	242445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843010
6555	NC_017062	T	6	6	242479	242484	0 %	100 %	0 %	0 %	383843010
6556	NC_017062	TAC	2	6	242525	242530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843010
6557	NC_017062	ATCA	2	8	242531	242538	50 %	25 %	0 %	25 %	383843010
6558	NC_017062	ATTT	2	8	242630	242637	25 %	75 %	0 %	0 %	383843010
6559	NC_017062	TA	3	6	242647	242652	50 %	50 %	0 %	0 %	383843010
6560	NC_017062	GTC	2	6	242679	242684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843010
6561	NC_017062	CTA	2	6	242689	242694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843010
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6563	NC_017062	GTT	2	6	242782	242787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843010
6564	NC_017062	TTA	2	6	242799	242804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843010
6565	NC_017062	ATA	2	6	242811	242816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843010
6566	NC_017062	ATT	2	6	242819	242824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843010
6567	NC_017062	CT	3	6	242829	242834	0 %	50 %	0 %	50 %	383843010
6568	NC_017062	T	7	7	242858	242864	0 %	100 %	0 %	0 %	383843010
6569	NC_017062	TTA	2	6	242904	242909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843010
6570	NC_017062	TAC	2	6	242927	242932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843010
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6578	NC_017062	T	6	6	243243	243248	0 %	100 %	0 %	0 %	383843010
6579	NC_017062	TAAA	2	8	243252	243259	75 %	25 %	0 %	0 %	383843010
6580	NC_017062	CTG	2	6	243265	243270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843010
6581	NC_017062	TTA	2	6	243294	243299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843010
6582	NC_017062	ACT	2	6	243320	243325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383843010
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6589	NC_017062	TAG	2	6	243523	243528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843010
6590	NC_017062	TAG	2	6	243547	243552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843010
6591	NC_017062	CTG	2	6	243587	243592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843010
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6594	NC_017062	T	6	6	243642	243647	0 %	100 %	0 %	0 %	383843011
6595	NC_017062	AT	3	6	243674	243679	50 %	50 %	0 %	0 %	383843011
6596	NC_017062	TG	3	6	243691	243696	0 %	50 %	50 %	0 %	383843011
6597	NC_017062	TGT	2	6	243755	243760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383843011
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6599	NC_017062	TAAA	2	8	243801	243808	75 %	25 %	0 %	0 %	383843011
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6603	NC_017062	TTTA	2	8	243961	243968	25 %	75 %	0 %	0 %	383843011
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6607	NC_017062	AAT	2	6	244113	244118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383843011
6608	NC_017062	TAT	2	6	244138	244143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_017062	TTA	2	6	244152	244157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6610	NC_017062	TGCAA	2	10	244175	244184	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6611	NC_017062	ACT	2	6	244267	244272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_017062	ATT	2	6	244294	244299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6613	NC_017062	AG	3	6	244502	244507	50 %	0 %	50 %	0 %	383843012
6614	NC_017062	TAT	2	6	244554	244559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843012
6615	NC_017062	TGA	2	6	244575	244580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383843012
6616	NC_017062	AT	3	6	244586	244591	50 %	50 %	0 %	0 %	383843012
6617	NC_017062	A	6	6	244603	244608	100 %	0 %	0 %	0 %	383843012
6618	NC_017062	TTA	2	6	244694	244699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383843012
6619	NC_017062	TAAT	2	8	244703	244710	50 %	50 %	0 %	0 %	383843012
6620	NC_017062	TGC	2	6	244734	244739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383843012
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6623	NC_017062	T	7	7	245075	245081	0 %	100 %	0 %	0 %	383843013
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