MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017060	AAT	2	6	96	101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017060	CG	3	6	119	124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017060	ATC	2	6	148	153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017060	CCG	2	6	182	187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_017060	TGG	2	6	227	232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527588
6	NC_017060	CGC	2	6	269	274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527588
7	NC_017060	GCC	2	6	276	281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527588
8	NC_017060	GCG	2	6	335	340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
9	NC_017060	CTGG	2	8	342	349	0 %	25 %	50 %	25 %	384527588
10	NC_017060	CAGC	2	8	417	424	25 %	0 %	25 %	50 %	384527588
11	NC_017060	AGC	3	9	422	430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527588
12	NC_017060	TTC	2	6	484	489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527588
13	NC_017060	GT	3	6	656	661	0 %	50 %	50 %	0 %	384527588
14	NC_017060	TGC	2	6	734	739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527588
15	NC_017060	GTG	2	6	775	780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527588
16	NC_017060	GC	3	6	799	804	0 %	0 %	50 %	50 %	384527588
17	NC_017060	GTG	2	6	832	837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527588
18	NC_017060	TGA	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527588
19	NC_017060	GGC	2	6	962	967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
20	NC_017060	CGG	2	6	1049	1054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
21	NC_017060	CAA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527588
22	NC_017060	GGC	2	6	1206	1211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
23	NC_017060	TGG	2	6	1234	1239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527588
24	NC_017060	CA	3	6	1257	1262	50 %	0 %	0 %	50 %	384527588
25	NC_017060	GCG	3	9	1337	1345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527588
26	NC_017060	GAA	2	6	1356	1361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527588
27	NC_017060	ATGA	2	8	1372	1379	50 %	25 %	25 %	0 %	384527588
28	NC_017060	T	6	6	1527	1532	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017060	AGT	2	6	1625	1630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527589
30	NC_017060	GTT	2	6	1647	1652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527589
31	NC_017060	CCA	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527589
32	NC_017060	TGC	2	6	1718	1723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
33	NC_017060	CCG	3	9	1795	1803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527589
34	NC_017060	CAT	2	6	1818	1823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527589
35	NC_017060	TGC	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
36	NC_017060	GAC	2	6	2099	2104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527589
37	NC_017060	TCCA	2	8	2107	2114	25 %	25 %	0 %	50 %	384527589
38	NC_017060	GGT	2	6	2148	2153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527589
39	NC_017060	CCG	2	6	2257	2262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527589
40	NC_017060	TGT	2	6	2273	2278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527589
41	NC_017060	TGC	2	6	2288	2293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
42	NC_017060	GCT	2	6	2295	2300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
43	NC_017060	GA	3	6	2493	2498	50 %	0 %	50 %	0 %	384527589
44	NC_017060	GGC	2	6	2528	2533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
45	NC_017060	GCCA	2	8	2544	2551	25 %	0 %	25 %	50 %	384527589
46	NC_017060	CGT	2	6	2664	2669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
47	NC_017060	TG	3	6	2725	2730	0 %	50 %	50 %	0 %	384527589
48	NC_017060	CGG	2	6	2819	2824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
49	NC_017060	TGCG	2	8	2848	2855	0 %	25 %	50 %	25 %	384527589
50	NC_017060	GCC	2	6	2883	2888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527589
51	NC_017060	GGT	2	6	2940	2945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527589
52	NC_017060	CCA	2	6	2966	2971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527589
53	NC_017060	AGA	2	6	2978	2983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527589
54	NC_017060	T	6	6	2985	2990	0 %	100 %	0 %	0 %	384527589
55	NC_017060	CCAG	2	8	3008	3015	25 %	0 %	25 %	50 %	384527589
56	NC_017060	TCCTGA	2	12	3019	3030	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384527589
57	NC_017060	TGTT	2	8	3103	3110	0 %	75 %	25 %	0 %	384527589
58	NC_017060	GGC	2	6	3186	3191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
59	NC_017060	GCCC	2	8	3198	3205	0 %	0 %	25 %	75 %	384527589
60	NC_017060	TCA	2	6	3209	3214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527589
61	NC_017060	CAC	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527589
62	NC_017060	CGG	2	6	3266	3271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
63	NC_017060	GACG	2	8	3297	3304	25 %	0 %	50 %	25 %	384527589
64	NC_017060	GTC	2	6	3312	3317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
65	NC_017060	ATT	2	6	3327	3332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527589
66	NC_017060	GGT	2	6	3396	3401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527589
67	NC_017060	CG	3	6	3485	3490	0 %	0 %	50 %	50 %	384527589
68	NC_017060	GTG	2	6	3517	3522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527589
69	NC_017060	GCG	2	6	3556	3561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
70	NC_017060	CTG	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
71	NC_017060	GCG	2	6	3604	3609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527589
72	NC_017060	GTC	2	6	3625	3630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
73	NC_017060	CGCCAG	2	12	3678	3689	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384527589
74	NC_017060	CTG	2	6	3729	3734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527589
75	NC_017060	T	7	7	3783	3789	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017060	TATT	2	8	3807	3814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017060	ATT	2	6	3855	3860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017060	TAA	2	6	3893	3898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017060	A	6	6	3917	3922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017060	GAA	2	6	3947	3952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017060	ATG	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017060	CAG	2	6	4015	4020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527590
83	NC_017060	CGTC	2	8	4089	4096	0 %	25 %	25 %	50 %	384527590
84	NC_017060	T	6	6	4102	4107	0 %	100 %	0 %	0 %	384527590
85	NC_017060	TGC	3	9	4197	4205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527590
86	NC_017060	AAT	2	6	4228	4233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527590
87	NC_017060	ACA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527590
88	NC_017060	CTC	2	6	4303	4308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527590
89	NC_017060	CAA	2	6	4371	4376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527590
90	NC_017060	CGC	2	6	4389	4394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
91	NC_017060	TAC	2	6	4429	4434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527590
92	NC_017060	CCG	2	6	4500	4505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
93	NC_017060	CGC	2	6	4516	4521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
94	NC_017060	CCT	2	6	4535	4540	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527590
95	NC_017060	GGT	2	6	4549	4554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527590
96	NC_017060	CCG	2	6	4795	4800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
97	NC_017060	GGT	2	6	4906	4911	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527590
98	NC_017060	TGC	2	6	4964	4969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527590
99	NC_017060	TGA	2	6	5012	5017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527590
100	NC_017060	GCAG	2	8	5058	5065	25 %	0 %	50 %	25 %	384527590
101	NC_017060	GC	3	6	5077	5082	0 %	0 %	50 %	50 %	384527590
102	NC_017060	CATAA	2	10	5113	5122	60 %	20 %	0 %	20 %	384527590
103	NC_017060	CG	3	6	5137	5142	0 %	0 %	50 %	50 %	384527590
104	NC_017060	CAC	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527590
105	NC_017060	CTT	2	6	5157	5162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527590
106	NC_017060	GCC	2	6	5200	5205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527590
107	NC_017060	ATA	2	6	5301	5306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527590
108	NC_017060	G	6	6	5400	5405	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017060	CTG	2	6	5484	5489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017060	TGC	2	6	5491	5496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017060	TAA	2	6	5507	5512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017060	TCAG	2	8	5546	5553	25 %	25 %	25 %	25 %	384527591
113	NC_017060	G	6	6	5639	5644	0 %	0 %	100 %	0 %	384527591
114	NC_017060	ACG	2	6	5693	5698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527591
115	NC_017060	CAT	2	6	5733	5738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527591
116	NC_017060	GCGGT	2	10	5747	5756	0 %	20 %	60 %	20 %	384527591
117	NC_017060	ATGC	2	8	5827	5834	25 %	25 %	25 %	25 %	384527591
118	NC_017060	TGAT	2	8	5837	5844	25 %	50 %	25 %	0 %	384527591
119	NC_017060	CAA	2	6	5892	5897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527591
120	NC_017060	CCA	2	6	5952	5957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527591
121	NC_017060	CCG	2	6	5980	5985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527591
122	NC_017060	CTG	2	6	6005	6010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527591
123	NC_017060	GCA	2	6	6044	6049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527591
124	NC_017060	G	6	6	6081	6086	0 %	0 %	100 %	0 %	384527591
125	NC_017060	AAG	2	6	6116	6121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527591
126	NC_017060	G	6	6	6159	6164	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017060	ACGC	2	8	6181	6188	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017060	TC	3	6	6192	6197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017060	T	6	6	6224	6229	0 %	100 %	0 %	0 %	384527592
130	NC_017060	GCA	2	6	6264	6269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527592
131	NC_017060	CAG	2	6	6277	6282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527592
132	NC_017060	CTT	2	6	6301	6306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527592
133	NC_017060	CTGCTT	2	12	6307	6318	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384527592
134	NC_017060	CTG	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527592
135	NC_017060	GCG	2	6	6333	6338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527592
136	NC_017060	CTT	2	6	6523	6528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527592
137	NC_017060	CAA	2	6	6571	6576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527592
138	NC_017060	TA	3	6	6618	6623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017060	AAT	2	6	6633	6638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017060	CAT	2	6	6651	6656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017060	GCG	2	6	6676	6681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017060	GC	3	6	6929	6934	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017060	GTT	2	6	6962	6967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017060	CGA	2	6	6968	6973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017060	GAA	2	6	7045	7050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017060	TG	3	6	7185	7190	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017060	TG	3	6	7247	7252	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017060	AC	3	6	7335	7340	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017060	TCA	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017060	TA	3	6	7525	7530	50 %	50 %	0 %	0 %	384527593
151	NC_017060	CGG	2	6	7665	7670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527593
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172	NC_017060	TA	3	6	8402	8407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017060	TCATT	2	10	8434	8443	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_017060	CGC	2	6	8837	8842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527594
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194	NC_017060	TGA	2	6	9516	9521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_017060	CAC	2	6	12827	12832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527598
268	NC_017060	GAC	2	6	12858	12863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527598
269	NC_017060	TCA	3	9	12954	12962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527598
270	NC_017060	T	6	6	13023	13028	0 %	100 %	0 %	0 %	384527598
271	NC_017060	CCG	2	6	13031	13036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527598
272	NC_017060	GCA	2	6	13042	13047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527598
273	NC_017060	CGG	2	6	13070	13075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527598
274	NC_017060	GGC	2	6	13173	13178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527598
275	NC_017060	ATC	2	6	13188	13193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527598
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277	NC_017060	GCTC	2	8	13249	13256	0 %	25 %	25 %	50 %	384527598
278	NC_017060	GCA	2	6	13336	13341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
279	NC_017060	GTT	2	6	13373	13378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527599
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281	NC_017060	GCA	2	6	13453	13458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527599
282	NC_017060	CAT	2	6	13463	13468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527599
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373	NC_017060	CAG	2	6	17925	17930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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391	NC_017060	T	6	6	18364	18369	0 %	100 %	0 %	0 %	384527603
392	NC_017060	GCA	3	9	18435	18443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527603
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394	NC_017060	CAG	2	6	18610	18615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527603
395	NC_017060	ATA	2	6	18617	18622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527603
396	NC_017060	CGCAG	2	10	18683	18692	20 %	0 %	40 %	40 %	384527603
397	NC_017060	CGT	2	6	18696	18701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527603
398	NC_017060	GCG	2	6	18774	18779	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527603
399	NC_017060	TTC	2	6	18802	18807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527603
400	NC_017060	CAT	2	6	18828	18833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527603
401	NC_017060	GACC	2	8	18879	18886	25 %	0 %	25 %	50 %	384527603
402	NC_017060	CGG	2	6	18991	18996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527603
403	NC_017060	AAGG	2	8	19000	19007	50 %	0 %	50 %	0 %	384527603
404	NC_017060	TGA	2	6	19020	19025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527603
405	NC_017060	T	6	6	19057	19062	0 %	100 %	0 %	0 %	384527603
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407	NC_017060	ACG	2	6	19153	19158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527603
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409	NC_017060	TTC	2	6	19219	19224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527603
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414	NC_017060	TGA	2	6	19409	19414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527603
415	NC_017060	GCA	2	6	19437	19442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527603
416	NC_017060	GCA	2	6	19638	19643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527603
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426	NC_017060	CA	3	6	20148	20153	50 %	0 %	0 %	50 %	384527603
427	NC_017060	CTGC	2	8	20161	20168	0 %	25 %	25 %	50 %	384527603
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434	NC_017060	ATAA	2	8	20389	20396	75 %	25 %	0 %	0 %	384527603
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441	NC_017060	TTTC	3	12	20593	20604	0 %	75 %	0 %	25 %	384527603
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450	NC_017060	GAA	2	6	20865	20870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
451	NC_017060	ATA	2	6	20885	20890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_017060	TCAG	2	8	20912	20919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
453	NC_017060	CAGCG	2	10	20929	20938	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
454	NC_017060	TTC	2	6	20982	20987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527604
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464	NC_017060	TAA	2	6	21385	21390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_017060	TAT	2	6	21431	21436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_017060	TAA	2	6	22282	22287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
480	NC_017060	CGC	2	6	22288	22293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
481	NC_017060	CCG	2	6	22329	22334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527606
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