MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_017060	TAC	2	6	566150	566155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528102
11502	NC_017060	TGC	2	6	566287	566292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528102
11503	NC_017060	AATG	2	8	566316	566323	50 %	25 %	25 %	0 %	384528102
11504	NC_017060	CTG	2	6	566358	566363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528102
11505	NC_017060	ATA	2	6	566380	566385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528102
11506	NC_017060	TGAA	2	8	566422	566429	50 %	25 %	25 %	0 %	384528102
11507	NC_017060	TGA	2	6	566486	566491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528102
11508	NC_017060	CAA	2	6	566538	566543	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528102
11509	NC_017060	ACTG	2	8	566555	566562	25 %	25 %	25 %	25 %	384528102
11510	NC_017060	GAT	2	6	566615	566620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528102
11511	NC_017060	GTT	2	6	566802	566807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11512	NC_017060	T	6	6	566835	566840	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_017060	ATA	2	6	566967	566972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_017060	GCC	2	6	567005	567010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11515	NC_017060	TAA	2	6	567073	567078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528103
11516	NC_017060	CTT	2	6	567094	567099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528103
11517	NC_017060	TTC	2	6	567128	567133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528103
11518	NC_017060	GGC	2	6	567193	567198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528103
11519	NC_017060	ACG	2	6	567207	567212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528103
11520	NC_017060	TCG	2	6	567249	567254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528103
11521	NC_017060	GCTG	2	8	567263	567270	0 %	25 %	50 %	25 %	384528103
11522	NC_017060	GGC	2	6	567280	567285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528103
11523	NC_017060	GGCT	2	8	567296	567303	0 %	25 %	50 %	25 %	384528103
11524	NC_017060	GCA	2	6	567322	567327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528103
11525	NC_017060	TGG	2	6	567474	567479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528103
11526	NC_017060	A	6	6	567491	567496	100 %	0 %	0 %	0 %	384528103
11527	NC_017060	CGT	2	6	567506	567511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528103
11528	NC_017060	CGC	2	6	567564	567569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528103
11529	NC_017060	GGCT	2	8	567578	567585	0 %	25 %	50 %	25 %	384528103
11530	NC_017060	TGGC	2	8	567598	567605	0 %	25 %	50 %	25 %	384528103
11531	NC_017060	G	6	6	567623	567628	0 %	0 %	100 %	0 %	384528103
11532	NC_017060	TGG	2	6	567639	567644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528103
11533	NC_017060	GCT	2	6	567760	567765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528103
11534	NC_017060	GCC	2	6	567773	567778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528103
11535	NC_017060	ATC	2	6	567788	567793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528103
11536	NC_017060	GCG	2	6	567866	567871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528103
11537	NC_017060	TATC	2	8	567889	567896	25 %	50 %	0 %	25 %	384528103
11538	NC_017060	GC	3	6	567928	567933	0 %	0 %	50 %	50 %	384528103
11539	NC_017060	CTG	2	6	567938	567943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528103
11540	NC_017060	GCT	2	6	567968	567973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528103
11541	NC_017060	TTC	2	6	567974	567979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528103
11542	NC_017060	GTT	2	6	568093	568098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528103
11543	NC_017060	ATC	2	6	568100	568105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528103
11544	NC_017060	CTG	2	6	568106	568111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528103
11545	NC_017060	AGC	2	6	568166	568171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528103
11546	NC_017060	TCA	2	6	568182	568187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528103
11547	NC_017060	GCG	3	9	568202	568210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528103
11548	NC_017060	ATG	3	9	568223	568231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528103
11549	NC_017060	GCG	2	6	568254	568259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528103
11550	NC_017060	TGG	2	6	568284	568289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528103
11551	NC_017060	GCA	2	6	568290	568295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528103
11552	NC_017060	GCT	2	6	568354	568359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528103
11553	NC_017060	GAT	2	6	568384	568389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528103
11554	NC_017060	GGC	2	6	568426	568431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528103
11555	NC_017060	TGC	2	6	568473	568478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528103
11556	NC_017060	GTT	2	6	568494	568499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528103
11557	NC_017060	CTGCG	2	10	568516	568525	0 %	20 %	40 %	40 %	384528103
11558	NC_017060	TGA	2	6	568663	568668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11559	NC_017060	T	8	8	568678	568685	0 %	100 %	0 %	0 %	384528104
11560	NC_017060	TCA	2	6	568712	568717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528104
11561	NC_017060	CCT	2	6	568782	568787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528104
11562	NC_017060	GGC	2	6	568794	568799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528104
11563	NC_017060	GCG	2	6	568815	568820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528104
11564	NC_017060	ACC	2	6	568826	568831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528104
11565	NC_017060	TCG	2	6	568880	568885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528104
11566	NC_017060	TTC	2	6	568987	568992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528104
11567	NC_017060	TCA	2	6	569112	569117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528104
11568	NC_017060	ACCC	2	8	569239	569246	25 %	0 %	0 %	75 %	384528105
11569	NC_017060	TTC	2	6	569276	569281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528105
11570	NC_017060	ACA	2	6	569286	569291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528105
11571	NC_017060	ATC	2	6	569372	569377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528105
11572	NC_017060	TGC	2	6	569403	569408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528105
11573	NC_017060	ATG	2	6	569453	569458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528105
11574	NC_017060	AG	3	6	569461	569466	50 %	0 %	50 %	0 %	384528105
11575	NC_017060	GCGT	2	8	569546	569553	0 %	25 %	50 %	25 %	384528105
11576	NC_017060	ACC	2	6	569579	569584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528105
11577	NC_017060	ATAC	2	8	569587	569594	50 %	25 %	0 %	25 %	384528105
11578	NC_017060	GC	3	6	569622	569627	0 %	0 %	50 %	50 %	384528105
11579	NC_017060	GCA	2	6	569631	569636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528105
11580	NC_017060	ATG	2	6	569651	569656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528105
11581	NC_017060	ATA	2	6	569672	569677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528105
11582	NC_017060	GCG	2	6	569699	569704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528105
11583	NC_017060	CAG	2	6	569752	569757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528105
11584	NC_017060	CCAG	2	8	569769	569776	25 %	0 %	25 %	50 %	384528105
11585	NC_017060	CAG	2	6	569811	569816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528105
11586	NC_017060	CAG	2	6	569824	569829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528105
11587	NC_017060	CGG	2	6	569845	569850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528105
11588	NC_017060	GCA	2	6	569874	569879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528105
11589	NC_017060	GACG	2	8	569923	569930	25 %	0 %	50 %	25 %	384528105
11590	NC_017060	GAA	2	6	569953	569958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528105
11591	NC_017060	CGC	2	6	570054	570059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528105
11592	NC_017060	CAG	2	6	570076	570081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528105
11593	NC_017060	CAT	2	6	570120	570125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528105
11594	NC_017060	AAT	2	6	570160	570165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528105
11595	NC_017060	GCC	2	6	570218	570223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528105
11596	NC_017060	GAA	2	6	570229	570234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528105
11597	NC_017060	CAG	3	9	570247	570255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528105
11598	NC_017060	TGATAA	2	12	570258	570269	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384528105
11599	NC_017060	A	7	7	570431	570437	100 %	0 %	0 %	0 %	384528105
11600	NC_017060	TTA	2	6	570520	570525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528106
11601	NC_017060	GCG	2	6	570534	570539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528106
11602	NC_017060	CGC	2	6	570579	570584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528106
11603	NC_017060	CGG	2	6	570637	570642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528106
11604	NC_017060	CCG	2	6	570704	570709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528106
11605	NC_017060	CGCAAA	2	12	570725	570736	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384528106
11606	NC_017060	TCG	2	6	570781	570786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528106
11607	NC_017060	TAA	2	6	570841	570846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_017060	AT	3	6	570862	570867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

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