MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_017060	GCC	2	6	519952	519957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528061
10502	NC_017060	GCC	2	6	519962	519967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528061
10503	NC_017060	CAG	2	6	519971	519976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528061
10504	NC_017060	CAG	2	6	519980	519985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528061
10505	NC_017060	AGAA	2	8	520072	520079	75 %	0 %	25 %	0 %	384528061
10506	NC_017060	CA	3	6	520096	520101	50 %	0 %	0 %	50 %	384528061
10507	NC_017060	ATT	2	6	520149	520154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528061
10508	NC_017060	CTC	2	6	520236	520241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528061
10509	NC_017060	TGAG	2	8	520248	520255	25 %	25 %	50 %	0 %	384528061
10510	NC_017060	CTG	2	6	520271	520276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528061
10511	NC_017060	GCT	2	6	520367	520372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528061
10512	NC_017060	GCG	2	6	520397	520402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528061
10513	NC_017060	AAAT	2	8	520482	520489	75 %	25 %	0 %	0 %	384528061
10514	NC_017060	GGC	2	6	520552	520557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528061
10515	NC_017060	AAC	2	6	520581	520586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528061
10516	NC_017060	TGC	2	6	520599	520604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528061
10517	NC_017060	ATC	2	6	520626	520631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528061
10518	NC_017060	TGCT	2	8	520725	520732	0 %	50 %	25 %	25 %	384528061
10519	NC_017060	TGA	2	6	520744	520749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528061
10520	NC_017060	AT	3	6	520792	520797	50 %	50 %	0 %	0 %	384528061
10521	NC_017060	TCAG	2	8	520887	520894	25 %	25 %	25 %	25 %	384528061
10522	NC_017060	ATT	2	6	520927	520932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528061
10523	NC_017060	TATT	2	8	520982	520989	25 %	75 %	0 %	0 %	384528061
10524	NC_017060	GAA	2	6	521004	521009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528061
10525	NC_017060	TTA	2	6	521011	521016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10526	NC_017060	A	6	6	521053	521058	100 %	0 %	0 %	0 %	384528062
10527	NC_017060	GAA	2	6	521097	521102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528062
10528	NC_017060	A	7	7	521119	521125	100 %	0 %	0 %	0 %	384528062
10529	NC_017060	CTG	2	6	521131	521136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528062
10530	NC_017060	ATT	2	6	521215	521220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528062
10531	NC_017060	TTCA	2	8	521226	521233	25 %	50 %	0 %	25 %	384528062
10532	NC_017060	ATT	2	6	521301	521306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528062
10533	NC_017060	ATGGT	2	10	521402	521411	20 %	40 %	40 %	0 %	384528062
10534	NC_017060	AGAA	2	8	521462	521469	75 %	0 %	25 %	0 %	384528062
10535	NC_017060	GGT	2	6	521482	521487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528062
10536	NC_017060	GTC	2	6	521564	521569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528062
10537	NC_017060	AGTT	2	8	521696	521703	25 %	50 %	25 %	0 %	384528062
10538	NC_017060	A	6	6	521713	521718	100 %	0 %	0 %	0 %	384528062
10539	NC_017060	AAT	2	6	521856	521861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_017060	GAC	2	6	521916	521921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10541	NC_017060	ATC	2	6	521973	521978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528063
10542	NC_017060	GCT	2	6	521979	521984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528063
10543	NC_017060	GC	3	6	522095	522100	0 %	0 %	50 %	50 %	384528063
10544	NC_017060	ACG	2	6	522185	522190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528063
10545	NC_017060	GGC	2	6	522196	522201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528063
10546	NC_017060	CGG	2	6	522279	522284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528063
10547	NC_017060	CTT	2	6	522288	522293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528063
10548	NC_017060	GCT	2	6	522411	522416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528063
10549	NC_017060	T	6	6	522418	522423	0 %	100 %	0 %	0 %	384528063
10550	NC_017060	AGA	2	6	522428	522433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528063
10551	NC_017060	TGG	2	6	522473	522478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528063
10552	NC_017060	GC	3	6	522497	522502	0 %	0 %	50 %	50 %	384528063
10553	NC_017060	CGG	2	6	522510	522515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528063
10554	NC_017060	TGG	2	6	522614	522619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528063
10555	NC_017060	TGA	2	6	522722	522727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528063
10556	NC_017060	ATT	2	6	522728	522733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528063
10557	NC_017060	GTT	2	6	522747	522752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528063
10558	NC_017060	CAGC	2	8	522756	522763	25 %	0 %	25 %	50 %	384528063
10559	NC_017060	CTG	2	6	522790	522795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528063
10560	NC_017060	GCT	2	6	522819	522824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528063
10561	NC_017060	TC	3	6	522881	522886	0 %	50 %	0 %	50 %	384528063
10562	NC_017060	GCC	2	6	522918	522923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528063
10563	NC_017060	ATT	2	6	522931	522936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528063
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10565	NC_017060	GCT	2	6	522987	522992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528063
10566	NC_017060	TGA	2	6	523109	523114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528063
10567	NC_017060	GCTGG	2	10	523136	523145	0 %	20 %	60 %	20 %	384528063
10568	NC_017060	TGAT	2	8	523172	523179	25 %	50 %	25 %	0 %	384528063
10569	NC_017060	GTT	2	6	523185	523190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528063
10570	NC_017060	GGC	2	6	523219	523224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528063
10571	NC_017060	TGC	2	6	523295	523300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528063
10572	NC_017060	GCC	2	6	523359	523364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528063
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10575	NC_017060	GTT	2	6	523425	523430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528063
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10579	NC_017060	ATGA	2	8	523645	523652	50 %	25 %	25 %	0 %	384528063
10580	NC_017060	T	6	6	523660	523665	0 %	100 %	0 %	0 %	384528063
10581	NC_017060	CG	3	6	523670	523675	0 %	0 %	50 %	50 %	384528063
10582	NC_017060	TGCG	2	8	523757	523764	0 %	25 %	50 %	25 %	384528063
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10586	NC_017060	CGG	2	6	523863	523868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10587	NC_017060	GCGGA	2	10	523887	523896	20 %	0 %	60 %	20 %	384528064
10588	NC_017060	GCT	2	6	523922	523927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528064
10589	NC_017060	GTTTGC	2	12	524024	524035	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384528064
10590	NC_017060	CG	3	6	524325	524330	0 %	0 %	50 %	50 %	384528064
10591	NC_017060	CAA	2	6	524367	524372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528064
10592	NC_017060	GCC	2	6	524386	524391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528064
10593	NC_017060	CGT	2	6	524490	524495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528064
10594	NC_017060	CGG	2	6	524562	524567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528064
10595	NC_017060	GCT	2	6	524603	524608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528064
10596	NC_017060	GA	3	6	524700	524705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10597	NC_017060	TTC	2	6	524749	524754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10598	NC_017060	TTTC	2	8	524767	524774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10599	NC_017060	GAA	2	6	524831	524836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528065
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10601	NC_017060	CCG	2	6	524994	524999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528065
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10604	NC_017060	TGG	2	6	525204	525209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528065
10605	NC_017060	CAT	2	6	525214	525219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528065
10606	NC_017060	CAC	2	6	525220	525225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528065
10607	NC_017060	CCA	2	6	525255	525260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528065
10608	NC_017060	CG	3	6	525261	525266	0 %	0 %	50 %	50 %	384528065
10609	NC_017060	GCC	2	6	525293	525298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528065
10610	NC_017060	GGCA	2	8	525337	525344	25 %	0 %	50 %	25 %	384528065
10611	NC_017060	CGC	2	6	525355	525360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528065
10612	NC_017060	CTC	2	6	525392	525397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528065
10613	NC_017060	GCTG	2	8	525409	525416	0 %	25 %	50 %	25 %	384528065
10614	NC_017060	CGG	2	6	525439	525444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384528065
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10859	NC_017060	GAT	2	6	537017	537022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10862	NC_017060	AGG	2	6	537211	537216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10863	NC_017060	AT	3	6	537238	537243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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