MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_017060	TGC	2	6	495420	495425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528040
10002	NC_017060	CAA	2	6	495446	495451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528040
10003	NC_017060	AGC	2	6	495471	495476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528040
10004	NC_017060	TCA	2	6	495525	495530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528040
10005	NC_017060	GAA	2	6	495569	495574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528040
10006	NC_017060	CCA	2	6	495610	495615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528040
10007	NC_017060	CGT	3	9	495619	495627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528040
10008	NC_017060	TCG	2	6	495667	495672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528040
10009	NC_017060	CTT	2	6	495787	495792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528040
10010	NC_017060	TGC	2	6	495814	495819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528040
10011	NC_017060	GCC	2	6	495914	495919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528040
10012	NC_017060	TCA	2	6	495924	495929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528040
10013	NC_017060	CGT	2	6	495930	495935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528040
10014	NC_017060	T	6	6	495986	495991	0 %	100 %	0 %	0 %	384528040
10015	NC_017060	GCA	2	6	496069	496074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528040
10016	NC_017060	GCCA	2	8	496121	496128	25 %	0 %	25 %	50 %	384528040
10017	NC_017060	ATTGC	2	10	496129	496138	20 %	40 %	20 %	20 %	384528040
10018	NC_017060	GC	3	6	496151	496156	0 %	0 %	50 %	50 %	384528040
10019	NC_017060	GT	3	6	496191	496196	0 %	50 %	50 %	0 %	384528040
10020	NC_017060	TG	3	6	496212	496217	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_017060	T	6	6	496472	496477	0 %	100 %	0 %	0 %	384528041
10022	NC_017060	A	6	6	496531	496536	100 %	0 %	0 %	0 %	384528041
10023	NC_017060	TCA	2	6	496541	496546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528041
10024	NC_017060	GGTGG	2	10	496629	496638	0 %	20 %	80 %	0 %	384528041
10025	NC_017060	TGT	2	6	496642	496647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528041
10026	NC_017060	CAT	2	6	496679	496684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528041
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10028	NC_017060	CAT	2	6	496750	496755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528042
10029	NC_017060	T	6	6	496767	496772	0 %	100 %	0 %	0 %	384528042
10030	NC_017060	ATA	2	6	496793	496798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528042
10031	NC_017060	GACT	2	8	496854	496861	25 %	25 %	25 %	25 %	384528042
10032	NC_017060	AT	3	6	496980	496985	50 %	50 %	0 %	0 %	384528042
10033	NC_017060	TGT	2	6	497044	497049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528042
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10036	NC_017060	TGTCG	2	10	497221	497230	0 %	40 %	40 %	20 %	384528042
10037	NC_017060	TAT	2	6	497484	497489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528042
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10039	NC_017060	T	8	8	497540	497547	0 %	100 %	0 %	0 %	384528042
10040	NC_017060	TAT	2	6	497560	497565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528042
10041	NC_017060	GCTG	2	8	497569	497576	0 %	25 %	50 %	25 %	384528042
10042	NC_017060	GT	3	6	497607	497612	0 %	50 %	50 %	0 %	384528042
10043	NC_017060	T	7	7	497692	497698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_017060	A	6	6	497708	497713	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_017060	TTA	2	6	497736	497741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_017060	GAT	2	6	497788	497793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_017060	T	7	7	497844	497850	0 %	100 %	0 %	0 %	384528043
10048	NC_017060	TC	3	6	497872	497877	0 %	50 %	0 %	50 %	384528043
10049	NC_017060	GCA	3	9	497935	497943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384528043
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10052	NC_017060	ATA	3	9	498127	498135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528043
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10054	NC_017060	TCT	2	6	498196	498201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384528043
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10056	NC_017060	GTT	2	6	498290	498295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384528043
10057	NC_017060	T	6	6	498346	498351	0 %	100 %	0 %	0 %	384528043
10058	NC_017060	ATGC	2	8	498462	498469	25 %	25 %	25 %	25 %	384528043
10059	NC_017060	GAT	2	6	498528	498533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528043
10060	NC_017060	CAT	2	6	498602	498607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528043
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10062	NC_017060	GTG	2	6	498631	498636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528043
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10064	NC_017060	ATG	2	6	498702	498707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528043
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10066	NC_017060	TGA	2	6	498775	498780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528043
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10069	NC_017060	TCA	2	6	498884	498889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10070	NC_017060	TA	4	8	498921	498928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10071	NC_017060	ATC	2	6	498938	498943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10072	NC_017060	AGTT	2	8	499018	499025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10073	NC_017060	GAG	2	6	499082	499087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10074	NC_017060	TAAT	2	8	499097	499104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10075	NC_017060	TG	3	6	499117	499122	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10076	NC_017060	ATCA	2	8	499132	499139	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10077	NC_017060	TGT	2	6	499154	499159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10090	NC_017060	GCGGGT	2	12	499926	499937	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384528044
10091	NC_017060	TATC	2	8	499940	499947	25 %	50 %	0 %	25 %	384528044
10092	NC_017060	GAA	2	6	499953	499958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528044
10093	NC_017060	TGG	2	6	500010	500015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528044
10094	NC_017060	TAC	2	6	500040	500045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528044
10095	NC_017060	A	6	6	500162	500167	100 %	0 %	0 %	0 %	384528044
10096	NC_017060	CAC	2	6	500242	500247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384528045
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10103	NC_017060	ATA	2	6	500567	500572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384528045
10104	NC_017060	CTGG	2	8	500575	500582	0 %	25 %	50 %	25 %	384528045
10105	NC_017060	AG	3	6	500681	500686	50 %	0 %	50 %	0 %	384528045
10106	NC_017060	TATT	2	8	500801	500808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10107	NC_017060	A	6	6	500832	500837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10108	NC_017060	TGA	2	6	500926	500931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10109	NC_017060	ATCA	2	8	500958	500965	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10110	NC_017060	CGC	2	6	501057	501062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10111	NC_017060	TGA	3	9	501073	501081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10112	NC_017060	AGGTAC	2	12	501082	501093	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10113	NC_017060	A	6	6	501171	501176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_017060	AAATG	2	10	501198	501207	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_017060	AAT	2	6	501212	501217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10116	NC_017060	A	6	6	501254	501259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10117	NC_017060	TTA	2	6	501272	501277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10118	NC_017060	AATCT	2	10	501288	501297	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10119	NC_017060	T	6	6	501310	501315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10120	NC_017060	AAT	2	6	501324	501329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10121	NC_017060	T	6	6	501353	501358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10122	NC_017060	A	7	7	501362	501368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_017060	TAT	2	6	501437	501442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10124	NC_017060	TC	3	6	501458	501463	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10234	NC_017060	ATC	2	6	507743	507748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528052
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10243	NC_017060	ATGC	2	8	508150	508157	25 %	25 %	25 %	25 %	384528052
10244	NC_017060	TGA	2	6	508170	508175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528052
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10273	NC_017060	TGA	3	9	509341	509349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528053
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10360	NC_017060	TTGT	2	8	513640	513647	0 %	75 %	25 %	0 %	384528059
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10481	NC_017060	ATT	2	6	519150	519155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384528060
10482	NC_017060	TGA	2	6	519184	519189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384528060
10483	NC_017060	GCC	2	6	519198	519203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384528060
10484	NC_017060	TCCG	2	8	519262	519269	0 %	25 %	25 %	50 %	384528060
10485	NC_017060	ATC	2	6	519333	519338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528060
10486	NC_017060	TCC	2	6	519393	519398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384528060
10487	NC_017060	GTG	2	6	519417	519422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384528060
10488	NC_017060	GC	3	6	519462	519467	0 %	0 %	50 %	50 %	384528060
10489	NC_017060	CTG	2	6	519495	519500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
10490	NC_017060	GACC	2	8	519509	519516	25 %	0 %	25 %	50 %	384528060
10491	NC_017060	CTG	2	6	519519	519524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528060
10492	NC_017060	AAAGC	2	10	519532	519541	60 %	0 %	20 %	20 %	384528060
10493	NC_017060	AAC	2	6	519622	519627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384528060
10494	NC_017060	GC	3	6	519676	519681	0 %	0 %	50 %	50 %	384528061
10495	NC_017060	GACTG	2	10	519774	519783	20 %	20 %	40 %	20 %	384528061
10496	NC_017060	GAA	2	6	519794	519799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384528061
10497	NC_017060	TCA	2	6	519861	519866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384528061
10498	NC_017060	GCTGGC	2	12	519892	519903	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384528061
10499	NC_017060	CAGC	2	8	519937	519944	25 %	0 %	25 %	50 %	384528061
10500	NC_017060	GCT	2	6	519945	519950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384528061

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