MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis HX2 plasmid PRA1

Total Repeats: 11608

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_017060	CAA	2	6	348601	348606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527909
7002	NC_017060	TGCC	2	8	348621	348628	0 %	25 %	25 %	50 %	384527909
7003	NC_017060	TAA	2	6	348629	348634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527909
7004	NC_017060	TCG	2	6	348924	348929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527909
7005	NC_017060	TCA	2	6	348937	348942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527909
7006	NC_017060	GCA	2	6	348946	348951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527909
7007	NC_017060	AAG	2	6	348968	348973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527909
7008	NC_017060	AGC	2	6	349052	349057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527909
7009	NC_017060	ACTT	2	8	349207	349214	25 %	50 %	0 %	25 %	384527909
7010	NC_017060	TCA	2	6	349353	349358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527909
7011	NC_017060	CAT	3	9	349370	349378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527909
7012	NC_017060	CTTAC	2	10	349467	349476	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7013	NC_017060	CAT	2	6	349509	349514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527910
7014	NC_017060	ATC	2	6	349613	349618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527910
7015	NC_017060	CAAA	2	8	349641	349648	75 %	0 %	0 %	25 %	384527910
7016	NC_017060	TAC	2	6	349739	349744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527910
7017	NC_017060	CAA	2	6	349782	349787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384527910
7018	NC_017060	TTC	2	6	349873	349878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384527910
7019	NC_017060	G	6	6	349912	349917	0 %	0 %	100 %	0 %	384527910
7020	NC_017060	AGG	2	6	349989	349994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527910
7021	NC_017060	GCG	2	6	350090	350095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527910
7022	NC_017060	ATG	2	6	350102	350107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527910
7023	NC_017060	TGGC	2	8	350234	350241	0 %	25 %	50 %	25 %	384527910
7024	NC_017060	ATG	2	6	350256	350261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527910
7025	NC_017060	AGG	2	6	350264	350269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_017060	GATC	2	8	350276	350283	25 %	25 %	25 %	25 %	384527911
7027	NC_017060	ATG	2	6	350383	350388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527911
7028	NC_017060	GCC	2	6	350390	350395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527911
7029	NC_017060	CACG	2	8	350477	350484	25 %	0 %	25 %	50 %	384527911
7030	NC_017060	AAAG	2	8	350505	350512	75 %	0 %	25 %	0 %	384527911
7031	NC_017060	TGA	2	6	350516	350521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527911
7032	NC_017060	GCA	2	6	350532	350537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527911
7033	NC_017060	TAT	2	6	350583	350588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527911
7034	NC_017060	TTA	2	6	350597	350602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527911
7035	NC_017060	GCA	2	6	350660	350665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527911
7036	NC_017060	TCA	2	6	350670	350675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527911
7037	NC_017060	GAT	2	6	350837	350842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527912
7038	NC_017060	ATT	2	6	350939	350944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527912
7039	NC_017060	GGCT	2	8	350991	350998	0 %	25 %	50 %	25 %	384527912
7040	NC_017060	TGGGA	2	10	351051	351060	20 %	20 %	60 %	0 %	384527912
7041	NC_017060	TGT	2	6	351061	351066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527912
7042	NC_017060	GA	3	6	351180	351185	50 %	0 %	50 %	0 %	384527912
7043	NC_017060	GAC	2	6	351226	351231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527912
7044	NC_017060	T	6	6	351254	351259	0 %	100 %	0 %	0 %	384527912
7045	NC_017060	CT	3	6	351293	351298	0 %	50 %	0 %	50 %	384527912
7046	NC_017060	ATGT	2	8	351350	351357	25 %	50 %	25 %	0 %	384527912
7047	NC_017060	GC	3	6	351427	351432	0 %	0 %	50 %	50 %	384527912
7048	NC_017060	GCC	2	6	351545	351550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527912
7049	NC_017060	AGCC	2	8	351572	351579	25 %	0 %	25 %	50 %	384527912
7050	NC_017060	GT	3	6	351666	351671	0 %	50 %	50 %	0 %	384527913
7051	NC_017060	CAGT	2	8	351695	351702	25 %	25 %	25 %	25 %	384527913
7052	NC_017060	GCC	2	6	351764	351769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527913
7053	NC_017060	CGA	2	6	351910	351915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527913
7054	NC_017060	GC	4	8	352002	352009	0 %	0 %	50 %	50 %	384527913
7055	NC_017060	CA	3	6	352060	352065	50 %	0 %	0 %	50 %	384527913
7056	NC_017060	GACA	2	8	352096	352103	50 %	0 %	25 %	25 %	384527913
7057	NC_017060	TCC	2	6	352151	352156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384527913
7058	NC_017060	A	6	6	352255	352260	100 %	0 %	0 %	0 %	384527913
7059	NC_017060	GCC	2	6	352392	352397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527914
7060	NC_017060	TTTGCA	2	12	352416	352427	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384527914
7061	NC_017060	TGG	2	6	352447	352452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527914
7062	NC_017060	TGA	2	6	352518	352523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527914
7063	NC_017060	TTG	2	6	352536	352541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_017060	GCAT	2	8	352667	352674	25 %	25 %	25 %	25 %	384527915
7065	NC_017060	CAT	2	6	352752	352757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527915
7066	NC_017060	TGA	2	6	352826	352831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527915
7067	NC_017060	CTGA	2	8	352914	352921	25 %	25 %	25 %	25 %	384527915
7068	NC_017060	TGT	2	6	352933	352938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527915
7069	NC_017060	GCAG	2	8	352947	352954	25 %	0 %	50 %	25 %	384527915
7070	NC_017060	GTA	2	6	352965	352970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527915
7071	NC_017060	AAG	2	6	353054	353059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527915
7072	NC_017060	CGC	2	6	353081	353086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527915
7073	NC_017060	CG	3	6	353104	353109	0 %	0 %	50 %	50 %	384527915
7074	NC_017060	TGC	2	6	353120	353125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527915
7075	NC_017060	ACCGA	2	10	353182	353191	40 %	0 %	20 %	40 %	384527915
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7077	NC_017060	TAA	3	9	353244	353252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_017060	GTT	2	6	353373	353378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7079	NC_017060	AAG	2	6	353432	353437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384527916
7080	NC_017060	ATT	2	6	353478	353483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527916
7081	NC_017060	CAG	3	9	353612	353620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527916
7082	NC_017060	G	6	6	353620	353625	0 %	0 %	100 %	0 %	384527916
7083	NC_017060	AG	4	8	354001	354008	50 %	0 %	50 %	0 %	384527917
7084	NC_017060	AG	3	6	354010	354015	50 %	0 %	50 %	0 %	384527917
7085	NC_017060	CAG	2	6	354037	354042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527917
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7087	NC_017060	AACA	2	8	354134	354141	75 %	0 %	0 %	25 %	384527917
7088	NC_017060	GTT	2	6	354169	354174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527917
7089	NC_017060	TTG	2	6	354216	354221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527917
7090	NC_017060	AATC	2	8	354244	354251	50 %	25 %	0 %	25 %	384527917
7091	NC_017060	CCA	2	6	354316	354321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7092	NC_017060	CGC	2	6	354403	354408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527918
7093	NC_017060	CGTT	2	8	354426	354433	0 %	50 %	25 %	25 %	384527918
7094	NC_017060	GA	3	6	354435	354440	50 %	0 %	50 %	0 %	384527918
7095	NC_017060	GGA	2	6	354549	354554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384527918
7096	NC_017060	CAATTT	2	12	354581	354592	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384527918
7097	NC_017060	TAA	2	6	354627	354632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527918
7098	NC_017060	CTG	2	6	354656	354661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527918
7099	NC_017060	GCA	2	6	354710	354715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384527918
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7102	NC_017060	AT	3	6	354862	354867	50 %	50 %	0 %	0 %	384527918
7103	NC_017060	CAGC	2	8	354959	354966	25 %	0 %	25 %	50 %	384527918
7104	NC_017060	GGC	2	6	354992	354997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527918
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7106	NC_017060	CT	3	6	355048	355053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7107	NC_017060	TAT	2	6	355069	355074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7108	NC_017060	ATT	2	6	355079	355084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384527919
7109	NC_017060	GGC	2	6	355118	355123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527919
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7111	NC_017060	ACGC	2	8	355240	355247	25 %	0 %	25 %	50 %	384527919
7112	NC_017060	GTT	2	6	355341	355346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384527919
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7118	NC_017060	GCC	2	6	355828	355833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384527919
7119	NC_017060	GC	3	6	355841	355846	0 %	0 %	50 %	50 %	384527919
7120	NC_017060	CAC	2	6	355917	355922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527919
7121	NC_017060	AAT	2	6	355944	355949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384527919
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7123	NC_017060	TGG	2	6	356036	356041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384527919
7124	NC_017060	ATC	2	6	356044	356049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527919
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7231	NC_017060	CCGCAT	2	12	361087	361098	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384527923
7232	NC_017060	TGCG	2	8	361106	361113	0 %	25 %	50 %	25 %	384527923
7233	NC_017060	GCT	2	6	361218	361223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527923
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7238	NC_017060	CTG	4	12	361551	361562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527924
7239	NC_017060	T	6	6	361566	361571	0 %	100 %	0 %	0 %	384527924
7240	NC_017060	CGGAC	2	10	361613	361622	20 %	0 %	40 %	40 %	384527924
7241	NC_017060	GCT	2	6	361736	361741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384527924
7242	NC_017060	CCA	2	6	361786	361791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384527924
7243	NC_017060	GGC	3	9	361853	361861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527924
7244	NC_017060	CAT	2	6	361895	361900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527924
7245	NC_017060	ATG	2	6	361941	361946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384527924
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7247	NC_017060	CGG	2	6	361982	361987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384527924
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7249	NC_017060	ATC	2	6	362199	362204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384527924
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7363	NC_017060	CTTC	2	8	367854	367861	0 %	50 %	0 %	50 %	384527929
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