MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_017058	TAT	2	6	1219067	1219072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502103
31502	NC_017058	ATT	2	6	1219093	1219098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502103
31503	NC_017058	AGA	2	6	1219200	1219205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383502103
31504	NC_017058	GCT	2	6	1219217	1219222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31505	NC_017058	TTTA	2	8	1219227	1219234	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31506	NC_017058	AT	4	8	1219277	1219284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31507	NC_017058	AT	3	6	1219296	1219301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31508	NC_017058	GTA	2	6	1219338	1219343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383502104
31509	NC_017058	CAA	2	6	1219393	1219398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383502104
31510	NC_017058	TAG	2	6	1219410	1219415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383502104
31511	NC_017058	TAT	2	6	1219430	1219435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502104
31512	NC_017058	AGC	2	6	1219474	1219479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383502104
31513	NC_017058	TAAA	2	8	1219488	1219495	75 %	25 %	0 %	0 %	383502104
31514	NC_017058	TA	4	8	1219532	1219539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31515	NC_017058	TTG	2	6	1219557	1219562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31516	NC_017058	AAT	2	6	1219643	1219648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31517	NC_017058	TAAT	2	8	1219656	1219663	50 %	50 %	0 %	0 %	383502105
31518	NC_017058	GCA	2	6	1219683	1219688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383502105
31519	NC_017058	AGAT	2	8	1219706	1219713	50 %	25 %	25 %	0 %	383502105
31520	NC_017058	TTAA	2	8	1219727	1219734	50 %	50 %	0 %	0 %	383502105
31521	NC_017058	CAT	2	6	1219846	1219851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502105
31522	NC_017058	ATT	2	6	1219865	1219870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502105
31523	NC_017058	TTAGC	2	10	1219881	1219890	20 %	40 %	20 %	20 %	383502105
31524	NC_017058	T	6	6	1219910	1219915	0 %	100 %	0 %	0 %	383502105
31525	NC_017058	CAT	2	6	1219954	1219959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502105
31526	NC_017058	CTA	2	6	1219994	1219999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502105
31527	NC_017058	TAT	2	6	1220028	1220033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502105
31528	NC_017058	T	6	6	1220107	1220112	0 %	100 %	0 %	0 %	383502105
31529	NC_017058	AAT	2	6	1220192	1220197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502105
31530	NC_017058	AG	3	6	1220237	1220242	50 %	0 %	50 %	0 %	383502105
31531	NC_017058	GCTT	2	8	1220267	1220274	0 %	50 %	25 %	25 %	383502105
31532	NC_017058	TTC	2	6	1220278	1220283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502105
31533	NC_017058	AT	3	6	1220317	1220322	50 %	50 %	0 %	0 %	383502105
31534	NC_017058	CCT	2	6	1220358	1220363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383502105
31535	NC_017058	CAT	2	6	1220388	1220393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502105
31536	NC_017058	T	7	7	1220407	1220413	0 %	100 %	0 %	0 %	383502105
31537	NC_017058	TCT	2	6	1220420	1220425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502105
31538	NC_017058	AC	3	6	1220448	1220453	50 %	0 %	0 %	50 %	383502105
31539	NC_017058	ATG	2	6	1220499	1220504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383502105
31540	NC_017058	ATT	2	6	1220554	1220559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502105
31541	NC_017058	TATT	2	8	1220565	1220572	25 %	75 %	0 %	0 %	383502105
31542	NC_017058	ACT	2	6	1220582	1220587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502105
31543	NC_017058	CCA	2	6	1220615	1220620	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383502105
31544	NC_017058	A	8	8	1220620	1220627	100 %	0 %	0 %	0 %	383502105
31545	NC_017058	TA	3	6	1220635	1220640	50 %	50 %	0 %	0 %	383502105
31546	NC_017058	AAT	2	6	1220650	1220655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502105
31547	NC_017058	ATC	2	6	1220791	1220796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502105
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31549	NC_017058	T	7	7	1220858	1220864	0 %	100 %	0 %	0 %	383502106
31550	NC_017058	ATT	2	6	1220880	1220885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502106
31551	NC_017058	T	6	6	1220916	1220921	0 %	100 %	0 %	0 %	383502106
31552	NC_017058	TAA	2	6	1220926	1220931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502106
31553	NC_017058	T	6	6	1220932	1220937	0 %	100 %	0 %	0 %	383502106
31554	NC_017058	TCT	2	6	1220942	1220947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502106
31555	NC_017058	GCTT	2	8	1220961	1220968	0 %	50 %	25 %	25 %	383502106
31556	NC_017058	AAT	2	6	1220974	1220979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502106
31557	NC_017058	T	6	6	1220998	1221003	0 %	100 %	0 %	0 %	383502106
31558	NC_017058	TAT	2	6	1221050	1221055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502106
31559	NC_017058	TA	3	6	1221101	1221106	50 %	50 %	0 %	0 %	383502106
31560	NC_017058	A	6	6	1221142	1221147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31561	NC_017058	CTT	2	6	1221155	1221160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31562	NC_017058	TGC	2	6	1221193	1221198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31563	NC_017058	A	6	6	1221201	1221206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31564	NC_017058	T	8	8	1221229	1221236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31565	NC_017058	AT	3	6	1221251	1221256	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31566	NC_017058	AAT	2	6	1221319	1221324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31567	NC_017058	TTG	2	6	1221352	1221357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31568	NC_017058	AT	3	6	1221382	1221387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31569	NC_017058	TTG	2	6	1221408	1221413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31570	NC_017058	CAA	2	6	1221451	1221456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31571	NC_017058	ATA	2	6	1221469	1221474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31572	NC_017058	TAA	3	9	1221496	1221504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31573	NC_017058	AAAAT	2	10	1221540	1221549	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31574	NC_017058	A	8	8	1221613	1221620	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31575	NC_017058	A	6	6	1221655	1221660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31576	NC_017058	ATC	2	6	1221698	1221703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31577	NC_017058	ATG	2	6	1221738	1221743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31578	NC_017058	CAT	2	6	1221761	1221766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31579	NC_017058	CTTTT	2	10	1221775	1221784	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31580	NC_017058	TTA	2	6	1221826	1221831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31581	NC_017058	AT	4	8	1221837	1221844	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31582	NC_017058	AGA	2	6	1221870	1221875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31583	NC_017058	AT	3	6	1221888	1221893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31584	NC_017058	AAT	2	6	1221930	1221935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31585	NC_017058	AAC	2	6	1221965	1221970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31586	NC_017058	ATC	2	6	1222020	1222025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502107
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31589	NC_017058	CTG	2	6	1222059	1222064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383502107
31590	NC_017058	TCA	2	6	1222072	1222077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502107
31591	NC_017058	AACT	2	8	1222091	1222098	50 %	25 %	0 %	25 %	383502107
31592	NC_017058	AAT	2	6	1222165	1222170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502107
31593	NC_017058	CT	3	6	1222325	1222330	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31594	NC_017058	T	6	6	1222407	1222412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31595	NC_017058	CTC	2	6	1222418	1222423	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31596	NC_017058	ATA	2	6	1222542	1222547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31597	NC_017058	AT	3	6	1222556	1222561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31598	NC_017058	AGA	2	6	1222585	1222590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31599	NC_017058	A	7	7	1222681	1222687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31600	NC_017058	TAT	2	6	1222732	1222737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31601	NC_017058	GATA	2	8	1222765	1222772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31602	NC_017058	A	6	6	1222871	1222876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31603	NC_017058	A	6	6	1222883	1222888	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31604	NC_017058	TGG	2	6	1222954	1222959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31605	NC_017058	A	6	6	1223011	1223016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31606	NC_017058	ATT	2	6	1223047	1223052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31607	NC_017058	TAT	2	6	1223095	1223100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31608	NC_017058	GAG	2	6	1223172	1223177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31609	NC_017058	A	7	7	1223194	1223200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31610	NC_017058	AT	4	8	1223220	1223227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31611	NC_017058	ATA	2	6	1223255	1223260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31612	NC_017058	TTC	2	6	1223262	1223267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31613	NC_017058	A	6	6	1223354	1223359	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31614	NC_017058	TTG	2	6	1223468	1223473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31615	NC_017058	TTA	2	6	1223624	1223629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31616	NC_017058	GTAT	2	8	1223702	1223709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31617	NC_017058	TGA	2	6	1223712	1223717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31618	NC_017058	GAA	2	6	1223722	1223727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31619	NC_017058	ATTA	2	8	1223733	1223740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31620	NC_017058	TA	3	6	1223769	1223774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31621	NC_017058	TCA	2	6	1223790	1223795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31622	NC_017058	CAT	2	6	1223802	1223807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31623	NC_017058	TGT	2	6	1223844	1223849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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