MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30002	NC_017058	T	6	6	1163790	1163795	0 %	100 %	0 %	0 %	383502040
30003	NC_017058	CT	3	6	1163797	1163802	0 %	50 %	0 %	50 %	383502040
30004	NC_017058	TAA	2	6	1163861	1163866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502040
30005	NC_017058	TGA	2	6	1163884	1163889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383502040
30006	NC_017058	AATT	2	8	1164011	1164018	50 %	50 %	0 %	0 %	383502040
30007	NC_017058	CTT	3	9	1164023	1164031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502040
30008	NC_017058	TAT	2	6	1164086	1164091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502040
30009	NC_017058	TTA	2	6	1164110	1164115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502040
30010	NC_017058	TCC	2	6	1164154	1164159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383502040
30011	NC_017058	TGT	2	6	1164162	1164167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383502040
30012	NC_017058	TCT	2	6	1164168	1164173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502040
30013	NC_017058	TCT	2	6	1164187	1164192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502040
30014	NC_017058	TCA	2	6	1164194	1164199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502040
30015	NC_017058	AT	3	6	1164200	1164205	50 %	50 %	0 %	0 %	383502040
30016	NC_017058	ATA	2	6	1164235	1164240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502040
30017	NC_017058	ACT	2	6	1164246	1164251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502040
30018	NC_017058	ATA	2	6	1164268	1164273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502040
30019	NC_017058	TGC	2	6	1164288	1164293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383502040
30020	NC_017058	GGAT	3	12	1164315	1164326	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30021	NC_017058	T	6	6	1164342	1164347	0 %	100 %	0 %	0 %	383502041
30022	NC_017058	AAC	2	6	1164391	1164396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383502041
30023	NC_017058	TTA	2	6	1164416	1164421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502041
30024	NC_017058	TCA	2	6	1164437	1164442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502041
30025	NC_017058	TAAGT	2	10	1164514	1164523	40 %	40 %	20 %	0 %	383502041
30026	NC_017058	AAC	2	6	1164556	1164561	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383502041
30027	NC_017058	ATG	2	6	1164571	1164576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383502041
30028	NC_017058	ATT	2	6	1164645	1164650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502042
30029	NC_017058	AATC	2	8	1164704	1164711	50 %	25 %	0 %	25 %	383502042
30030	NC_017058	TAT	2	6	1164906	1164911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502042
30031	NC_017058	CTG	2	6	1165016	1165021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383502042
30032	NC_017058	ATC	2	6	1165062	1165067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502042
30033	NC_017058	ACC	2	6	1165201	1165206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30034	NC_017058	AAAG	2	8	1165214	1165221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30035	NC_017058	TAA	2	6	1165252	1165257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30036	NC_017058	AAT	2	6	1165272	1165277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30037	NC_017058	TAA	2	6	1165287	1165292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30038	NC_017058	ATA	2	6	1165307	1165312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30039	NC_017058	TAA	2	6	1165333	1165338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30040	NC_017058	AGG	2	6	1165359	1165364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30041	NC_017058	GAA	2	6	1165390	1165395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383502043
30042	NC_017058	AAC	2	6	1165403	1165408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383502043
30043	NC_017058	GAA	2	6	1165411	1165416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383502043
30044	NC_017058	A	9	9	1165439	1165447	100 %	0 %	0 %	0 %	383502043
30045	NC_017058	ATT	2	6	1165452	1165457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502043
30046	NC_017058	AAG	2	6	1165517	1165522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383502043
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30049	NC_017058	AT	3	6	1165635	1165640	50 %	50 %	0 %	0 %	383502044
30050	NC_017058	A	8	8	1165671	1165678	100 %	0 %	0 %	0 %	383502044
30051	NC_017058	TCC	2	6	1165722	1165727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383502044
30052	NC_017058	TAA	2	6	1165751	1165756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502044
30053	NC_017058	TAA	2	6	1165785	1165790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502044
30054	NC_017058	CAT	2	6	1165794	1165799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502044
30055	NC_017058	TTA	2	6	1165803	1165808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30056	NC_017058	AT	3	6	1165813	1165818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30057	NC_017058	TAAT	2	8	1165868	1165875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30058	NC_017058	A	6	6	1165891	1165896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30059	NC_017058	A	7	7	1165913	1165919	100 %	0 %	0 %	0 %	383502045
30060	NC_017058	CAA	2	6	1165968	1165973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383502045
30061	NC_017058	AAAAGA	2	12	1165981	1165992	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	383502045
30062	NC_017058	TTA	2	6	1166013	1166018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502045
30063	NC_017058	TAATT	2	10	1166050	1166059	40 %	60 %	0 %	0 %	383502045
30064	NC_017058	TA	4	8	1166120	1166127	50 %	50 %	0 %	0 %	383502046
30065	NC_017058	TATC	2	8	1166129	1166136	25 %	50 %	0 %	25 %	383502046
30066	NC_017058	CA	3	6	1166189	1166194	50 %	0 %	0 %	50 %	383502046
30067	NC_017058	TCA	2	6	1166210	1166215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502046
30068	NC_017058	CAT	2	6	1166220	1166225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502046
30069	NC_017058	AAT	2	6	1166271	1166276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502046
30070	NC_017058	CCA	2	6	1166278	1166283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383502046
30071	NC_017058	GCT	2	6	1166293	1166298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383502046
30072	NC_017058	TAAA	2	8	1166345	1166352	75 %	25 %	0 %	0 %	383502046
30073	NC_017058	CAA	2	6	1166420	1166425	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383502046
30074	NC_017058	CAAG	2	8	1166458	1166465	50 %	0 %	25 %	25 %	383502046
30075	NC_017058	TAT	2	6	1166471	1166476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502046
30076	NC_017058	TAT	2	6	1166480	1166485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502046
30077	NC_017058	TAT	2	6	1166496	1166501	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502046
30078	NC_017058	CAT	2	6	1166559	1166564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502046
30079	NC_017058	GCTA	2	8	1166574	1166581	25 %	25 %	25 %	25 %	383502046
30080	NC_017058	TAAAA	2	10	1166607	1166616	80 %	20 %	0 %	0 %	383502046
30081	NC_017058	AAGA	2	8	1166622	1166629	75 %	0 %	25 %	0 %	383502046
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30083	NC_017058	TCA	2	6	1166701	1166706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502046
30084	NC_017058	TA	3	6	1166749	1166754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30085	NC_017058	CAA	2	6	1166778	1166783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30086	NC_017058	CCAAT	2	10	1166802	1166811	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30087	NC_017058	ATA	2	6	1166852	1166857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30088	NC_017058	CTA	2	6	1166858	1166863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30089	NC_017058	ATA	2	6	1166885	1166890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30090	NC_017058	GA	3	6	1166940	1166945	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30091	NC_017058	AT	3	6	1166965	1166970	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30092	NC_017058	TA	3	6	1166972	1166977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30093	NC_017058	TAA	2	6	1167028	1167033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502047
30094	NC_017058	ACA	2	6	1167074	1167079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383502047
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30096	NC_017058	AAT	2	6	1167116	1167121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502047
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30099	NC_017058	AAT	2	6	1167194	1167199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502047
30100	NC_017058	ATA	2	6	1167212	1167217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502047
30101	NC_017058	TAA	3	9	1167260	1167268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502047
30102	NC_017058	AT	3	6	1167290	1167295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30103	NC_017058	AAAG	2	8	1167299	1167306	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30104	NC_017058	GTA	3	9	1167340	1167348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30105	NC_017058	AAGA	2	8	1167349	1167356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30106	NC_017058	TAT	2	6	1167400	1167405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30107	NC_017058	AG	3	6	1167406	1167411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30108	NC_017058	AAT	2	6	1167427	1167432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30109	NC_017058	T	6	6	1167432	1167437	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30110	NC_017058	AGG	2	6	1167449	1167454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30111	NC_017058	AGT	2	6	1167474	1167479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30112	NC_017058	TGT	2	6	1167543	1167548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30113	NC_017058	T	6	6	1167580	1167585	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30114	NC_017058	A	6	6	1167586	1167591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30115	NC_017058	TTG	2	6	1167626	1167631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30116	NC_017058	CAAT	2	8	1167721	1167728	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
30117	NC_017058	ACA	2	6	1167770	1167775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30118	NC_017058	AAC	2	6	1167790	1167795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30119	NC_017058	TCT	2	6	1167844	1167849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502048
30120	NC_017058	CGC	2	6	1167923	1167928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383502048
30121	NC_017058	TCA	2	6	1168006	1168011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502048
30122	NC_017058	CGA	2	6	1168034	1168039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383502048
30123	NC_017058	TACCGC	2	12	1168076	1168087	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	383502048
30124	NC_017058	CTT	2	6	1168120	1168125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502048
30125	NC_017058	TTC	2	6	1168161	1168166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502048
30126	NC_017058	CTC	2	6	1168230	1168235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383502048
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30128	NC_017058	TCC	2	6	1168342	1168347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383502048
30129	NC_017058	TAA	2	6	1168391	1168396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502048
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30132	NC_017058	TCA	2	6	1168501	1168506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502048
30133	NC_017058	TAA	2	6	1168551	1168556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502048
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30149	NC_017058	ATC	2	6	1169229	1169234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502048
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30151	NC_017058	TAT	2	6	1169334	1169339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502048
30152	NC_017058	TCA	2	6	1169341	1169346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502048
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30155	NC_017058	AT	3	6	1169412	1169417	50 %	50 %	0 %	0 %	383502048
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30180	NC_017058	TTTC	2	8	1170575	1170582	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
30181	NC_017058	T	6	6	1170658	1170663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30182	NC_017058	A	6	6	1170668	1170673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30183	NC_017058	TTTAT	2	10	1170699	1170708	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30186	NC_017058	ATT	2	6	1170815	1170820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30188	NC_017058	CA	3	6	1170889	1170894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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30193	NC_017058	ATT	2	6	1171017	1171022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383502049
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30222	NC_017058	TAA	2	6	1172095	1172100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30223	NC_017058	CTTA	2	8	1172113	1172120	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30224	NC_017058	TTA	3	9	1172118	1172126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30225	NC_017058	T	7	7	1172141	1172147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30226	NC_017058	GTT	2	6	1172181	1172186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30227	NC_017058	T	7	7	1172282	1172288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30228	NC_017058	TAA	2	6	1172341	1172346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30229	NC_017058	TTC	3	9	1172383	1172391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383502051
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30231	NC_017058	TA	3	6	1172464	1172469	50 %	50 %	0 %	0 %	383502051
30232	NC_017058	AAT	2	6	1172485	1172490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502051
30233	NC_017058	ATA	2	6	1172504	1172509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383502051
30234	NC_017058	AGT	2	6	1172536	1172541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383502051
30235	NC_017058	TGG	2	6	1172543	1172548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383502051
30236	NC_017058	CTTG	2	8	1172567	1172574	0 %	50 %	25 %	25 %	383502051
30237	NC_017058	TTG	2	6	1172607	1172612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383502051
30238	NC_017058	TCA	2	6	1172615	1172620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383502051
30239	NC_017058	AT	3	6	1172626	1172631	50 %	50 %	0 %	0 %	383502051
30240	NC_017058	CAC	2	6	1172679	1172684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383502051
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