MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_017058	A	6	6	619073	619078	100 %	0 %	0 %	0 %	383501520
16002	NC_017058	TGCG	2	8	619092	619099	0 %	25 %	50 %	25 %	383501520
16003	NC_017058	TGT	2	6	619165	619170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501520
16004	NC_017058	TGA	2	6	619201	619206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501520
16005	NC_017058	GGGTA	2	10	619219	619228	20 %	20 %	60 %	0 %	383501520
16006	NC_017058	TTG	2	6	619336	619341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16007	NC_017058	A	6	6	619403	619408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16008	NC_017058	T	6	6	619413	619418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16009	NC_017058	ATT	2	6	619442	619447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16010	NC_017058	T	7	7	619446	619452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16011	NC_017058	TTG	2	6	619456	619461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16012	NC_017058	CAA	2	6	619502	619507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16013	NC_017058	CAA	2	6	619544	619549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16014	NC_017058	TAT	2	6	619580	619585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16015	NC_017058	GCA	2	6	619647	619652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16016	NC_017058	ATT	2	6	619687	619692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16017	NC_017058	GAA	2	6	619776	619781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16018	NC_017058	AGA	2	6	619815	619820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16019	NC_017058	TA	5	10	619822	619831	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16020	NC_017058	AT	3	6	619957	619962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16021	NC_017058	AAG	2	6	619965	619970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_017058	ATT	2	6	620055	620060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_017058	T	6	6	620090	620095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16024	NC_017058	AGAA	2	8	620116	620123	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16025	NC_017058	TCA	2	6	620152	620157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16026	NC_017058	T	7	7	620193	620199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16027	NC_017058	A	6	6	620227	620232	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16028	NC_017058	GTA	2	6	620238	620243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16029	NC_017058	AGC	2	6	620245	620250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16030	NC_017058	GT	3	6	620276	620281	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16031	NC_017058	GT	3	6	620332	620337	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16032	NC_017058	TAA	2	6	620368	620373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16033	NC_017058	ATTGA	2	10	620388	620397	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16034	NC_017058	GA	3	6	620396	620401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16035	NC_017058	GAAA	2	8	620413	620420	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16036	NC_017058	GGTT	2	8	620495	620502	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16037	NC_017058	GCGA	2	8	620514	620521	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16038	NC_017058	TAA	2	6	620640	620645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16039	NC_017058	ATT	2	6	620712	620717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16040	NC_017058	ACT	2	6	620740	620745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16041	NC_017058	GAA	2	6	620747	620752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16042	NC_017058	A	6	6	620758	620763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16043	NC_017058	A	6	6	620803	620808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16044	NC_017058	AGAA	2	8	620811	620818	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16045	NC_017058	A	6	6	620856	620861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16046	NC_017058	AAG	2	6	620877	620882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16047	NC_017058	TTA	2	6	620889	620894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16048	NC_017058	TTG	2	6	620900	620905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16049	NC_017058	T	7	7	620969	620975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16050	NC_017058	TAAA	2	8	620987	620994	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16051	NC_017058	ATG	2	6	621001	621006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16052	NC_017058	ATAGT	2	10	621050	621059	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16053	NC_017058	AAG	2	6	621110	621115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16054	NC_017058	TC	3	6	621119	621124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16055	NC_017058	TAA	2	6	621138	621143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16056	NC_017058	TAAA	2	8	621150	621157	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16057	NC_017058	ACAA	2	8	621160	621167	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
16058	NC_017058	CTA	2	6	621171	621176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16059	NC_017058	ATT	2	6	621181	621186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16060	NC_017058	AAT	2	6	621200	621205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16061	NC_017058	GAA	2	6	621233	621238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16062	NC_017058	ACT	2	6	621281	621286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16063	NC_017058	GAT	2	6	621527	621532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501521
16064	NC_017058	TTA	2	6	621548	621553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501521
16065	NC_017058	TA	3	6	621607	621612	50 %	50 %	0 %	0 %	383501521
16066	NC_017058	GGTGAA	2	12	621662	621673	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	383501521
16067	NC_017058	TAA	2	6	621674	621679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501521
16068	NC_017058	GAA	2	6	621682	621687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16069	NC_017058	CTAAAG	2	12	621787	621798	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	383501522
16070	NC_017058	TGC	2	6	621890	621895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501522
16071	NC_017058	GCT	2	6	621912	621917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501522
16072	NC_017058	AT	3	6	622012	622017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16073	NC_017058	TA	3	6	622022	622027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16074	NC_017058	CCA	2	6	622100	622105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16075	NC_017058	ATC	2	6	622222	622227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16076	NC_017058	AACT	2	8	622233	622240	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
16077	NC_017058	CTT	2	6	622248	622253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16078	NC_017058	TTTA	2	8	622271	622278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16079	NC_017058	TTAA	2	8	622284	622291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16080	NC_017058	CTA	2	6	622296	622301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16081	NC_017058	AG	3	6	622421	622426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_017058	AATT	2	8	622453	622460	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16083	NC_017058	ACA	2	6	622472	622477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16084	NC_017058	AGC	2	6	622506	622511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16085	NC_017058	ATT	2	6	622516	622521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16086	NC_017058	TAAA	2	8	622648	622655	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16087	NC_017058	AGC	2	6	622724	622729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16088	NC_017058	AAT	2	6	622755	622760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_017058	GA	3	6	622782	622787	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_017058	T	6	6	622814	622819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16091	NC_017058	ATT	2	6	622840	622845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16092	NC_017058	TAC	2	6	622850	622855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16093	NC_017058	GAA	2	6	622902	622907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16094	NC_017058	ATT	2	6	622917	622922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16095	NC_017058	AAT	2	6	622945	622950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16096	NC_017058	TTAA	2	8	622962	622969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16097	NC_017058	TAG	2	6	623016	623021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16098	NC_017058	ATT	2	6	623064	623069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501523
16099	NC_017058	TTTC	2	8	623098	623105	0 %	75 %	0 %	25 %	383501523
16100	NC_017058	GTAA	2	8	623117	623124	50 %	25 %	25 %	0 %	383501523
16101	NC_017058	TAA	2	6	623169	623174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501523
16102	NC_017058	ATA	2	6	623231	623236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501523
16103	NC_017058	ACG	2	6	623286	623291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16104	NC_017058	AGATGA	2	12	623305	623316	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16105	NC_017058	TATTG	2	10	623354	623363	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16106	NC_017058	TA	3	6	623381	623386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16107	NC_017058	A	6	6	623414	623419	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16108	NC_017058	AGC	2	6	623502	623507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16109	NC_017058	AAT	2	6	623517	623522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16110	NC_017058	TAAA	2	8	623523	623530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16111	NC_017058	A	6	6	623538	623543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16112	NC_017058	A	6	6	623558	623563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16113	NC_017058	AAT	3	9	623585	623593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_017058	AGC	2	6	623641	623646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16115	NC_017058	TAG	2	6	623656	623661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16116	NC_017058	AAAT	2	8	623680	623687	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_017058	ATC	2	6	623724	623729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16118	NC_017058	TGT	2	6	623787	623792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16119	NC_017058	A	7	7	623798	623804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_017058	CCA	2	6	623843	623848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16121	NC_017058	TTTA	2	8	623872	623879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_017058	ATA	2	6	623889	623894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16123	NC_017058	ATT	2	6	623906	623911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16124	NC_017058	TA	3	6	623961	623966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_017058	ATAAA	2	10	623979	623988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_017058	TAAAA	2	10	624014	624023	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16127	NC_017058	AAAT	2	8	624026	624033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16128	NC_017058	AT	3	6	624123	624128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16129	NC_017058	A	7	7	624153	624159	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16130	NC_017058	TAGAAC	2	12	624206	624217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
16131	NC_017058	A	6	6	624267	624272	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16132	NC_017058	ATG	2	6	624296	624301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16133	NC_017058	ATA	2	6	624353	624358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16258	NC_017058	A	6	6	628961	628966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16259	NC_017058	TCTAAT	2	12	628983	628994	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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16261	NC_017058	TA	3	6	629035	629040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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