MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_017058	TAT	2	6	521299	521304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_017058	A	6	6	521306	521311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13503	NC_017058	AT	3	6	521315	521320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13504	NC_017058	TTAT	2	8	521337	521344	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_017058	TAA	2	6	521385	521390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501433
13506	NC_017058	AAG	2	6	521456	521461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501433
13507	NC_017058	TAG	2	6	521466	521471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501433
13508	NC_017058	A	6	6	521489	521494	100 %	0 %	0 %	0 %	383501433
13509	NC_017058	GAA	2	6	521509	521514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501433
13510	NC_017058	T	9	9	521524	521532	0 %	100 %	0 %	0 %	383501433
13511	NC_017058	AAT	2	6	521541	521546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501433
13512	NC_017058	AGA	2	6	521565	521570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501433
13513	NC_017058	TA	3	6	521576	521581	50 %	50 %	0 %	0 %	383501433
13514	NC_017058	TAATT	2	10	521584	521593	40 %	60 %	0 %	0 %	383501433
13515	NC_017058	TA	3	6	521594	521599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13516	NC_017058	AAT	3	9	521633	521641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501434
13517	NC_017058	TAA	2	6	521696	521701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501434
13518	NC_017058	ATT	2	6	521730	521735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13519	NC_017058	TAAA	2	8	521747	521754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13520	NC_017058	GAA	2	6	521793	521798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13521	NC_017058	AT	3	6	521801	521806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13522	NC_017058	GAA	2	6	521883	521888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13523	NC_017058	TAT	2	6	521935	521940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_017058	AGTGCT	2	12	522036	522047	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13525	NC_017058	A	6	6	522050	522055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13526	NC_017058	AAT	2	6	522067	522072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13527	NC_017058	TAC	2	6	522129	522134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13528	NC_017058	A	6	6	522182	522187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13529	NC_017058	TCT	2	6	522201	522206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_017058	T	6	6	522236	522241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13531	NC_017058	CAA	2	6	522301	522306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501435
13532	NC_017058	AGT	2	6	522326	522331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501435
13533	NC_017058	AGC	2	6	522335	522340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501435
13534	NC_017058	TGC	2	6	522516	522521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13535	NC_017058	GAC	2	6	522541	522546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13536	NC_017058	ACG	2	6	522629	522634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13537	NC_017058	TAA	2	6	522660	522665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13538	NC_017058	TAT	2	6	522686	522691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13539	NC_017058	ATA	2	6	522707	522712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13540	NC_017058	TAAAA	2	10	522728	522737	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13541	NC_017058	AAAAAG	2	12	522745	522756	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13542	NC_017058	AAG	2	6	522761	522766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_017058	GAAA	2	8	522793	522800	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_017058	TAAG	2	8	522808	522815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13545	NC_017058	A	6	6	522856	522861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13546	NC_017058	ATA	2	6	522871	522876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13547	NC_017058	T	7	7	522909	522915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13548	NC_017058	TTTG	2	8	522919	522926	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_017058	T	6	6	522940	522945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_017058	CTT	2	6	523035	523040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501436
13551	NC_017058	GTT	2	6	523052	523057	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501436
13552	NC_017058	TAT	2	6	523153	523158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501436
13553	NC_017058	GAA	2	6	523178	523183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501436
13554	NC_017058	GTAAA	2	10	523281	523290	60 %	20 %	20 %	0 %	383501436
13555	NC_017058	GTAA	2	8	523313	523320	50 %	25 %	25 %	0 %	383501436
13556	NC_017058	TAA	2	6	523341	523346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501436
13557	NC_017058	AT	3	6	523353	523358	50 %	50 %	0 %	0 %	383501436
13558	NC_017058	TTC	2	6	523426	523431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501436
13559	NC_017058	A	7	7	523435	523441	100 %	0 %	0 %	0 %	383501436
13560	NC_017058	TAA	2	6	523449	523454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501436
13561	NC_017058	AAG	2	6	523509	523514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501436
13562	NC_017058	TAAT	2	8	523521	523528	50 %	50 %	0 %	0 %	383501436
13563	NC_017058	T	6	6	523571	523576	0 %	100 %	0 %	0 %	383501436
13564	NC_017058	TCA	2	6	523619	523624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501436
13565	NC_017058	GAT	2	6	523626	523631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501436
13566	NC_017058	AGT	2	6	523642	523647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501436
13567	NC_017058	AT	4	8	523656	523663	50 %	50 %	0 %	0 %	383501436
13568	NC_017058	TGC	2	6	523664	523669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501436
13569	NC_017058	TTA	2	6	523672	523677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13570	NC_017058	AGC	2	6	523684	523689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13571	NC_017058	TTG	2	6	523691	523696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13572	NC_017058	AAT	2	6	523781	523786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13573	NC_017058	A	6	6	523885	523890	100 %	0 %	0 %	0 %	383501437
13574	NC_017058	AAT	2	6	523897	523902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501437
13575	NC_017058	TA	4	8	524032	524039	50 %	50 %	0 %	0 %	383501437
13576	NC_017058	AAT	2	6	524074	524079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501437
13577	NC_017058	AAGGA	2	10	524110	524119	60 %	0 %	40 %	0 %	383501437
13578	NC_017058	ATA	2	6	524120	524125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501437
13579	NC_017058	TAA	2	6	524195	524200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501437
13580	NC_017058	ATA	3	9	524205	524213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501437
13581	NC_017058	ATT	2	6	524254	524259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501437
13582	NC_017058	ATA	2	6	524268	524273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501437
13583	NC_017058	TCGG	2	8	524286	524293	0 %	25 %	50 %	25 %	383501437
13584	NC_017058	TAA	2	6	524305	524310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501437
13585	NC_017058	AAT	2	6	524326	524331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501437
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13587	NC_017058	TAA	2	6	524403	524408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501437
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13589	NC_017058	AAAT	2	8	524516	524523	75 %	25 %	0 %	0 %	383501437
13590	NC_017058	AAT	2	6	524559	524564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501437
13591	NC_017058	ATT	2	6	524581	524586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501437
13592	NC_017058	ATTT	2	8	524685	524692	25 %	75 %	0 %	0 %	383501437
13593	NC_017058	CAG	2	6	524724	524729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501437
13594	NC_017058	GTA	2	6	524733	524738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501437
13595	NC_017058	A	6	6	524761	524766	100 %	0 %	0 %	0 %	383501437
13596	NC_017058	A	7	7	524816	524822	100 %	0 %	0 %	0 %	383501437
13597	NC_017058	ATT	2	6	524851	524856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13598	NC_017058	T	6	6	524855	524860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13599	NC_017058	GCA	2	6	524919	524924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13600	NC_017058	T	6	6	525002	525007	0 %	100 %	0 %	0 %	383501438
13601	NC_017058	AGC	2	6	525033	525038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501438
13602	NC_017058	TAA	2	6	525073	525078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501438
13603	NC_017058	TTC	2	6	525167	525172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501438
13604	NC_017058	ATG	2	6	525176	525181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501438
13605	NC_017058	AAT	2	6	525230	525235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501438
13606	NC_017058	CAG	2	6	525391	525396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501438
13607	NC_017058	ATT	2	6	525506	525511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501438
13608	NC_017058	TAT	2	6	525517	525522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501438
13609	NC_017058	ATT	2	6	525533	525538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13610	NC_017058	TTTATA	2	12	525542	525553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13611	NC_017058	T	6	6	525557	525562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13612	NC_017058	AT	4	8	525571	525578	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13613	NC_017058	T	6	6	525587	525592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13614	NC_017058	TAC	2	6	525632	525637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13615	NC_017058	ATTAT	2	10	525661	525670	40 %	60 %	0 %	0 %	383501439
13616	NC_017058	GAA	2	6	525682	525687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501439
13617	NC_017058	TTA	2	6	525730	525735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501439
13618	NC_017058	TTA	2	6	525754	525759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501439
13619	NC_017058	CATGT	2	10	525774	525783	20 %	40 %	20 %	20 %	383501439
13620	NC_017058	ACC	2	6	525809	525814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383501439
13621	NC_017058	AGC	2	6	525899	525904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501439
13622	NC_017058	GAA	2	6	525922	525927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501439
13623	NC_017058	GAA	2	6	525952	525957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501439
13624	NC_017058	GAA	2	6	525980	525985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501439
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