MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia australis str. Cutlack chromosome

Total Repeats: 33435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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11002	NC_017058	TAA	2	6	428237	428242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501333
11003	NC_017058	GCA	2	6	428257	428262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501333
11004	NC_017058	ACA	2	6	428329	428334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501333
11005	NC_017058	TAA	2	6	428364	428369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501333
11006	NC_017058	TCT	2	6	428370	428375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501333
11007	NC_017058	TTG	2	6	428408	428413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501333
11008	NC_017058	TAC	2	6	428421	428426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501333
11009	NC_017058	CTG	2	6	428534	428539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501333
11010	NC_017058	TGC	2	6	428580	428585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501333
11011	NC_017058	ACC	2	6	428692	428697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383501333
11012	NC_017058	GCTA	2	8	428721	428728	25 %	25 %	25 %	25 %	383501333
11013	NC_017058	TGC	2	6	428748	428753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501333
11014	NC_017058	TC	3	6	428831	428836	0 %	50 %	0 %	50 %	383501333
11015	NC_017058	CAG	2	6	428848	428853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501333
11016	NC_017058	TAA	2	6	428859	428864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501333
11017	NC_017058	CTT	2	6	428865	428870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501333
11018	NC_017058	GAA	2	6	428907	428912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501333
11019	NC_017058	CTT	2	6	428928	428933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501333
11020	NC_017058	TGC	2	6	428964	428969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501333
11021	NC_017058	GGT	2	6	428995	429000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383501333
11022	NC_017058	GT	3	6	429038	429043	0 %	50 %	50 %	0 %	383501333
11023	NC_017058	TCT	2	6	429079	429084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501333
11024	NC_017058	ACA	2	6	429109	429114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383501333
11025	NC_017058	CAAG	2	8	429123	429130	50 %	0 %	25 %	25 %	383501333
11026	NC_017058	TAG	2	6	429164	429169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501333
11027	NC_017058	GGT	2	6	429184	429189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383501333
11028	NC_017058	CTCAGT	2	12	429272	429283	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	383501333
11029	NC_017058	TCA	2	6	429305	429310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501333
11030	NC_017058	ATG	2	6	429401	429406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501333
11031	NC_017058	CT	3	6	429510	429515	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11032	NC_017058	A	6	6	429519	429524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_017058	T	7	7	429531	429537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_017058	T	6	6	429539	429544	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_017058	TTG	2	6	429562	429567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_017058	GAG	2	6	429591	429596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_017058	A	6	6	429619	429624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_017058	A	6	6	429630	429635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_017058	T	6	6	429652	429657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11040	NC_017058	TCG	2	6	429669	429674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11041	NC_017058	TAC	2	6	429678	429683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11042	NC_017058	TCT	2	6	429689	429694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_017058	CAA	2	6	429721	429726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11044	NC_017058	ATC	2	6	429744	429749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_017058	T	6	6	429789	429794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11046	NC_017058	ATA	2	6	429812	429817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11047	NC_017058	AATTT	2	10	429836	429845	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11048	NC_017058	A	6	6	429860	429865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11049	NC_017058	TAT	2	6	429866	429871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11050	NC_017058	ATT	2	6	429879	429884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11051	NC_017058	TAA	2	6	429892	429897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11052	NC_017058	GTA	2	6	430021	430026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11053	NC_017058	ATTG	2	8	430113	430120	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_017058	AGC	2	6	430135	430140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_017058	GTT	2	6	430258	430263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11056	NC_017058	TTA	2	6	430311	430316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11057	NC_017058	GAT	2	6	430355	430360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11058	NC_017058	ATT	2	6	430363	430368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_017058	A	6	6	430423	430428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_017058	TAA	2	6	430455	430460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11061	NC_017058	T	6	6	430462	430467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_017058	AAAAGA	2	12	430556	430567	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_017058	ATAA	2	8	430654	430661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_017058	ATT	2	6	430680	430685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11065	NC_017058	GAT	2	6	430720	430725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11066	NC_017058	ATG	2	6	430799	430804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11067	NC_017058	A	6	6	430813	430818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11068	NC_017058	AAAT	2	8	430825	430832	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11069	NC_017058	CTA	2	6	430870	430875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11070	NC_017058	ATA	2	6	430945	430950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11071	NC_017058	A	6	6	430964	430969	100 %	0 %	0 %	0 %	383501334
11072	NC_017058	AT	3	6	430984	430989	50 %	50 %	0 %	0 %	383501334
11073	NC_017058	TTA	2	6	431008	431013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501334
11074	NC_017058	TTC	2	6	431028	431033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383501334
11075	NC_017058	TA	3	6	431039	431044	50 %	50 %	0 %	0 %	383501334
11076	NC_017058	TAAATT	2	12	431091	431102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11077	NC_017058	AAT	2	6	431113	431118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501335
11078	NC_017058	GAA	2	6	431119	431124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501335
11079	NC_017058	TGC	2	6	431136	431141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501335
11080	NC_017058	TAT	2	6	431164	431169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501335
11081	NC_017058	A	6	6	431188	431193	100 %	0 %	0 %	0 %	383501335
11082	NC_017058	AAT	2	6	431201	431206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501335
11083	NC_017058	TGA	2	6	431230	431235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501336
11084	NC_017058	ATG	2	6	431247	431252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501336
11085	NC_017058	ATGTA	2	10	431260	431269	40 %	40 %	20 %	0 %	383501336
11086	NC_017058	TTCGG	2	10	431273	431282	0 %	40 %	40 %	20 %	383501336
11087	NC_017058	AGG	2	6	431313	431318	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383501336
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11089	NC_017058	AGA	2	6	431341	431346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501336
11090	NC_017058	TAG	2	6	431364	431369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501336
11091	NC_017058	TA	3	6	431389	431394	50 %	50 %	0 %	0 %	383501336
11092	NC_017058	GAG	2	6	431507	431512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11093	NC_017058	A	6	6	431518	431523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11094	NC_017058	GA	3	6	431599	431604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11095	NC_017058	ATT	2	6	431760	431765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383501337
11096	NC_017058	AGTT	2	8	431830	431837	25 %	50 %	25 %	0 %	383501338
11097	NC_017058	TGA	2	6	431851	431856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501338
11098	NC_017058	CAG	2	6	431864	431869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383501338
11099	NC_017058	TGA	2	6	431875	431880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501338
11100	NC_017058	AAG	2	6	431883	431888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501338
11101	NC_017058	ATG	2	6	431901	431906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501338
11102	NC_017058	GTT	2	6	431959	431964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_017058	GAA	2	6	431997	432002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383501339
11104	NC_017058	TGA	2	6	432004	432009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383501339
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11106	NC_017058	AAT	2	6	432095	432100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501339
11107	NC_017058	CTTT	2	8	432122	432129	0 %	75 %	0 %	25 %	383501339
11108	NC_017058	A	6	6	432163	432168	100 %	0 %	0 %	0 %	383501340
11109	NC_017058	A	6	6	432258	432263	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11110	NC_017058	TAA	2	6	432299	432304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11111	NC_017058	TTA	2	6	432310	432315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11112	NC_017058	TA	3	6	432314	432319	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11113	NC_017058	TTG	2	6	432346	432351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383501341
11114	NC_017058	CTG	2	6	432412	432417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383501341
11115	NC_017058	AT	4	8	432421	432428	50 %	50 %	0 %	0 %	383501341
11116	NC_017058	AGT	2	6	432496	432501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11117	NC_017058	TAA	2	6	432540	432545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11118	NC_017058	TGA	2	6	432606	432611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11119	NC_017058	TTAG	2	8	432618	432625	25 %	50 %	25 %	0 %	383501342
11120	NC_017058	A	7	7	432648	432654	100 %	0 %	0 %	0 %	383501342
11121	NC_017058	AAT	2	6	432669	432674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383501342
11122	NC_017058	TCA	2	6	432692	432697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383501342
11123	NC_017058	AT	3	6	432708	432713	50 %	50 %	0 %	0 %	383501342
11124	NC_017058	TAAG	2	8	432771	432778	50 %	25 %	25 %	0 %	383501342
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11126	NC_017058	TA	3	6	432816	432821	50 %	50 %	0 %	0 %	383501342
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